ゼブラフィッシュ胚発生過程に発現するRNA結合性蛋白質の網羅的同定

斑马鱼胚胎发育过程中表达的RNA结合蛋白的综合鉴定

• 批准号: 13202043
• 负责人: 井上 邦夫
• 金额: $ 3.39万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13202043/
• 关键词: ゼブラフィッシュ; RNA結合性蛋白質; 胚発生; 選択的スプライシング; RNA情報発現

初期発生過程には、多くのRNA結合性蛋白質がさまざまな形で働くものと考えられる。脊椎動物では、いくつかの組織特異的RNA結合性蛋白質が同定され、その役割が解析されているが、全体としてRNA結合性蛋白質群の時間的・空間的発現様式の情報は不十分であり、RNA情報発現制御システムが発生分化過程にどのような役割を担っているのか包括的理解を目指すにはほど遠い状況である。本研究では、ゼブラフィッシュを用い、RNA結合性蛋白質をコードする遺伝子群を効率的・網羅的に同定し、脊椎動物の胚発生過程における発現様式の情報を集積していくことを主な目的とした。ESTデータベース情報をもとにRNA結合性蛋白質をコードするゼブラフィッシュ遺伝子をいくつか同定し、in situハイブリダイゼーションによる発現様式の解析、蛋白質の機能解析を進めた。1.nPTB相同遺伝子およびstaufen相同遺伝子を同定した。いずれも神経系などに発現が観察された。2.sebは筋肉系、水晶体、耳胞等に発現しており、(GU)_n配列に結合することが示唆された。3.etr-3は主に神経系で発現する。BrulやEtr-1と同様にURE配列に結合し、選択的スプライシング制御因子として働くことを見いだした。4.hermes-1は心臓原基や網膜に発現しており、(CA)_n配列に結合することによって選択的スプライシング制御因子として働くことがわかった。また、翻訳制御因子としても働く可能性が示唆された。5.tenr遺伝子は、卵形成過程において、成熟の進んだ卵母細胞の表層領域に母性mRNAが存在することがわかった。

In the early stages of development, there are many RNA-binding proteins. In vertebrates, there is a lack of information on the temporal and spatial patterns of expression of all tissue-specific RNA-binding proteins, including the identification and analysis of all service segments, and on the understanding of RNA information generation, control, and differentiation processes. This study aims to collect information on the development of vertebrate embryos in the context of the use of RNA-binding proteins in the development of gene expression. ESTs contain information about RNA-binding proteins and protein functions. 1. NPTB same heritage In the middle of the night, the mental system appears to be under observation. 2. Seb is a muscle system, crystal, ear cells, etc., and the combination of (GU)_n is shown. 3. etr-3 is the main nervous system. Brul Etr-1 and the same configuration, the selection of the control factor, see the 4. Hermes-1 is the first to appear in the matrix.(CA)_n is the first to appear in the matrix.(CA)_n is the second to appear in the matrix. The possibility of a change in control factors is not obvious. 5. The presence of maternal mRNA in the oocyte's surface area during oocyte formation and maturation

项目成果

井上 邦夫: "ゼブラフィッシュ発生分化過程に働くRNA情報発現系"生体の科学. (印刷中). (2002)

Kunio Inoue：“在斑马鱼的发育和分化过程中发挥作用的RNA信息表达系统”（出版中）。

Hitoshi Suzuki: "Regulation of alternative splicing of α-actinin transcript by Bruno-like proteins"Genes to Cells. (印刷中). (2002)

Hitoshi Suzuki：“布鲁诺样蛋白对 α-肌动蛋白转录物的选择性剪接的调节”《基因到细胞》（出版中）。

Shing Nakahata: "Biochemical identification of Xenopus pumilio as a sequence-specific cyclin B1 mRNA-binding protein"J.Biol.Chem.. 276(24). 20945-20953 (2001)

Shing Nakahata：“非洲爪蟾作为序列特异性细胞周期蛋白 B1 mRNA 结合蛋白的生化鉴定”J.Biol.Chem.. 276(24)。