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遺伝子発現制御ネットワークの情報科学的解析

基因表达控制网络的信息学分析

基本信息

批准号：
12206076
负责人：
冨田勝
金额：
--
依托单位：
Keio University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

プロテオーム解析などで各遺伝子の機能が網羅的に明らかになりつつある。それに伴い、各遺伝子がいつどのように発現するかという遺伝子発現制御システムの解析は、生命のダイナミックな振る舞いを解明する上で極めて重要な研究課題である。本研究では、情報科学的手法を駆使してこの問題をミクロ的におよびマクロ的にアプローチしている。ミクロ的アプローチとしては、配列情報に基づいて各遺伝子の発現制御を推測する。遺伝子発現制御というと転写因子による制御が有名であるが、それ以外にも多くの制御が関与している。本研究では以下に示した制御をコンプリートゲノムの配列から情報科学的な解析を試みる。(1)転写終結部位(2)翻訳開始開始(3)翻訳終結部位(4)選択的スプライシング(5)コドン使用の偏りマクロ的アプローチとしては、遺伝子発現によって制御されている系全体の振る舞いを、コンピュータシミュレーションによって解析する。これまでに我々は、細胞代謝の振る舞いを統合的にシミュレートするためのソフトウェア「E-CELL」を開発してきた。本研究ではまず、実験データが豊富に揃っている以下の2つの系をモデル化することによって、遺伝子発現系仮想実験のための基盤技術を確立することを目的とする。(1)λファージのライフサイクル(2)大腸菌lacオペロン

The function of each document is to collect the information of each document. It is an important research topic to analyze the mechanism of gene development and explain the vibration of life. In this research, the approach of information science enables us to address these issues both in a holistic and holistic manner. The information in the database is based on the prediction of the occurrence of each gene. The author of this article is interested in the following topics: This study is aimed at the following aspects: control, allocation, and analysis of information science. (1)End of translation (2) Start of translation (3) End of translation (4) Selection of translation (5) Selection of translation (5) Selection of translation (6) Selection of translation (7) Selection of translation (8) Selection of translation (9) Selection of translation ( This is the first time that we have developed an "E-CELL" system that integrates cellular metabolism. This study aims to establish the following two systems for the development of high quality and high quality optical fiber. (1)λ (2) Enterobacter lac