生体反応の高次構造認識における糖鎖コドンの化学的解明

生物反应高阶结构识别中糖链密码子的化学解析

• 批准号: 13898018
• 负责人: 古川 清
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Tokyo Metropolitan Institute of Gerontology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13898018/
• 关键词: 複合糖質; 糖鎖コドン; タンパク質との作用; 高次構造認識; 計算科学; 構造生物学; 超機能性糖鎖; 生体応用

今日ではポストゲノム研究としてプロテオーム研究が活発に行われているが、プロテオーム研究の究極は、結合している糖鎖の機能の如何に関わっている。生体で作られる多くのタンパク質に糖鎖は結合しており、糖鎖との関係を明確にしないとタンパク質の機能解析はできないと考えられる。本研究班では、タンパク質と糖鎖の分子内および分子問の相互作用系に焦点をあてて、タンパク質や脂質に結合した糖鎖がタンパク質とどのような相互作用でタンパク質の機能を制御しているかを、分子レベルで解明する研究グループを立ち上げるための準備を行うことにある。そこで全体会議、国際シンポジウムと数回の幹事会を開催し、本研究分野の現状と各班員の準備状況を報告し確認した。さらにこれらの会議を通して、今後の研究対象とすべきバイオシステムを選択し、分子内相互作用系としてはマトリックスタンパク質のレセプターであるインテグリンとこれに結合した糖鎖の機能を、また分子間相互作用系としては、N-アセチルグルコサミンと結合するNa^+/K^+-ATPase β1-サブユニットや、シアル酸クラスターと結合する白血球表面のCD38を扱うこととした。これらのバイオシステムで、1)糖鎖がタンパク質と相互作用をする時は、まず糖鎖とタンパク質が電気的相互作用で特異的に認識し、2)これに糖の持つ豊富な水酸基による水素結合が加わり、タンパク質とより安定な複合体を形成することで、特異的認識と動的柔軟性をそなえた高次認識が完成するという作業仮説を設定し、NMR, X線結晶構造解析,計算化学などの手法を用いて、認識の化学的実体を明らかにするため、特定領域研究を申請した。またこうしたアプローチの妥当性をNADase活性をもつCD38に関して共同研究を開始し、分子軌道法などの計算化学により、NADとシアル酸クラスターが類似した分子構造をとり得ることを明らかした。

Today's research is about how to integrate the functions of sugar locks into the development process. The relationship between sugar chain and sugar chain is clear, and the function of sugar chain is analyzed. This study focuses on the molecular and molecular interaction system of carbohydrate and lipid binding, carbohydrate and lipid binding, carbohydrate and lipid interaction, and molecular interaction. The plenary session, the international conference, the conference of several directors, the status of the research division and the preparation status of each class member were confirmed. For future research, the target is to select the intramolecular interaction system, bind the carbohydrate chain function, and bind the Na ^+/K ^+-ATPase β 1-chain. CD38 on the surface of white blood cells 1) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 2) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 3) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 4) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 5) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 6) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 7) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 8) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 9) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 10) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 11) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 12) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 13) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 14) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 15) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 16) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 17) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 18) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 19) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance; 19) Specific understanding of the interaction between carbohydrate and substance X-ray crystal structure analysis, computational chemistry, application of methods, understanding of chemical reality, application of specific field research The activity of NADase is closely related to CD38, and the molecular orbital method is used to calculate the chemical properties of NADase.

项目成果

Harada, T.: "Application of combined reagent solution to the oxidative refolding of recombinant human interleukin 6."Chem. Pharm, Bull.. 49. 1128-1131 (2001)

Harada, T.：“组合试剂溶液在重组人白细胞介素 6 氧化重折叠中的应用。”Chem.

Hara-Yokoyama, M.: "Complex ganglioside as cell surface inhibitors for the ecto-NAD^+ glyco-hydrolase of CD38."Biochemistry. 40(4). 888-895 (2001)

Hara-Yokoyama，M.：“复合神经节苷脂作为 CD38 的外 NAD 糖水解酶的细胞表面抑制剂。”生物化学。

Uchibori-Iwaki, H.: "The changes in glycosylation after partial hepatectomy enhance collagen binding of vitronectin in plasma."Glycobiology. 10(9). 865-874 (2000)

Uchibori-Iwaki, H.：“部分肝切除术后糖基化的变化增强了血浆中玻连蛋白的胶原蛋白结合。”糖生物学。