新メチル化解析法を用いた皮膚老化に関する遺伝子のメチル化の解析

使用新的甲基化分析方法分析与皮肤衰老相关的基因的甲基化

• 批准号: 13770440
• 负责人: 宮村 佳典
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 2002
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13770440/
• 关键词: 老化; 皮膚; メチル化; 遺伝性対側性色素異常症; モザイク; SNP; Single Base Extension法; ダイレクトシーケンス

本研究の目的は老化と皮膚のメチル化との関係を調べることである。平成13年度はメチル化の解析に関して存在していた技術上の問題を、実験手法の改良により改善することに成功している。平成14年度にはメチル化の解析を開始する予定であったが、健常者サンプルの収集が未だ不十分であった。一方、本講座で行われている、モザイク様の色素斑、脱色素斑を形成する疾患である遺伝性対側性色素異常症(Dyschromatosis Symmetrica Hereditaria以下DSHと略。)の研究及び、近年発表されたモザイクとDNAメチル化の研究から、DSHの発症に老化とメチル化が関与するのではないかとの発想に至った。また皮膚におけるモザイク構造の解明をしないまま、漫然と皮膚全体におけるメチル化を調べることでは、加齢現象を明らかにはできないのではないかと考えた。そこで平成14年度は、加齢によりモザイク状に現れる色素斑、脱色素斑とDNAメチル化に関して明らかにする前段階として、DSHの原因遺伝子の発見を目的とした研究をおこなった。具体的にはDSH原因遺伝子の発見のため、DSH候補領域内に存在しDSHの原因と考えられそうな遺伝子配列を、Beckman社のDTCS kitと同社のCEQ2000XL Genetic Analyzerを用いてダイレクトシーケンスを行い、変異及びSNPに関して調べた。また、DSH候補領域内の既知SNPに関しては、ABI杜のHuman Assays-on-Demand^<TM> SNP Genotyping Productsと、同社のABI PRISM【○!R】 7700 Sequence Detection Systemを用い、判定を行った。その結果変異こそ見つからなかったものの、SNPとこれまで調べられたハプロタイプ及び家系のデータを統合することで、約800kbであったDSH原因遺伝子の候補領域を約350kbに縮めることができた。

The objective of this study is to <s:1> aging と skin メチ メチ と and と related to を regulation べる とである とである とである. Pp.47-53 13 year は メ チ ル change の parsing に masato し て exist し て い た の technical problems を, be 験 technique improved の に よ り improve す る こ と に successful し て い る. Pp.47-53 14 year に は メ チ ル chemical analytical を の began す る designated で あ っ た が, health often サ ン プ ル の 収 set が not だ not very で あ っ た. One party, this lecture で わ れ て い る, モ ザ イ ク others の pigment spots and pigment spots off を form す る disorders で あ る heritage 伝 laterality seaborne pigment from abnormal syndrome (Dyschromatosis Symmetrica Hereditaria following DSH と slightly.) Research and び の, in recent years, 発 table さ れ た モ ザ イ ク と DNA メ チ ル change の research か ら, DSH の 発 disease に aging と メ チ ル change が masato and す る の で は な い か と の 発 に as っ た. ま た skin に お け る モ ザ イ ク tectonic の interpret を し な い ま ま, diffuse however と skin all に お け る メ チ ル change を adjustable べ る こ と で は, plus 齢 phenomenon を Ming ら か に は で き な い の で は な い か と exam え た. 14 year は そ こ で pp.47-53, plus 齢 に よ り モ ザ イ ク shape に now れ る pigment spots and pigment spots off と DNA メ チ ル change に masato し て Ming ら か に す る earlier order と し て, DSH の reason but 伝 child の 発 see を purpose と し た research を お こ な っ た. Cause of specific に は DSH survived 伝 の 発 see の た に め, DSH alternate field exist し DSH の reason と exam え ら れ そ う な heritage 伝 with sequence を, Beckman の DTCS kit と with club の CEQ2000XL based condition Analyzer を with い て ダ イ レ ク ト シ ー ケ ン ス を い, - vision and び SNP に masato し て adjustable べ た. Youdaoplaceholder0, in the DSH candidate field, <s:1> known SNPに is related to て て, ABI du<s:1> Human assay-on-demand ^<TM> SNP Genotyping Productsと, the same company <s:1> ABI PRISM [〇!] R】 7700 Sequence Detection Systemを uses を to determine を rows った. そ の result - different こ そ see つ か ら な か っ た も の の, SNP と こ れ ま で adjustable べ ら れ た ハ プ ロ タ イ プ and び family の デ ー タ を integration す る こ と で, about 800 KB で あ っ た cause of DSH survived 伝 を の alternate field about 350 KB に shrinkage め る こ と が で き た.

项目成果

E.Nakamura et al.: "A novel mutation of the tyrosinase gene causing oculocutaneous albinism type 1 (OCA1)"J. Dermatol. Sci.. 28・2. 106-110 (2002)

E. Nakamura 等：“酪氨酸酶基因的新突变导致 1 型眼皮肤白化病 (OCA1)” J. Dermatol. 28・2 (2002)。

M.Tanita et al.: "Polymorphic sequences of the tyrosinase gene : Allele analysis on 16 OCA patients in Japan indicated that three polymorphic sequence in the tyrosinase gene promoter could be powerful markers for indirect gene diagnosis"J. Hum. Gemet.. 47

M.Tanita 等人：“酪氨酸酶基因的多态性序列：对日本 16 名 OCA 患者的等位基因分析表明，酪氨酸酶基因启动子中的三个多态性序列可以成为间接基因诊断的有力标记”J.

Nakamura E: "A novel mutation of the tyrosinase gene causing oculocutaneous albinism type 1(OCA1)"J Dermatol Sci.. 28・2. 102-105 (2002)

Nakamura E：“引起眼皮肤白化病1型（OCA1）的酪氨酸酶基因的新突变”J Dermatol Sci.. 28・2（2002）。

Tanita M: "Polymorphic sequences of the tyrosinase gene : allele analysis on 16 OCA1 patients in Japan indicate that three polymorphic sequences in the tyrosinase gene promoter could be powerful markers for indirect diagnosis"J Hum Genet.. 47・1. 1-6 (2002

Tanita M：“酪氨酸酶基因的多态性序列：对日本 16 名 OCA1 患者的等位基因分析表明，酪氨酸酶基因启动子中的三个多态性序列可以成为间接诊断的有力标记”J Hum Genet.. 47・1（ 2002年