SNPを用いたハプロタイプ解析による遺伝性対側性色素異常症原因遺伝子の解明

通过使用 SNP 进行单倍型分析来阐明遗传性​​对侧色素沉着障碍的致病基因

• 批准号: 15790575
• 负责人: 宮村 佳典
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15790575/
• 关键词: DSH; SNP; ハプロタイプ解析; TaqMAN法; DNAシーケンス; SSCP; DSRAD; mutation

本年度、本研究はまず、遺伝性対側性色素異常症(Dyschromatosis Symmetrica Hereditaria,以降DSHと略す。)の候補領域を絞り込むことから始まった。具体的には、これまで連鎖解析によって分かっていた、DSHの候補領域内にある既知のSNP及び新しく見つかったSNPを用いてハプロタイプ解析を行い、DSH家系内において原因遺伝子との間に組換えを起こしている箇所を明らかにした。この際既知のSNPはTaqMAN法を用いてgenotypingし、未知のSNPはDNAシーケンス法で発見、genotypingした。その結果候補領域を数百kbの範囲に絞り込むことに成功した。続いて、この候補領域内にある遺伝子を対象に、SSCP解析及びDNAシーケンス法を用いて遺伝子内のmutationを調べ、double-stranded RNA-specific adenosine deaminase (DSRAD)をコードする遺伝子においてmutationを発見、これをDSHの原因遺伝子として同定し"Mutations of the RNA-specific adenosine deaminase gene (DSRAD) are involved in dyschromatosis symmetrica hereditaria."のタイトルでAm J Hum Genet. 2003 Sep;73(3):693-9.に発表した。以上により、DSHの原因遺伝子は発見され、平成15年度科研費を用いて行われた本研究の目的は達成された。

今年，这项研究首先缩小了遗传对侧色素病的候选区域（异型症对称性疾病遗传性，以下简称为DSH）。具体而言，使用已知的SNP和新发现的DSH候选区域中的SNP进行了单倍型分析，该区域以前通过链接分析已知，以揭示DSH家族中正在与病因基因重组的位置。目前，已知的SNP是使用Taqman方法的基因分型，并发现了未知的SNP并使用DNA测序方法进行基因分型。结果，我们能够将候选区域缩小到数百kb的范围。接下来，使用SSCP分析和DNA测序方法检查了该候选区域内的基因，以检查基因内的突变，并在编码双链RNA RNA特异性腺苷脱氨酶（DSRAD）的基因中发现了突变，该基因被鉴定为DSH的引起基因，并在Am J Hum Jum Junet中被鉴定为Causative Gene。 2003年9月; 73（3）：693-9。 DSH基因的上述发现以及使用2003财年研究基金进行的这项研究的目的。

项目成果

Yoshinori Miyamura et al.: "Mutations of the RNA-Specific Adenosine Deaminase Gene (DSRAD) Are Involved in Dyschromatosis Symmetrica Hereditaria."American Journal of Human Genetics. 73・3. 693-699 (2003)

Yoshinori Miyamura 等：“RNA 特异性腺苷脱氨酶基因 (DSRAD) 的突变与对称性遗传性色素异常有关。”美国人类遗传学杂志 73・3 (2003)。