光合成細菌由来炭酸固定経路である還元的TCA回路の分子生物学的解析
光合成細菌由来炭酸固定経路である還元的TCA回路の分子生物学的解析
批准号:
13750735
负责人:
福居 俊昭
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002
中文摘要
還元的TCA回路は有機酸を代謝系の中心とした非Calvin回路型のCO_2固定系の一つであり、TCA回路の逆回転により4分子のCO_2から1分子のオキサロ酢酸を生成する。しかし、本回路におけるそれぞれの酵素的性質や反応機構の解析、遺伝子クローニングはこれまで詳しく行われていない。本研究は湖水より単離した緑色硫黄細菌Chlorobium limicola由来還元的TCAによるCO_2固定を分子レベルで明らかにすることを目的とした。ATP-citrate lyase(ACL)はATPを用いてクエン酸をオキサロ酢酸とアセチルCoAに開裂する逆クライゼン反応を触媒する興味深い酵素であり、原核生物では還元的TCA回路を有する生物にのみ存在している。我々はC. limicola由来ACL遺伝子のクローニングと異種宿主発現を行い、本酵素が真核生物由来酵素と異なるαβヘテロ構造を有していることを明らかにした。本酵素は逆反応を触媒せず、またADPによる競争阻害や、基質であるクエン酸濃度に応じた負の協同性を示し、回路の回転を制御していることを見出した。また[γ-^<32>P]ATPを用いた反応機構の検討により、本酵素のα-サブユニット中のHis273が自己リン酸化され、ついでリン酸基のクエン酸への転移とCoAとの結合によって生じたシトリル-CoAが開裂してオキサロ酢酸とアセチルCoAが生成することを示した。さらに、ADPは自己リン酸化された酵素と可逆的に反応してATPを再生することにより競争的に酵素反応を阻害することを示した。一方で、本菌ゲノムにはTCA回路の鍵酵素であるcitrate synthase(CS)の相同遺伝子が存在することを見いだした。CSは還元的TCA回路によるCO_2固定を阻害すると予想されることから、その発現および発現産物について検討した。本遺伝子産物は大腸菌由来CSと45%の相同性を示し、その組換え型酵素は確かにCS活性を示した。さらに本菌において本遺伝子が転写・翻訳されていることを見いだした。酵素的性質について検討したところ、本酵素はAMPおよびADPによって強く活性化されたことから、細胞内のエネルギー状態に応じた還元的TCA回路/TCA回路の方向や速度の調節に機能していることが推測された。また、CO_2固定酵素の一つであるisocitrate dehydrogenaseの遺伝子クローニングおよび生化学的解析を行った。本酵素は、多くの生物に存在するダイマー型とは異なるモノマー型酵素であり、中性付近では脱炭酸活性と同程度の炭酸固定活性を示すこと、オキサロ酢酸によって競争阻害を受けることを明らかとした。
英文摘要
還元的TCA回路は有機酸を代謝系の中心とした非Calvin回路型のCO_2固定系の一つであり、TCA回路の逆回転により4分子のCO_2から1分子のオキサロ酢酸を生成する。しかし、本回路におけるそれぞれの酵素的性質や反応機構の解析、遺伝子クローニングはこれまで詳しく行われていない。本研究は湖水より単離した緑色硫黄細菌Chlorobium limicola由来還元的TCAによるCO_2固定を分子レベルで明らかにすることを目的とした。ATP-citrate lyase(ACL)はATPを用いてクエン酸をオキサロ酢酸とアセチルCoAに開裂する逆クライゼン反応を触媒する興味深い酵素であり、原核生物では還元的TCA回路を有する生物にのみ存在している。我々はC. limicola由来ACL遺伝子のクローニングと異種宿主発現を行い、本酵素が真核生物由来酵素と異なるαβヘテロ構造を有していることを明らかにした。本酵素は逆反応を触媒せず、またADPによる競争阻害や、基質であるクエン酸濃度に応じた負の協同性を示し、回路の回転を制御していることを見出した。また[γ-^<32>P]ATPを用いた反応機構の検討により、本酵素のα-サブユニット中のHis273が自己リン酸化され、ついでリン酸基のクエン酸への転移とCoAとの結合によって生じたシトリル-CoAが開裂してオキサロ酢酸とアセチルCoAが生成することを示した。さらに、ADPは自己リン酸化された酵素と可逆的に反応してATPを再生することにより競争的に酵素反応を阻害することを示した。一方で、本菌ゲノムにはTCA回路の鍵酵素であるcitrate synthase(CS)の相同遺伝子が存在することを見いだした。CSは還元的TCA回路によるCO_2固定を阻害すると予想されることから、その発現および発現産物について検討した。本遺伝子産物は大腸菌由来CSと45%の相同性を示し、その組換え型酵素は確かにCS活性を示した。さらに本菌において本遺伝子が転写・翻訳されていることを見いだした。酵素的性質について検討したところ、本酵素はAMPおよびADPによって強く活性化されたことから、細胞内のエネルギー状態に応じた還元的TCA回路/TCA回路の方向や速度の調節に機能していることが推測された。また、CO_2固定酵素の一つであるisocitrate dehydrogenaseの遺伝子クローニングおよび生化学的解析を行った。本酵素は、多くの生物に存在するダイマー型とは異なるモノマー型酵素であり、中性付近では脱炭酸活性と同程度の炭酸固定活性を示すこと、オキサロ酢酸によって競争阻害を受けることを明らかとした。
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T.Kanao, T.Fukui, H.Atomi, T.Imanaka: "ATP-citrate lyase from the green sulfur bacterium Chlorobium limicola is a heteromeric enzyme composed of two distinct gene products"Eur. J. Biochemistry. 268. 1670-1678 (2001)
T.Kanao、T.Fukui、H.Atomi、T.Imanaka:“来自绿色硫细菌 Chlorobium limicola 的 ATP-柠檬酸裂解酶是一种由两种不同基因产物组成的异聚酶”Eur。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
T.Kanao, M.Kawamura, T.Fukui, H.Atomi, T.Imanaka: "Charcterization of isocitrate dehydrogenase from the green sulfur bacterium Chlorobium limicola : a carbon dioxide-fixing enzyme in the reductive tricarboxylic acid cycle"Eur. J. Biochemistry. 269. 1926-1
T.Kanao、M.Kawamura、T.Fukui、H.Atomi、T.Imanaka:“来自绿色硫细菌 Chlorobium limicola 的异柠檬酸脱氢酶的表征:还原三羧酸循环中的二氧化碳固定酶”Eur。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
T.Kanao, T.Fukui, H.Atomi, T.Imanaka: "Kinetic and biochemical analyses on the reaction mechanism of a bacterial ATP-citrate lyase"Eur. J. Biochemistry. 269. 3409-3416 (2002)
T.Kanao、T.Fukui、H.Atomi、T.Imanaka:“细菌 ATP-柠檬酸裂解酶反应机制的动力学和生化分析”Eur。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
T.Kanao, M.Kawamura, T.Fukui, H.Atomi, T.Imanaka: "Charcterization of isocitrate dehydrogenase from the green sulfur bacterium Chlorobium limicola : a carbon dioxide-fixing enzyme in the reductive tricarboxylic acid cycle"Eur. J. Biochemistry. (in press).
