权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

メタボローム解析のための計測技術開発とそれを用いた代謝経路推定

开发用于代谢组分析和代谢途径估计的测量技术

基本信息

批准号：
17017035
负责人：
冨田勝
金额：
$ 3.2万
依托单位：
Keio University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

CE-MSにより,枯草菌中から1,692の代謝物質の検出に成功したが、成分名を同定した物質は10%にすぎなかった。原因は代謝標準物質が入手できないからである。本年度は、大腸菌から検出された未知物質の同定法を開発した。まず1)CE-TOFMSで得られた精密質量(ミリマス)から組成式候補を決定する方法を開発した。2)次に開発したCE-Q-TOFMSで得られたMS/MSスペクトルから構造式を推定する方法も検討した。すでに500以上の標準物質についてのMS/MSスペクトルを採取しており、MSで各物質が断片化されるメカニズムや法則性の解明に着手した。これによって,MS/MSスペクトルに出現したピークの化学組成式を10ppmの誤差でほぼ一義的に決定することが可能になった.これらの測定に基づいて,約68MS/MSスペクトルについて開裂機構(スキーム)を作成し,化学構造式と開裂機構に関する経験則を導いた.また,ESI/MSデータベース作成の一環として,MS/MSピーク値をExel形式に変換し,ピークの差分で簡易検索するためのツールを作成した.これは,例えば,アンモニアが中性分子として脱離する化学構造式を網羅的に検索することができ,化学構造とスペクトルとの関係を調べるのには極めて有用である,と期待される.さらに3)CE-MSで実測された物質の検出時間データを用い、人工知能技術(ニューラルネットワーク)を用いてCE-MSの検出時間を予想する方法を学習させ、KEGGにある10,500化合物のCE-MSの検出時間を予想した。今後、上記の三種類の方法で得られた組成式、構造式、検出時間情報に基づき、KEGGデータベースにある化合物から未知物質を特定し、それを代謝経路にマzツプし、代謝経路を推定する予定である。

CE-MS spores were isolated from Bacillus subtilis, and the ingredients were identified by the same name, 10%, 10%, 10%, 10% and 10% respectively. The reason is to replace the standard object and start with the standard object. This year, the standard method for the release of unknown substances is the same as that for this year. (1) the CE-TOFMS can determine the accuracy of the precision measurement system. 2) the method of presumption of CE-Q-TOFMS is not feasible after several times of opening the MS/MS. The standard object is different from that of MS/MS. The data of each item is fragmented and MS is divided into fragments. In this case, MS/MS has found that the chemical composition formula "10ppm" may have a significant impact on the meaning of the chemical formula. After the determination of the basic mechanical properties, the 68MS/MS system and the chemical cracking mechanism were established and analyzed. This is the first time that ESI/MS has been made, while that of MS/MS has been made in the form of Exel, and the difference has been changed. In this case, the neutral molecule is isolated from the chemical network, and the chemical system is used in the chemical construction network. in this way, the neutral molecules are isolated from the chemical network. (3) CE-MS equipment tests show that the time is not available for use, artificial knowledge technology (artificial knowledge technology) uses CE-MS to test the method of testing, and KEGG uses 10500 compounds to test the time of CE-MS. In the future, three kinds of methods have been used to obtain the formula, the formula, the data base, the KEGG model, the formula, the formula, the formula