课题基金 / 基金详情

光合成細菌由来炭酸固定経路である還元的TCA回路の分子生物学的解析

光合成細菌由来炭酸固定経路である還元的TCA回路の分子生物学的解析
还原 TCA 循环(源自光合细菌的二氧化碳固定途径)的分子生物学分析
批准号:
13750735
负责人:
福居 俊昭
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
還元的TCA回路は有機酸を代謝系の中心とした非Calvin回路型のCO_2固定系の一つであり、TCA回路の逆回転により4分子のCO_2から1分子のオキサロ酢酸を生成する。しかし、本回路におけるそれぞれの酵素的性質や反応機構の解析、遺伝子クローニングはこれまで詳しく行われていない。本研究は湖水より単離した緑色硫黄細菌Chlorobium limicola由来還元的TCAによるCO_2固定を分子レベルで明らかにすることを目的とした。ATP-citrate lyase(ACL)はATPを用いてクエン酸をオキサロ酢酸とアセチルCoAに開裂する逆クライゼン反応を触媒する興味深い酵素であり、原核生物では還元的TCA回路を有する生物にのみ存在している。我々はC. limicola由来ACL遺伝子のクローニングと異種宿主発現を行い、本酵素が真核生物由来酵素と異なるαβヘテロ構造を有していることを明らかにした。本酵素は逆反応を触媒せず、またADPによる競争阻害や、基質であるクエン酸濃度に応じた負の協同性を示し、回路の回転を制御していることを見出した。また[γ-^<32>P]ATPを用いた反応機構の検討により、本酵素のα-サブユニット中のHis273が自己リン酸化され、ついでリン酸基のクエン酸への転移とCoAとの結合によって生じたシトリル-CoAが開裂してオキサロ酢酸とアセチルCoAが生成することを示した。さらに、ADPは自己リン酸化された酵素と可逆的に反応してATPを再生することにより競争的に酵素反応を阻害することを示した。一方で、本菌ゲノムにはTCA回路の鍵酵素であるcitrate synthase(CS)の相同遺伝子が存在することを見いだした。CSは還元的TCA回路によるCO_2固定を阻害すると予想されることから、その発現および発現産物について検討した。本遺伝子産物は大腸菌由来CSと45%の相同性を示し、その組換え型酵素は確かにCS活性を示した。さらに本菌において本遺伝子が転写・翻訳されていることを見いだした。酵素的性質について検討したところ、本酵素はAMPおよびADPによって強く活性化されたことから、細胞内のエネルギー状態に応じた還元的TCA回路/TCA回路の方向や速度の調節に機能していることが推測された。また、CO_2固定酵素の一つであるisocitrate dehydrogenaseの遺伝子クローニングおよび生化学的解析を行った。本酵素は、多くの生物に存在するダイマー型とは異なるモノマー型酵素であり、中性付近では脱炭酸活性と同程度の炭酸固定活性を示すこと、オキサロ酢酸によって競争阻害を受けることを明らかとした。
英文摘要
還元的TCA回路は有機酸を代謝系の中心とした非Calvin回路型のCO_2固定系の一つであり、TCA回路の逆回転により4分子のCO_2から1分子のオキサロ酢酸を生成する。しかし、本回路におけるそれぞれの酵素的性質や反応機構の解析、遺伝子クローニングはこれまで詳しく行われていない。本研究は湖水より単離した緑色硫黄細菌Chlorobium limicola由来還元的TCAによるCO_2固定を分子レベルで明らかにすることを目的とした。ATP-citrate lyase(ACL)はATPを用いてクエン酸をオキサロ酢酸とアセチルCoAに開裂する逆クライゼン反応を触媒する興味深い酵素であり、原核生物では還元的TCA回路を有する生物にのみ存在している。我々はC. limicola由来ACL遺伝子のクローニングと異種宿主発現を行い、本酵素が真核生物由来酵素と異なるαβヘテロ構造を有していることを明らかにした。本酵素は逆反応を触媒せず、またADPによる競争阻害や、基質であるクエン酸濃度に応じた負の協同性を示し、回路の回転を制御していることを見出した。また[γ-^<32>P]ATPを用いた反応機構の検討により、本酵素のα-サブユニット中のHis273が自己リン酸化され、ついでリン酸基のクエン酸への転移とCoAとの結合によって生じたシトリル-CoAが開裂してオキサロ酢酸とアセチルCoAが生成することを示した。さらに、ADPは自己リン酸化された酵素と可逆的に反応してATPを再生することにより競争的に酵素反応を阻害することを示した。一方で、本菌ゲノムにはTCA回路の鍵酵素であるcitrate synthase(CS)の相同遺伝子が存在することを見いだした。CSは還元的TCA回路によるCO_2固定を阻害すると予想されることから、その発現および発現産物について検討した。本遺伝子産物は大腸菌由来CSと45%の相同性を示し、その組換え型酵素は確かにCS活性を示した。さらに本菌において本遺伝子が転写・翻訳されていることを見いだした。酵素的性質について検討したところ、本酵素はAMPおよびADPによって強く活性化されたことから、細胞内のエネルギー状態に応じた還元的TCA回路/TCA回路の方向や速度の調節に機能していることが推測された。また、CO_2固定酵素の一つであるisocitrate dehydrogenaseの遺伝子クローニングおよび生化学的解析を行った。本酵素は、多くの生物に存在するダイマー型とは異なるモノマー型酵素であり、中性付近では脱炭酸活性と同程度の炭酸固定活性を示すこと、オキサロ酢酸によって競争阻害を受けることを明らかとした。
