凝縮相および生体内における電子・水素移動の協同現象に対する理論的研究
凝縮相および生体内における電子・水素移動の協同現象に対する理論的研究
批准号:
01J05042
负责人:
重田 育照
金额:
$2.3万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2003
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動的な閉じ込め効果が重要な系として、フラーレン内に水素分子とBe原子が内包されている系の理論計算を行った。特に、C_<60>内でのBe原子の動的な振る舞いを調べるため、有効電荷の時間変化を半経験的QM/MM分子動力学法により解析し、温度と有効電荷や内部運動の関係を明らかにした。内包水素分子数がn=2の場合には全ての温度領域において電荷揺らぎが非常に大きく、さらに温度を変化させることによって、その分布が著しく変化することを数値的に明らかにした。また、低温100Kに比べて高温200〜300Kでは、電荷分布のピーク位置が負の方へ大きくシフトしている。この2つの差異を調べるためトラジェクトリーを解析すると、大きな電荷揺らぎの原因はBeとC_<60>の中心方向を結ぶ運動に起因し、温度変化によるピーク位置の負の方向へのシフトは隣の6員環への遷移によるものであることが判明した。マロンアルデヒドは分子内水素結合を有する非常に有名な分子である。この分子はまた光吸収によって、3つの結合に関してcis-trans異性化反応を起こす。とくに、希ガスマトリックス中において、マロンアルデヒドに紫外線を照射すると、4つの異性体へと特異的に異性化することが知られている。この異性化反応生成物の収量は不活性の希ガスの種類に大きく依存し、溶媒効果の効く系であるといえる。そこで、凝縮相中での反応前段階の吸収波長を調べるためにQM/MM法を用いた励起状態計算法を開発した。8種類の異性体に対して孤立分子、無極性の四塩化炭素中での基底状態の構造、励起エネルギーを評価した。無極性溶媒中では構造変化、並びに励起エネルギーがほとんど変化しないことから、この反応収率の変化は励起後の動的な過程によって記述されることが推察される。現在、励起状態ダイナミクスのプログラムを作成中である。
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Yasuteru Shigeta: "Models for double proton and electron transfer reactions : analyses by means of quantum dynamics"Journal of Moleculer Structure. 615. 267-273 (2002)
Yasuteru Shigeta:“双质子和电子转移反应模型:通过量子动力学进行分析”分子结构杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Y.Shigeta: "Optimized effective potential method at finite temperature : an application to superconductivity"International Journal of Quantum Chemistry. (in press).
Y.Shigeta:“有限温度下的优化有效势法:超导性的应用”国际量子化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Y.Shigeta, H.Saito: "QM/MM molecular dynamics study on dynamical change in effective charge of Be atom in (Be+nH_2)@C_<60>"Synthetic Metals. 135-136. 765 (2003)
Y.Shigeta、H.Saito:“(Be nH_2)@C_<60> 中 Be 原子有效电荷动态变化的 QM/MM 分子动力学研究”合成金属。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Y.Shigeta: "Hybrid QM/MM Studies on Energetics of Malonaldehyde in Condensed Phase"International Journal of Quantum Chemistry. 96. 32 (2004)
Y.Shigeta:“凝聚相丙二醛能量学的混合 QM/MM 研究”国际量子化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
電子ダイナミクスによる電子集団運動の解析
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批准号:20038008
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.66万
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财政年份:2008
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负责人:重田 育照
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依托单位:
電子-核密度汎関数理論の構築と量子ダイナミクスへの展開
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批准号:99J02225
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1999
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负责人:重田 育照
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依托单位:
国内基金
海外基金
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基于QM/MM的计算机辅助药物设计方法对去泛素化酶(DUBs)共价小分子抑制剂的设计与研究
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批准号:82304385
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2023
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负责人:关良宇
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依托单位:
基于新型分子伴侣Spy与聚集诱导发光探针 QM-FN-SO3的蛋白质稳定化技术开发与应用
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2023
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负责人:何为
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依托单位:
酶催化高毒有机磷化合物降解机制与活性调控的QM/MM多尺度模拟研究
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批准号:22373078
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:曹泽星
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依托单位:
非正交定域分子轨道基的自洽QM/EC方法研究静电极化效应对非线性光学性质的影响
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批准号:--
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2022
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负责人:李波
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依托单位:
极化植入QM/MM模拟研究液相长链DNA的过电子附着
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:60万元
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批准年份:2021
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负责人:张岩
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依托单位:
基于QM/MM方法研究溶剂对钯催化环加成反应选择性影响的机制
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批准号:22103060
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2021
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负责人:马鹏琛
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依托单位:
新型机械力化学反应和力敏团的QM/MM动力学研究
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批准号:2020A1515010985
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2020
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负责人:李文金
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依托单位:
多层QM/MM自由能模拟生物酶与仿生催化环化和环加成反应机理
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批准号:21873043
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项目类别:面上项目
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资助金额:65.0万元
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批准年份:2018
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负责人:李欣
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依托单位:
溶液中防晒霜分子体系光物理和光化学机理的QM/MM理论研究
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批准号:21803050
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:25.0万元
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批准年份:2018
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负责人:常雪萍
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依托单位:
基于QM/MM方法对中药提取物中的DXR抑制剂的优化
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批准号:81803436
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:21.0万元
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批准年份:2018
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负责人:周经纬
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依托单位: