葉緑体転写を統御する核-葉緑体クロストーク機構の解明

阐明控制叶绿体转录的核-叶绿体串扰机制

• 批准号: 01J07530
• 负责人: 森川 一也
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: University of Tsukuba (2002)Kyoto Prefectural University (2001)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 2002
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-01J07530/
• 关键词: 葉緑体; 転写; シグマ因子; 黄色ブドウ球菌; RNAポリメラーゼ; 進化

本年度は黄色ブドウ球菌をモデル生物として採用し、主として1)本菌のシグマ因子群の整理、および2)シグマ因子結合タンパク質群の検索を行った。1)従来の相同性検索に基づく手法によると、黄色ブドウ球菌のゲノムにはシグマ因子遺伝子が2種類しか見いだされない。したがって、本菌のシグマ因子は2種類のみであると考えられてきた。本年度申請者は本菌の遺伝子の「配置」保存性を近縁種と比較することで、従来のシグマ因子に加え、もう一つ新規なシグマ因子遺伝子をが存在することを見いだした。その遺伝子がコードするタンパク質は他のシグマ因子と同様にRNAポリメラーゼと相互作用した(pull-down assayにより確認)。また、本遺伝子を黄色ブドウ球菌に強制発現させると、特定の遺伝子群の転写産物が劇的に蓄積誘導されることを見いだした。以上の結果により、本遺伝子がシグマ因子をコードすることを示した。グラム陽性菌の全シグマ因子群の系統解析を行った結果、本新規シグマ因子はグラム陽性菌が獲得した最初の代替シグマ因子であることが示唆された(以上Genes to cellsに投稿中)。2)primary sigmaであるSigAに結合するタンパク質群をpull-down assayにより検索した結果、数種類の結合タンパク質が存在することが確認できた。現在MULDI-TOF-MSによる同定を試みており、今後も継続研究する予定である。

This year, the yellow bacteria are used in the study. 1) The factors of this strain are sorted out. 2) The factors of this strain are combined with the factors of this strain. 1) The genetic similarity of the two genes is different from each other. The two species of bacteria were identified. This year's applicants are comparing the "disposition" of the strain's genetic heritage with the existence of a new genetic heritage factor. A pull-down assay is used to determine the interaction between RNA molecules and other molecules. In addition, the gene expression of the yellow virus was induced by stress, and the accumulation of specific gene sub-groups was induced. The above results show that The results of the systematic analysis of the whole group of positive bacteria, the new group of positive bacteria, and the initial substitution factors were obtained. 2)primary sigma, SigA, and combination of the two groups of substances are pull-down assays that detect the results and confirm the existence of the two groups of substances. MULDI-TOF-MS is now available for simultaneous testing and future research.

项目成果

Keiko Hayashi, Takashi Shiina, Nao Ishii, Kayou Iwai, Yoko Ishizaki, Kazuya morikawa, Yoshinori Toyoshima: "A role of the -35 element in the initiation of transcription at psbA promoter in tobacco plastids"Plant and Cell Physiology. 44(3)(in press). (2003

Keiko Hayashi、Takashi Shiina、Nao Ishii、Kayou Iwai、Yoko Ishizaki、Kazuya morikawa、Yoshinori Toyoshima：“-35 元件在烟草质体中 psbA 启动子转录起始中的作用”植物和细胞生理学。

Kazuya Morikawa, Takashi Shiina, Shinya Murakami, Yoshinori Toyoshima: "Novel nuclear-encoded proteins interacting with a plastid sigma factor, Sig1 in Arabidopsis thaliana"FEBS Letters. 514. 300-304 (2002)

Kazuya Morikawa、Takashi Shiina、Shinya Murakami、Yoshinori Toyoshima：“拟南芥中与质体 sigma 因子 Sig1 相互作用的新型核编码蛋白”FEBS Letters。

Yuichi Tsunoyama, Kazuya Morikawa, Takashi Shiina, Yoshinori Toyoshima: "Blue light specific and differential expression of a plastid sigma factor, Sig5, in Arabidopsis thaliana"FEBS Letters. 516. 225-228 (2002)

Yuichi Tsunoyama、Kazuya Morikawa、Takashi Shiina、Yoshinori Toyoshima：“拟南芥中质体 Sigma 因子 Sig5 的蓝光特异性和差异表达”FEBS 快报。