第一原理分子動力学計算による3価および4価アクチノイドイオンの水和構造解明
使用第一原理分子动力学计算阐明三价和四价锕系离子的水合结构
基本信息
- 批准号:14780403
- 负责人:
- 金额:$ 1.28万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2002
- 资助国家:日本
- 起止时间:2002 至 2003
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
第一原理計算により求めた4価アクチノイドイオンのポテンシャルを用いて、分子動力学計算を行った。MD計算にはAMBER6.0プログラムを用いた。[Th(H_2O)_9]^<4+>と[Th(H_2O)_<10>]^<4+>の電荷の計算にはESP法を用いた。Thと第一水和圏の水分子のHのLJパラメータは0とし、第一水和圏の水分子のOのLJパラメータはR_<o_I>^*=2.0Åandε_<o_I>=0.08kcal/molとした。MD計算の際に、溶質(ここでは[Th(H_2O)_9]^<4+>か[Th(H_2O)_<10>]^<4+>)の位置を固定しておこなった。周期境界条件を用い、0.2フェムト秒きざみで1atmの条件で1500ピコ秒のMDシミュレーションを行った。[Th(H_2O)_9]^<4+>では、Cl^-濃度が0.39Mから4.57Mにあがると、配位するCl^-の数が0.0から5.6にと増加し、また配位するOの数も15.7へと減少する。[Th(H_2O)_<10>]^<4+>では、Cl^-濃度が0.32Mから5.00Mにあがると、配位するCl^-の数が0.0から3.9にと増加し、また配位するOの数も16.7へと減少する。このことから、Cl^-濃度が高くなると、Cl^-分子が水分子と置き換わり、しかし全体の配位数はほぼ変わらないものと考えられる。第二水和圏の配位数は19〜21の値を取るものと考えられる。温度の効果についても調べた。50℃および75℃について、シミュレーションを行った。その結果、温度が上昇すると、配位数が減少する傾向が明確に見られた。さらには、温度が高い条件では、Cl-濃度が低いうちでもCl-が第二水和圏に入り込むことが明らかにされた。
First principles calculations, molecular dynamics calculations MD calculation is AMBER6.0. [Th(H[Th(H_2O)_9]^<4 +> and [Th(H_2O)_9<10>]^<4+>. The water molecules of the first water and the second water molecules of the first water and the third water molecules of the first water and the third water molecules of the first water molecules of the first water <o_I>and the third water molecules of the first water molecules of the first water molecules <o_I>of When MD is calculated, the position of solute ([Th(H_2O)_9]^<4+>[Th(H_2O)_<10>]^<4+>) is fixed. The periodic boundary condition is 0.2 ° C, 1 ° C, and the MD condition is 1500 ° C. [Th(H The concentration of Cl^-increased from 0.39M to 4.57M, and the number of coordinated Cl^-increased from 0.0 to 5.6, and the number of coordinated O decreased from 15.7 to 15.7. [Th(H The <10>concentration of Cl^-increased from 0.32M to 5.00M, the number of coordinated Cl^-increased from 0.0 to 3.9, and the number of coordinated O decreased from 16.7. The concentration of Cl ^-is high, Cl^-molecule is high, Cl^-molecule is high, Cl ^- The coordination number of the second water coordination ring is 19 ~ 21. Temperature and effect are regulated. The temperature ranges from 50℃ to 75℃, and the temperature is constant. As a result, the temperature increases and the coordination number decreases. The temperature is high, the Cl-concentration is low, the Cl-concentration is low, the Cl-concentration is high, the Cl-concentration is low, and the Cl-concentration is high.
项目成果
期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
楊天笑, 津島悟, 鈴木篤之: "Chloride Concentrating and Temperature Effects on the Hydration of Th(IV) Ion"Chemical Physics Letters. 360. 534-542 (2002)
杨天洲、津岛悟、铃木厚幸:“氯化物浓缩和温度对 Th(IV) 离子水合的影响”化学物理快报 360. 534-542 (2002)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Tianxiao Yang, Satoru Tsushima, Atsuyuki Suzuki: "Chloride Concentration and Temperature Effect on the Hydration of Th(IV) Ion Molecular Dynamics Study"Chemical Physics Letters. 360. 534-542 (2002)
天晓阳、Satoru Tsushima、Atsuyuki Suzuki:“氯化物浓度和温度对Th(IV)离子水合分子动力学研究”化学物理快报。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
津島 悟其他文献
津島 悟的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('津島 悟', 18)}}的其他基金
標的アイソトープ治療のためのキレート剤の開発
开发用于靶向同位素治疗的螯合剂
- 批准号:
24K01398 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
核燃料物質選択的沈殿剤開発のための日独アクチノイド化学共同研究拠点
日德锕系化学联合研究中心开发核燃料材料选择性沉淀剂
- 批准号:
20KK0119 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
酸化物粒子表面におけるウランの存在化学状態解明
阐明氧化物颗粒表面铀的化学状态
- 批准号:
12780379 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
分子動力学計算と連続体計算の協働で紐解く界面活性剤添加による乱流抑制の物理機構
通过分子动力学和连续介质计算的协作揭示添加表面活性剂抑制湍流的物理机制
- 批准号:
24KJ0109 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
鉱物の水素同位体効果の解明:第一原理経路積分分子動力学計算法と高圧実験による展開
阐明矿物中的氢同位素效应:通过第一原理路径积分分子动力学计算和高压实验进行开发
- 批准号:
23K25969 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
共溶媒分子動力学計算を用いた薬剤標的タンパク質の選抜と環状ペプチド設計の同時実行
使用共溶剂分子动力学计算同时执行药物靶蛋白选择和环肽设计
- 批准号:
23K28185 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
分子動力学計算に基づくノンコーディングRNAの立体構造予測
基于分子动力学计算的非编码RNA 3D结构预测
- 批准号:
22KJ0421 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
全原子分子動力学計算による高分子溶解メカニズムの解明
利用全原子分子动力学计算阐明聚合物溶解机理
- 批准号:
23K04855 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
分子動力学計算によるアミノ酸変異タンパク質複合体の結合自由エネルギーシフトの予測
通过分子动力学计算预测氨基酸突变蛋白复合物的结合自由能位移
- 批准号:
23K03339 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
生体イオン濃度を再現した第一原理分子動力学計算:イオン水和の電子状態ゆらぎ解明
重现生物离子浓度的第一原理分子动力学计算:阐明离子水合中的电子态波动
- 批准号:
23K13711 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
分子動力学計算とモデル生物で導き出す減数分裂開始機構の実態
使用分子动力学计算和模型生物得出的减数分裂启动机制的实际状态
- 批准号:
23K05023 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
分子動力学計算を利用した新規膜貫通ペプチド会合体のde novo設計
使用分子动力学计算从头设计新型跨膜肽复合物
- 批准号:
21J40162 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
分子動力学計算と機械学習を援用してタンパク質の構造変化を予測する
使用分子动力学计算和机器学习预测蛋白质结构变化
- 批准号:
21K06094 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)














{{item.name}}会员




