熱ストレスに応答した選択的スプライシング機構の研究
熱ストレスに応答した選択的スプライシング機構の研究
批准号:
21K06018
负责人:
井上 邦夫
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
細胞は各種ストレスを含む細胞環境に応答して遺伝子発現制御を行う。真核遺伝子の多くはイントロンで分断されており、機能的なmRNAが生成するにはイントロンを除去するスプライシング反応が必須である。選択的スプライシングの制御は、プロテオーム変化を介し、細胞環境に応じた細胞の振る舞いや恒常性の維持に働く遺伝子発現制御機構として重要と考えられるが、その分子基盤や個体レベルでの役割については多くの未解明な問題が存在する。本研究では、(1) ヒトhsp105遺伝子やtnrc6a遺伝子などにおける熱ストレス応答性の選択的スプライシング制御因子として同定したSRSFやhnRNP K などが通常温度でも豊富に存在するRNA結合タンパク質であることから、制御因子の翻訳後制御、とりわけ、リン酸化・脱リン酸化による機能調節が熱ストレス応答制御の中核をなしているとの作業仮説を立て、主にヒト培養細胞においてその検証と詳細な分子基盤の解明を行うとともに、(2) 熱応答性の制御を受けるエキソンをゲノム編集により恒常的に挿入あるいは欠損するよう改変した遺伝子を持つゼブラフィッシュ系統を作製し、熱ストレスにより生成する選択的スプライシング産物が動物のストレス応答や恒常性維持にどのような役割を果たすか明らかにすることを目的としている。本年度は、主に、ヒト細胞において、tnrc6a遺伝子と高い相同性を有するtnrc6c遺伝子において新規の熱ストレス応答性スプライシングの存在とその制御因子候補を明らかにするとともに、SRSF2遺伝子の熱ストレス応答性の選択的スプライシング制御機構について知見を得た。また、前年度に引き続き、熱ストレス応答制御を可視化するレポーター系の構築に取り組んだ。
英文摘要
細胞は各種ストレスを含む細胞環境に応答して遺伝子発現制御を行う。真核遺伝子の多くはイントロンで分断されており、機能的なmRNAが生成するにはイントロンを除去するスプライシング反応が必須である。選択的スプライシングの制御は、プロテオーム変化を介し、細胞環境に応じた細胞の振る舞いや恒常性の維持に働く遺伝子発現制御機構として重要と考えられるが、その分子基盤や個体レベルでの役割については多くの未解明な問題が存在する。本研究では、(1) ヒトhsp105遺伝子やtnrc6a遺伝子などにおける熱ストレス応答性の選択的スプライシング制御因子として同定したSRSFやhnRNP K などが通常温度でも豊富に存在するRNA結合タンパク質であることから、制御因子の翻訳後制御、とりわけ、リン酸化・脱リン酸化による機能調節が熱ストレス応答制御の中核をなしているとの作業仮説を立て、主にヒト培養細胞においてその検証と詳細な分子基盤の解明を行うとともに、(2) 熱応答性の制御を受けるエキソンをゲノム編集により恒常的に挿入あるいは欠損するよう改変した遺伝子を持つゼブラフィッシュ系統を作製し、熱ストレスにより生成する選択的スプライシング産物が動物のストレス応答や恒常性維持にどのような役割を果たすか明らかにすることを目的としている。本年度は、主に、ヒト細胞において、tnrc6a遺伝子と高い相同性を有するtnrc6c遺伝子において新規の熱ストレス応答性スプライシングの存在とその制御因子候補を明らかにするとともに、SRSF2遺伝子の熱ストレス応答性の選択的スプライシング制御機構について知見を得た。また、前年度に引き続き、熱ストレス応答制御を可視化するレポーター系の構築に取り組んだ。
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ユタ大学(米国)
犹他大学(美国)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1016/j.ydbio.2022.12.006
发表时间:
2022-12-26
期刊:
DEVELOPMENTAL BIOLOGY
影响因子:
2.7
作者:
[Tani-Matsuhana,Saori, Kawata,Yuga, Inoue,Kunio]
通讯作者:
Inoue,Kunio
線虫C. elegansにおいてクロモドメイン蛋白質MRG-1の阻害はストレス応答系の活性化に伴う成長遅延を誘導する
抑制染色质结构域蛋白 MRG-1 可诱导与应激反应系统激活相关的生长迟缓。 线虫
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[巳波 孝至, 井上 邦夫, 坂本 博]
通讯作者:
坂本 博
ミュンヘン工科大学(ドイツ)
慕尼黑工业大学(德国)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Identification of regulatory elements for MafB expression in the cardiac neural crest
心脏神经嵴中 MafB 表达调控元件的鉴定
DOI:
10.1016/j.cdev.2021.203725
发表时间:
2021
期刊:
Cells & Development
影响因子:
3.9
作者:
[Tani-Matsuhana Saori, Inoue Kunio]
通讯作者:
Inoue Kunio
共 7 条
人工設計した短鎖RNAによる組織特異的な遺伝子発現抑制システムの構築
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批准号:17657074
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2005
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负责人:井上 邦夫
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依托单位:
ゼブラフィッシュ胚発生過程に発現するRNA結合性蛋白質の網羅的同定
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批准号:13202043
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.39万
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财政年份:2001
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负责人:井上 邦夫
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依托单位:
ゼブラフィッシュにおける母性mRNAの局在化機構
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批准号:12780557
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2000
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负责人:井上 邦夫
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依托单位:
ゼブラフィッシュ胚発生過程に発現するRNA結合性蛋白質の網羅的同定
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批准号:12202034
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:井上 邦夫
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依托单位:
アフリカツメガエル初期胚における前後軸形成機構
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批准号:06270207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.92万
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财政年份:1994
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负责人:井上 邦夫
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依托单位:
海外基金