細胞性粘菌の多細胞体制形成に関わる遺伝子ネットワークの解明

阐明盘基网柄菌中参与多细胞系统形成的基因网络

• 批准号: 00J60301
• 负责人: 加藤 磨理子
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 2002
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-00J60301/
• 关键词: 細胞分化; パターン形成; マイクロアレイ解析; ゲノムサイエンス

細胞性粘菌のcDNAプロジェクト、及び、ゲノムプロジェクトより得られた約8,000クローンを用いてマイクロアレイを作製し、多細胞体形成時における遺伝子発現の時間的変動を調べ、それぞれの発現パターンを各時間または各遺伝子でクラスタリング解析を行なった結果、集合期を境に発現パターンが大きく変化することが明らかになった。これらの結果と細胞型特異的な発現パターンとを論文としてまとめ、Developmentに掲載された(Baylor College of Medicineとの共同研究)。さらに詳しく多細胞体制形成機構を調べるために、発生ステージの異なる3種類の多細胞体を分散し、栄養培地中で培養する際の、細胞が脱分化する過程について、マイクロアレイを用いて発現のプロファイリングを行った。これらのクラスタリング解析から、脱分化の過程は三層に分けて考えることが可能であり、脱分化過程は単純に発生過程を逆戻りしているのではないことを明らかにした。また、どの発生ステージから分散させた場合においても、273遺伝子で脱分化の時期に発現が上昇していることが明らかとなり、これらの分子が脱分化過程に関連がある可能性が示唆された。さらに、これらの分子の一つであるHistidine kinaseの遺伝子破壊株を用いて脱分化実験を行なったところ、細胞増殖が開始されるまでの時間が、野生株に較べて非常に長くかかることが明かとなり、この遺伝子の発現は脱分化過程を正常に進行させるのに必要であると考えられた。これらの実験の一方、筑波大でのマイクロアレイ解析システムの確立を行なった。さらに、この系を用いて、cDNAプロジェクトで作製された転写因子候補破壊株と野生株との発現プロファイルを比較し、発現が変化する遺伝子の選び出しを行なっている。これらのデータを基に、多細胞体成形に関わる遺伝子ネットワークの解明を行なうことが可能となると思われる。

Cellular slime mold cDNA プロジェクト、和び、ゲノムプロジェクトより得られたabout 8,0 00クローンを用いてマイクロアレイを出用し、When the multicellular body is formed and when the remaining そ子発 appears The change of time, the change of time, the time of each time, the time of each time, and the solution of each time. Analysis of the result of the action, the collection period of the situation, the appearance of the situation, and the result of the collection period.これらのRESULTS: Cell-type-specific な発成パターンとをPaper としてまとめ, Development に掲zaiされた (jointly researched by Baylor College of Medicine との).さらに detailしくmulticellular body forming mechanismを动べるために、発生ステージのdifferentなる3 kinds of multicellular bodyをdispersionし、栄nurturing ground In the process of culture and dedifferentiation, the process of cell dedifferentiation and the process of dedifferentiation are used.これらのクラスタリングanalyticsから、dedifferentiation processは三级に分けて考えることがpossibleであり, dedifferentiation process は単pure に発生 Process を inverse 戻りしているのではないことを明らかにした.また、どの発生ステージからDispersion させたoccasionにおいても、273 缝子で出differentiation period に発appearがThe rise of していることが明らかとなり, これらのmolecules がdedifferentiation process にrelated があるpossibility がshows instigation された. Histidine kinaseの遺伝子破壊株を用いて脱分化実験を行なったところ、細胞増殖が開始されるまでの時間が、野生株に較べてvery long, long, long, bright The dedifferentiation process is carried out normally and it is necessary to perform the dedifferentiation process.これらの実験の Party, Tsukuba Daiでのマイクロアレイanalytics システムのEstablishment を行なった.さらに, この线を用いて, cDNAプロジェクトでproduced by された転WRITING FACTOR CANDIDATE KOHIZHAN TONO The raw plant is the same as the original one, and the original one is the selected one.これらのデータとに、Multi-cell body forming に关わる伝子ネットワークの解明を行なうことがpossible となると思われる.

项目成果

Nancy Van Driessche et al.: "A Transcriptional Profile of Multicelullar Development in Dictyostelium discoideum"Development. 129. 1543-1552 (2002)

Nancy Van Driessche 等人：“盘基网柄菌多细胞发育的转录概况”开发。

Hidekazu Kuwayama et al.: "A novel PCR-mediated method for one tube generation of a gene disruption construct"Biotechnology Letters. 24. 1307-1312 (2002)

Hidekazu Kuwayama 等人：“一种新型 PCR 介导的基因破坏构建体单管生成方法”《生物技术快报》。

Tsuyoshi Araki et al.: "A stat regulated, stress-induced signalling pathway in Dictyostelium"Journal Cell Science. (発表予定).

Tsuyoshi Araki 等人：“盘基网柄菌中的统计调节、应激诱导信号通路”《细胞科学》杂志（待出版）。