希少遺伝子疾患の新規遺伝子同定と治療戦略を見据えた病態解析

罕见遗传病新基因的鉴定和病理分析，重点关注治疗策略

• 批准号: 22H03047
• 负责人: 三宅 紀子
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: National Center for Global Health and Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H03047/
• 关键词: 単一遺伝子疾患; 網羅的ゲノム解析; 新規疾患遺伝子; 病態解明; 希少疾患; 病的バリアント; Multi-Omics

希少遺伝性疾患の症例収集については、協力医療機関も増え10施設からの検体提供が得られており昨年度1年間で89症例（患者のみで）を新規にリクルートすることができた。発端者を対象に、主に全エクソーム解析を行った。解析パイプラインも最新のアノテーションの付加や、コピー数解析等の解析フローも改良した。解析症例の中から、繰り返す感染症を呈する兄弟例の解析により新規の疾患遺伝子候補が同定され、現在機能解析を行い、病態発症のメカニズムを解析中である。その外にも世界でまだ数例しか報告されていない新規の希少遺伝子疾患の病的バリアントを同定し、現在3報の症例報告論文を投稿・作成中である。また、他施設との共同研究として、自閉症（Miyake et al., 2023, Eur J Hum Genet）、てんかん（Acta Neuropathol Commun. 2023）, Cockayne症候群（Aging, 2022、Hum Genome Var. 2022）, 短肢性小人症（Clin Genet. 2022）、小脳低形成・萎縮症（Genet Med. 2022）、知的障害（Hum Genome Var. 2022）のゲノム解析を行い、病的バリアントを同定し、学術論文として発表した。中でも自閉症の解析では、405症例（351 trio, 24 quads, 2 quitets）に対し全エクソーム解析を行い、53症例に症状を説明できる候補バリアント（single nucleotide variants/ small indels）を同定した。さらに、コピー数解析を行い、13症例において症状を説明できる病的コピー数変化を同定した。分子診断率は66/405(16.3%) なり、これは既報より少し高い結果であった。

Rare cases survived 伝 sexual disorders の 収 set に つ い て は, together medical machine masato も raised え 10 facilities か ら の 検 body provide が ら れ て お り で 89 cases last year 1 years (patients の み で) を new rules に リ ク ル ー ト す る こ と が で き た. The issuer を opposes に, the main に all エ ソ ソ ム ム resolves を rows った. Analysis: パ プラ プラ <e:1> <s:1> <s:1> the latest <s:1> アノテ アノテ ショ ショ <e:1> the analysis of the addition of や and コピ <s:1> numbers, etc. <s:1> analysis: フロ <s:1> improvement of た. Parsing of disease patients の か ら, Qiao り return す adapting just-in-time inventory を show す る brothers example analytical に の よ り new rules の disorders heritage 伝 son alternate が with fixed さ れ line, now functional analytic を い, pathological 発 の メ カ ニ ズ ム を parsing で あ る. そ の outside に も world で ま several し だ か report さ れ て い な い new rules の rare but の 伝 son disease disease バ リ ア ン ト を with し, now report 3 cases reported の で in を contribute, to finish the paper あ る. Youdaoplaceholder0, he set up と と co-study と て て, autism (Miyake et al., 2023, Eur J Hum Genet), てん ん (Acta Neuropathol Commun., 2023), Cockayne syndrome (Aging) 2022 Hum Genome Var. 2022 Short-limbed lantism (Clin Genet. 2022), small 脳 hypoplasia and atrophy (Genet Med. 2022), intellectual impairment (Hum Genome Var. 2022), ゲノム analysis of を line バリア, バリア トを トを, <s:1> determination of <s:1>, academic paper と て release table た. Analysis of で <e:1> autism で, 405 cases (351 trio, 24 quads) 2 quitets) に し all seaborne エ ク ソ ー ム parsing を い, 53 cases を に symptoms mean で き る alternate バ リ ア ン ト (single nucleotide variants/small indels) with fixed し を た. さ ら に, コ ピ ー line number parsing を い, 13 cases of に お い を て symptoms mean で き る disease コ ピ ー number variations change with fixed を し た. The molecular diagnosis rate is な 66/405(16.3%), and な れ れ よ reports less よ よ results であった.

项目成果

Three KINSSHIP syndrome patients with mosaic and germline AFF3 variants

三名具有嵌合体和种系 AFF3 变异的 KINSSHIP 综合征患者

• DOI: 10.1111/cge.14292
• 发表时间: 2023
• 期刊: Clinical Genetics
• 影响因子: 3.5
• 作者: Inoue Yuta;Tsuchida Naomi;Okamoto Nobuhiko;Shuichi Shimakawa;Ohashi Kei;Saitoh Shinji;Ogawa Atsushi;Hamada Keisuke;Sakamoto Masamune;Miyake Noriko;Hamanaka Kohei;Fujita Atsushi;Koshimizu Eriko;Miyatake Satoko;Mizuguchi Takeshi;Ogata Kazuhiro;Uchiyama Yuri
• 通讯作者: Uchiyama Yuri

Monogenic causes of pigmentary mosaicism

• DOI: 10.1007/s00439-022-02437-w
• 发表时间: 2022-05
• 期刊: Human Genetics
• 影响因子: 5.3
• 作者: K. Saida;P. Chong;A. Yamaguchi;Naka Saito;Hajime Ikehara;E. Koshimizu;R. Miyata;A. Ishiko;Kazuyuki Nakamura;H. Ohnishi;K. Fujioka;T. Sakakibara;H. Asada;K. Ogawa;K. Kudo;Eri Ohashi;M. Kawai;Yuichi Abe;N. Tsuchida;Yuri Uchiyama;K. Hamanaka;A. Fujita;T. Mizuguchi;S. Miyatake;N. Miyake;Mitsuhiro Kato;R. Kira;N. Matsumoto

Friedrich-Baur-Institute(ドイツ)

弗里德里希·鲍尔研究所（德国）

Genetic Health Service New Zealand/University of Auckland, Auckland(ニュージーランド)

新西兰遗传健康服务/奥克兰大学，奥克兰（新西兰）

Unrevealing the pathomechanism of human monogenic diseases

揭示人类单基因疾病的发病机制

• 发表时间: 2022
• 作者: Duong Nguyen Thuy;Anh Nguyen Phuong;Bac Nguyen Duy;Quang Le Bach;Miyake Noriko;Van Hai Nong;Matsumoto Naomichi;三宅紀子;Noriko Miyake
• 通讯作者: Noriko Miyake