期刊论文(5)
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会议论文
T.Kanao, T.Fukui, H.Atomi, T.Imanaka: "ATP-citrate lyase from the green sulfur bacterium Chlorobium limicola is a heteromeric enzyme composed of two distinct gene products"Eur. J. Biochemistry. 268. 1670-1678 (2001)
T.Kanao、T.Fukui、H.Atomi、T.Imanaka:“来自绿色硫细菌 Chlorobium limicola 的 ATP-柠檬酸裂解酶是一种由两种不同基因产物组成的异聚酶”Eur。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
T.Kanao, M.Kawamura, T.Fukui, H.Atomi, T.Imanaka: "Charcterization of isocitrate dehydrogenase from the green sulfur bacterium Chlorobium limicola : a carbon dioxide-fixing enzyme in the reductive tricarboxylic acid cycle"Eur. J. Biochemistry. 269. 1926-1
T.Kanao、M.Kawamura、T.Fukui、H.Atomi、T.Imanaka:“来自绿色硫细菌 Chlorobium limicola 的异柠檬酸脱氢酶的表征:还原三羧酸循环中的二氧化碳固定酶”Eur。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
T.Kanao, T.Fukui, H.Atomi, T.Imanaka: "Kinetic and biochemical analyses on the reaction mechanism of a bacterial ATP-citrate lyase"Eur. J. Biochemistry. 269. 3409-3416 (2002)
T.Kanao、T.Fukui、H.Atomi、T.Imanaka:“细菌 ATP-柠檬酸裂解酶反应机制的动力学和生化分析”Eur。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
T.Kanao, M.Kawamura, T.Fukui, H.Atomi, T.Imanaka: "Charcterization of isocitrate dehydrogenase from the green sulfur bacterium Chlorobium limicola : a carbon dioxide-fixing enzyme in the reductive tricarboxylic acid cycle"Eur. J. Biochemistry. (in press).
T.Kanao、M.Kawamura、T.Fukui、H.Atomi、T.Imanaka:“来自绿色硫细菌 Chlorobium limicola 的异柠檬酸脱氢酶的表征:还原三羧酸循环中的二氧化碳固定酶”Eur。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
超好熱性アーキアへのFd依存型嫌気的TCAサイクルの実装と水素生産への利用
  • 批准号:
    23K23502
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $5.49万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    福居 俊昭
  • 依托单位:
超好熱性アーキアへのFd依存型嫌気的TCAサイクルの実装と水素生産への利用
  • 批准号:
    22H02235
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $10.98万
  • 财政年份:
    2022
  • 负责人:
    福居 俊昭
  • 依托单位:
Bioplastic production by hydrogen-oxidizing bacterium under microaerobic condition
  • 批准号:
    21F20100
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.47万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    福居 俊昭
  • 依托单位:
水素酸化細菌を用いた微好気条件でのバイオプラスチック生合成
  • 批准号:
    20F20100
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.47万
  • 财政年份:
    2020
  • 负责人:
    福居 俊昭
  • 依托单位: