Selective degradation of p53 mutant by an engineered ScFv-linked ubiquitin ligase

通过工程化的 ScFv 连接泛素连接酶选择性降解 p53 突变体

基本信息

  • 批准号:
    13671261
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.3万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2001
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2001 至 2002
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

We have attempted to create an engineered ubiquitin ligase with ScFv as a substrate recognition site that target and degrade only p53 mutant but not the wild type. The ScFv was cloned from cDNA library of a hybridoma cells that express Pab240, an antibody recognizes mutant p53 such as R273P, R175H, or V143A. We first tested a double RING finger ubiquitin ligase whether it actually targets the intended specific substrates. The engineered ligase contains the RING finger domains of both BRCA1 and BARD1 linked to a substrate recognition site PCNA, which is known to interact with cyclin dependent kinase inhibitor p57. The double RING finger ubiquitin ligase formed a homo-oligomer complex and exhibited significant ligase activity. Co-transfection of the ligase reduced the expression of transfected p57 to the back ground level in proteasome dependent manner, and restored the colony formation ability of U2OS cells that is otherwise inhibited by overexpressed p57. The results indicate the ability of the engineered double RING ubiquitin ligase to target the intended substrate. Next we tested the double RING ubiquitin ligase linked to the ScFv cloned from Pab240. However so far it has not been successful most likely because of the affinity problem between the ScFv and p53 mutants. To overcome the problem a new ScFv has been made by DNA synthesize method.
我们试图创建一种工程泛素连接酶,以ScFv作为底物识别位点,仅靶向和降解p53突变型,而不是野生型。该ScFv从表达Pab240的杂交瘤细胞cDNA文库中克隆而来,Pab240是一种识别突变p53如R273P、R175H或V143A的抗体。我们首先测试了双环指泛素连接酶是否真的针对预期的特定底物。工程连接酶含有BRCA1和BARD1的环指结构域,与底物识别位点PCNA连接,已知PCNA与细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂p57相互作用。双环指泛素连接酶形成了一个同源低聚物复合物,并表现出显著的连接酶活性。连接酶的共转染以蛋白酶体依赖的方式将转染的p57的表达降低到背景水平,恢复了U2OS细胞的集落形成能力,否则p57的过表达会抑制这种能力。结果表明,工程双环泛素连接酶能够靶向预期的底物。接下来,我们测试了连接到从Pab240克隆的ScFv的双环泛素连接酶。然而,到目前为止,它还没有成功,很可能是因为ScFv和p53突变体之间的亲和力问题。为了克服这一问题,采用DNA合成的方法制备了一种新的单链抗体。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Ohta, T., Hashizume, R., Fukuda: "The novel function of BRCA1 -ubiquitin ligase activity-"Cell Technology (Japanese). 20. 854-856 (2001)
Ohta, T.、Hashizume, R.、Fukuda:“BRCA1 的新功能 - 泛素连接酶活性 -”Cell Technology(日语)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Ichiro Maeda: "In vitro Ubiquitination of Cyclin D1 by ROC1-CUL1 and ROC1-CUL3"FEBS letters. 494(3). 181-185 (2001)
Ichiro Maeda:“ROC1-CUL1 和 ROC1-CUL3 对 Cyclin D1 的体外泛素化”FEBS 字母。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Brzovic P, Keeffe J, Nishikawa H, Miyamoto K, Fox D, Fukuda M, Ohta T, and Klevit R: "Binding and Recognition in the Assembly of an Active BRCA1-BARD1 Ubiquitin Ligase Complex"Proc. Natl. Acad. Sci. USA. In Press. (2003)
Brzovic P、Keeffe J、Nishikawa H、Miyamoto K、Fox D、Fukuda M、Ohta T 和 Klevit R:“活性 BRCA1-BARD1 泛素连接酶复合物组装中的结合和识别”Proc。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Peter S.Brzovic: "Binding and Recognition in the Assembly of an Active BRCA1-BARD1 Ubiquitin Ligase Complex"Proc. Natl. Acad. Sci. USA. (In Press). (2003)
Peter S.Brzovic:“活性 BRCA1-BARD1 泛素连接酶复合物组装中的结合和识别”Proc。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Rintaro Hashizume: "The RING heterodimer BRCA1-BARD1 is a ubiquitin ligase inactivated by a breast cancer-derived mutation"Journal of Biological Chemistry. 276(18). 14537-14540 (2001)
Rintaro Hashizume:“RING 异二聚体 BRCA1-BARD1 是一种因乳腺癌衍生突变而失活的泛素连接酶”《生物化学杂志》。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

FUKUDA Mamoru其他文献

FUKUDA Mamoru的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('FUKUDA Mamoru', 18)}}的其他基金

Identification of novel breast cancer-related genes using 2D-DIGE system and their functional analyses
利用2D-DIGE系统鉴定新的乳腺癌相关基因及其功能分析
  • 批准号:
    18591445
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Roles of BRCA1 in sporadic breast cancer
BRCA1 在散发性乳腺癌中的作用
  • 批准号:
    16591279
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Molecular Cloning and Functional Analysis of CDK Variant Expressed in Breast Cancer Tissues
乳腺癌组织中表达的CDK变异体的分子克隆和功能分析
  • 批准号:
    09671263
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Proliferative activities of non-palpable breast cancer detected by mammography
乳腺X线摄影检测不可触及乳腺癌的增殖活性
  • 批准号:
    05671031
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)

相似海外基金

Understanding targeted protein degradation for design of optimized therapeutic strategies
了解靶向蛋白质降解以设计优化的治疗策略
  • 批准号:
    BB/X007499/1
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Research Grant
Temporal coordination of transcription, translation, and protein degradation for meiotic termination
减数分裂终止的转录、翻译和蛋白质降解的时间协调
  • 批准号:
    2319006
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Programmable peptide-guided protein degradation
可编程肽引导的蛋白质降解
  • 批准号:
    10741655
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
Control of protein degradation and transcriptional dynamics in the auxin response
生长素反应中蛋白质降解和转录动力学的控制
  • 批准号:
    10549582
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
Nascent protein degradation-based fast homeostatic mechanism mediated by neuronal membrane proteasomes
神经元膜蛋白酶体介导的基于新生蛋白降解的快速稳态机制
  • 批准号:
    10717075
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
CAREER: Modulating cell signaling and migration by targeted small-molecule binding to a key regulator of protein degradation
职业:通过与蛋白质降解的关键调节因子结合的靶向小分子来调节细胞信号传导和迁移
  • 批准号:
    2239475
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Investigation of Target Protein Degradation and Its Effect on Enhancing Cancer-Specific Antigen Presentation by Quantitative Mass Spectrometry
通过定量质谱研究靶蛋白降解及其对增强癌症特异性抗原呈递的影响
  • 批准号:
    23K04971
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Chemical Proteomics Approach to Discover Novel Small Molecule E3 Ligase recruiters for Targeted Protein degradation (TPD)
化学蛋白质组学方法发现用于靶向蛋白质降解 (TPD) 的新型小分子 E3 连接酶招募剂
  • 批准号:
    10711249
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
Development of novel fetal hemoglobin inducers using targeted protein degradation
利用靶向蛋白质降解开发新型胎儿血红蛋白诱导剂
  • 批准号:
    10605620
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
Identifying and hijacking tissue-restricted ubiquitin E3 ligase for targeted protein degradation
识别和劫持组织限制性泛素 E3 连接酶以实现靶向蛋白质降解
  • 批准号:
    2877181
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.3万
  • 项目类别:
    Studentship
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了