T.Kanao、M.Kawamura、T.Fukui、H.Atomi、T.Imanaka:“来自绿色硫细菌 Chlorobium limicola 的异柠檬酸脱氢酶的表征:还原三羧酸循环中的二氧化碳固定酶”Eur。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
T.Kanao, T.Fukui, H.Atomi, T.Imanaka: "ATP-citraic lyase from the green sulfur bacterium Chlorobium limicola is a heteromeric enzyme composed of two distinct gene products"Eur. J. Biochemistry. 268. 1670-1678 (2001)
T.Kanao、T.Fukui、H.Atomi、T.Imanaka:“来自绿色硫细菌 Chlorobium limicola 的 ATP-柠檬酸裂合酶是一种由两种不同基因产物组成的异聚酶”Eur。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
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通讯作者:
超好熱性アーキアへのFd依存型嫌気的TCAサイクルの実装と水素生産への利用
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批准号:23K23502
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$5.49万
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财政年份:2024
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
超好熱性アーキアへのFd依存型嫌気的TCAサイクルの実装と水素生産への利用
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批准号:22H02235
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.98万
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财政年份:2022
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
Bioplastic production by hydrogen-oxidizing bacterium under microaerobic condition
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批准号:21F20100
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2021
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
水素酸化細菌を用いた微好気条件でのバイオプラスチック生合成
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批准号:20F20100
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2020
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
水素酸化細菌を用いた微好気条件でのバイオプラスチック生合成
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批准号:20F40100
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2020
-
负责人:福居 俊昭
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依托单位:
水素酸化細菌を用いた微好気条件でのバイオプラスチック生合成
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批准号:20F02100
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2020
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
ゲノム情報に基づいた高性能バイオポリエステル生産微生物の分子育種
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批准号:20018008
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.86万
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财政年份:2008
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
ゲノム情報に基づいた高性能バイオポリエステル生産微生物の分子育種
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批准号:18018014
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.67万
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财政年份:2006
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
ゲノム情報に基づいた生分解性共重合ポリエステル生産微生物の分子育種
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批准号:17019017
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.56万
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财政年份:2005
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
超好熱性を付与する遺伝子群の探策
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批准号:16658045
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
超好熱始原菌における"missing gene"の同定と機能検証
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批准号:16681016
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$18.64万
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财政年份:2004
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
遺伝子組換え微生物によるポリヒドロキシアルカン酸の合成
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批准号:10750640
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1998
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负责人:福居 俊昭
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依托单位:
ポリヒドロキシアルカノエ-ト生合成機構の解析と細胞変換による新規生合成系の構築
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批准号:07750983
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1995
-
负责人:福居 俊昭
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依托单位: