溶液中における高分子構造形成の大規模シミュレーション
溶液中における高分子構造形成の大規模シミュレーション
批准号:
13740245
负责人:
藤原 進
金额:
$1.22万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002
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英文摘要
高分子の構造形成機構を分子レベルで解明するため、我々は溶液中における高分子鎖の分子動力学(MD)シミュレーションを行い、配向秩序構造の形成過程を解析した。高分子鎖のモデルとして、最も単純な内部構造を持つポリメチレン鎖を用い、溶媒分子のモデルとして、6個のメチレン基(CH_2)が連結した短い鎖状分子を用いた。メチレン基は一つの質点として扱い、分子力場としてDREIDINGポテンシャルを使った。シミュレーション手法として、速度Verletアルゴリズムを用いた。また、系の温度を一定に保つため速度スケーリング法を、系の圧力を一定に保つためAndersenの方法を適用した。系の圧力は1気圧に設定した。ここでは、500個のメチレン基から成る1本の高分子鎖及び、6個のメチレン基から成る3747本の溶媒分子を扱った。最初に、高温(550K)でランダムな配位の高分子溶液を作り、次にそれを様々な温度(400,350,300K)に冷却し、配向秩序構造の形成過程の解析を行った。その結果、初期において高分子鎖は広がったランダム・コイル状態を取っているが、時間の経過と共に、局所配向秩序ドメインが形成され、その後、局所配向秩序ドメインが成長し、最終的に折り畳まれた配向秩序構造を形成することが分かった。また、大域的配向秩序の成長過程を解析することにより、大域的配向秩序の成長が段階的に進行することが明らかになった。さらに、様々な初期条件、温度条件においてMDシミュレーションを実行することにより、初期条件によっては中間状態としてトロイド構造が形成されることが分かった。また、溶液中の場合、形成される配向秩序構造のステム長は、真空中の場合より長くなることが明らかになった。
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S.Fujiwara: "Molecular dynamics simulation of a single polymer chain in vacuum and in solution"Computer Physics Communications. (発表予定).
S.Fujiwara:“真空和溶液中单聚合物链的分子动力学模拟”计算机物理通讯(待提交)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.Nakamura: "Rigidity of Orientationally Ordered Domains of Short Chain Molecules"Journal of the Physical Society of Japan. 70・4. 943-946 (2001)
H.Nakamura:“短链分子的定向有序域的刚性”日本物理学会杂志70・4(2001)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.Nakamura: "Rigidity of Orientationallv Ordered Domains of Short Chain Molecules"Journal of the Physical Society of Japan. 70・4. 943-946 (2001)
H.Nakamura:“短链分子的定向刚性”日本物理学会杂志70・4(2001)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Y.Tamura: "Virtual reality system to visualize and auralize numerical simulation data"Computer Physics Communications. 142. 227-230 (2001)
Y.Tamura:“用于可视化和听觉化数值模拟数据的虚拟现实系统”计算机物理通信。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.Nakamura: "Dynamics of orientationally ordered domains in a short chain-molecule system : Size dependence of domain oscillation"Computer Physics Communications. 147. 346-349 (2002)
H.Nakamura:“短链分子系统中定向有序域的动力学:域振荡的大小依赖性”计算机物理通信。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 10 条
エピゲノムによる細胞老化制御から読み解くメラノサイトの恒常性破綻と発がん機構
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批准号:23K07743
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:藤原 進
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依托单位:
ソフトマター界面の理論・シミュレーション研究
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批准号:19031019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.66万
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财政年份:2007
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负责人:藤原 進
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依托单位:
両親媒性分子の自己組織化の大規模コンピュータシミュレーション
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批准号:15740262
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2003
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负责人:藤原 進
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依托单位:
複雑液体における構造形成の大規模シミュレーション
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批准号:10740199
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
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负责人:藤原 進
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依托单位:
複雑液体における構造形成の大規模シミュレーション
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批准号:09212227
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.38万
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财政年份:1997
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负责人:藤原 進
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依托单位:
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批准号:08226238
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.38万
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财政年份:1996
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负责人:藤原 進
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依托单位:
海外基金