课题基金 / 基金详情

両親媒性分子の自己組織化の大規模コンピュータシミュレーション

両親媒性分子の自己組織化の大規模コンピュータシミュレーション
两亲分子自组装的大规模计算机模拟
批准号:
15740262
负责人:
藤原 進
金额:
$2.37万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2005

项目摘要

项目成果

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両親媒性分子の自己組織化機構を分子レベルで解明するため、我々は溶媒分子(水分子)と溶質分子(両親媒性分子)を共に粒子として顕わに扱う分子動力学シミュレーションを行った。シミュレーションモデルとして、以下の粗視化モデルを用いた。両親媒性分子は1つの親水性粒子と1つの疎水性粒子からなり、直線状に等間隔に並んだ剛体棒であるとした。溶媒分子は1つの親水性粒子でモデル化した。親水性粒子と疎水性粒子の間の相互作用は、ソフトコア・ポテンシャルで表し、親水性粒子同士及び疎水性粒子同士の間の相互作用は、レナード-ジョーンズ・ポテンシャルで表した。シミュレーションのアルゴリズムとして、かえる跳び法を用いた。アンサンブルとしてNVTアンサンブルを用い、系の温度を一定に保つため速度スケーリング法を適用した。シミュレーションの時間刻みはΔt^*=0.0025とし、相互作用ポテンシャルのカットオフ距離はr_c^*=3.0とした。また、周期境界条件を用いた。ここでは、全粒子数を5832とし、数密度を0.75とした。最初に、高温(T^*=10.0)においてランダムな両親媒性溶液を準備した。その後、T^*=1.3において急冷を行い、中間相形成過程の解析を行った。様々な両親媒性分子濃度(c_s=0.1〜0.9)で形成される構造を解析した結果、濃度の増加とともに、ミセル溶液からヘキサゴナル相へと変化し、さらにラメラ相へ変化することが分かった。さらに、両親媒性分子の自己会合を支配する主要な力は、疎水基-溶媒界面における疎水性引力と親水基の親水性斥力であるが、ヘキサゴナル相が形成されるためには親水性斥力が重要な役割を果たすことが明らかになった。それに対して、ラメラ相の形成には、疎水性斥力の効果が重要であることが分かった。
期刊论文(7)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
S.Fujiwara: "Structure Formation of a Single Polymer Chain in Solution : A Molecular Dynamics Study"Journal of Macromolecular Science - Physics. B42・3&4. 455-466 (2003)
S. Fujiwara:“溶液中单聚合物链的结构形成:分子动力学研究”高分子科学杂志 - 物理学 B42・3&4(2003 年)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
S.Fujiwara: "Molecular dynamics simulation of a single polymer chain in vacuum and in solution"Computer Physics Communications. 147. 342-345 (2002)
S.Fujiwara:“真空和溶液中单聚合物链的分子动力学模拟”计算机物理通讯。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Molecular Dynamics Simulation for Structure Formation of a Single Polymer Chain in Solution
溶液中单聚合物链结构形成的分子动力学模拟
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Journal of Physical Society of Japan 75・2
影响因子: --
作者: [Nakajima, J., Y.Takei, A.Hasegawa, S.Fujiwara]
通讯作者: S.Fujiwara
Pattern Analysis of Structural Dynamics : Application to Molecular System Relaxation
结构动力学模式分析:在分子系统弛豫中的应用
DOI: --
发表时间: 2003
期刊: Brazilian Journal of Physics 33・3
影响因子: --
作者: [Nakajima, J., Y.Takei, A.Hasegawa, S.Fujiwara, S.Fujiwara, S.Fujiwara, S.Fujiwara, R.R.Rosa]
通讯作者: R.R.Rosa
エピゲノムによる細胞老化制御から読み解くメラノサイトの恒常性破綻と発がん機構
  • 批准号:
    23K07743
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $3.0万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    藤原 進
  • 依托单位:
ソフトマター界面の理論・シミュレーション研究
  • 批准号:
    19031019
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $1.66万
  • 财政年份:
    2007
  • 负责人:
    藤原 進
  • 依托单位:
溶液中における高分子構造形成の大規模シミュレーション
複雑液体における構造形成の大規模シミュレーション
  • 批准号:
    10740199
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
  • 资助金额:
    $1.28万
  • 财政年份:
    1998
  • 负责人:
    藤原 進
  • 依托单位:
海外基金