リボゾームDNA解析による病原真菌の同定型別と遺伝子診断に関する研究

病原真菌遺伝子の核型および塩基配列の決定として、充分な塩基配列データが得られていないアスペルギルス症起因菌および、本邦に特異的な夏型過敏性肺臓炎起因菌をはじめとした、形態学的に同定困難な菌種菌株の基準株・臨床分離株(100-200株程度)を用意し、パルスフィールド電気泳動法による核型解析を行なうと共に、菌種特異的な塩基配列(28S,ITS1 rDNA)の塩基配列を決定しつつある。また、遺伝子塩基配列データベースの開発と、本データベースを用いた分子生物学的菌種・菌株の同定・型別法を開発するとともに、本研究によって決定した塩基配列解析と、現在迄に得られた信頼できる塩基配列と共にデータベース化し、クラスター解析を加えることによって、主要病原真菌およびその近縁菌種に関してgenospeciesを定義しつつある。この結果得られるgenospecies rDNA塩基配列(標的配列)を用いた実用化研究として、設計が容易なPCR、簡便であるがプライマーの設計が困難なLAMP法による検出同定システムを併せて作成する。このシステムによって実用性が高く、臨床的応用に足りる分子生物学的菌種・菌株の同定・型別法を研究開発しつつある。また、本研究の実施例として、これらの検討によるCandida属酵母の型別法を用いて、緊急に解析する必要のある本菌感染症例の疫学的事例を解明し、院内感染管理に寄与することが可能であった。

病原真菌遺伝子の核型および塩基配列の決定として、充分な塩基配列データが得られていないアスペルギルス症起因菌および、本邦に特異的な夏型過敏性肺臓炎起因菌をはじめとした、形態学的に同定困難な菌種菌株の基準株・臨床分離株(100-200株程度)を用意し、パルスフィールド電気泳動法による核型解析を行なうと共に、菌種特異的な塩基配列(28S,ITS1 rDNA)の塩基配列を決定しつつある。また、遺伝子塩基配列データベースの開発と、本データベースを用いた分子生物学的菌種・菌株の同定・型別法を開発するとともに、本研究によって決定した塩基配列解析と、現在迄に得られた信頼できる塩基配列と共にデータベース化し、クラスター解析を加えることによって、主要病原真菌およびその近縁菌種に関してgenospeciesを定義しつつある。この結果得られるgenospecies rDNA塩基配列(標的配列)を用いた実用化研究として、設計が容易なPCR、簡便であるがプライマーの設計が困難なLAMP法による検出同定システムを併せて作成する。このシステムによって実用性が高く、臨床的応用に足りる分子生物学的菌種・菌株の同定・型別法を研究開発しつつある。また、本研究の実施例として、これらの検討によるCandida属酵母の型別法を用いて、緊急に解析する必要のある本菌感染症例の疫学的事例を解明し、院内感染管理に寄与することが可能であった。