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クロマチン構造制御におけるDNA高次構造の役割の1分子DNA微小操作を用いた解析

利用单分子DNA显微操作分析DNA构象在调节染色质结构中的作用

基本信息

批准号：
03J01258
负责人：
松浦俊一
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Tokyo University of Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

これまでクロマチン構成因子であるコアヒストンの可逆的な化学修飾が遺伝子発現制御に与える影響など、ヒストンタンパク質を中心とした機能解析が盛んに行われているが、詳細な反応機構については未だ解明されていない点も残されている。そこで、顕微鏡視野内においてDNA1分子レベルでのヌクレオソームの挙動をリアルタイムで蛍光観測できればクロマチン構造変換の動態をさらに詳細に解析できると考えられる。本研究では1分子レベルでのDNA-ヒストン間相互作用を蛍光共鳴エネルギー移動(Fluorescence Resonance Energy Transfer ; FRET)により解析する手法を提案している。本手法では、DNA分子(5SrDNA)のみを単一の蛍光物質で標識し、鶏赤血球由来コアヒストン(H2A,H2B,H3,H4)を用いたモノヌクレソーム再構成を行った場合に、DNAに標識した蛍光物質どうしが近接した時に生じるHomotransfer FRETを指標にした解析を行う。まず、1分子レベルで観測する前に、モノヌクレソーム再構成に与えるDNAの蛍光標識の影響をゲルシフトおよびMNaseアッセイによって解析した結果、蛍光標識は再構成を阻害しないことが示された。次にDNA-ヒストン複合体をHomotransfer FRETにより観測した結果、ヒストン濃度の増大にともない蛍光強度が著しく低下することが示された。この時、配列依存的な均一なモノヌクレソームを形成した場合のみ特徴的な蛍光強度をもつスペクトルを示した。一方、再構成後のモノヌクレソームに対して塩濃度の影響を検討した結果、塩の増加に伴って蛍光強度が増大した。これは塩濃度の上昇にともないヒストンからDNAが解離し、Homotransfer FRETが解消したことを示している。以上の結果は、DNA-ヒストン複合体の形態の違い(モノヌクレソームの凝縮と弛緩)を蛍光強度によって評価できることを示唆している。本研究の成果は、第28回日本分子生物学会年会にて発表を行った。

In this paper, the influence of the factors on the reversible chemical repair system is analyzed, and the results are analyzed in the center of the system, which can be used to analyze the performance of the system. The anti-virus mechanism is not clear that the problem is not clear. In the field of televisions and micro-televisions, the DNA1 molecules do not need to be detected. In the field of television, there are no changes in the state of affairs, and in the field of micro-television. in the field of television, there are no information on the molecular weight of the computer. In this study, molecular analysis of DNA-to-DNA interaction by photoluminescence (Fluorescence Resonance Energy Transfer; FRET) was carried out to analyze the proposed method of DNA-DNA interaction. In this technique, the DNA molecule (5SrDNA) is used to detect the origin of red blood cells (H2A, H2B, H3, H4). In this technique, the DNA molecule (5SrDNA) is used to determine the origin of red blood cells (H2A, H2B, H3, H4, H4, H2B, H2B, H3, H4, H4, H2B, H3, H4, H In the first place, one molecule of light information is reorganized into DNA images, and the results are analyzed. The results are analyzed, and the light tags are reorganized to show that they are harmful. The results of the secondary DNA- complex, the Homotransfer FRET complex, the light intensity, the light intensity. At the same time, the column-dependent system is used to form a special light intensity display. On the one hand, after the formation of the system, the intensity of the system will affect the results of the results, and increase the intensity of the light. The DNA is detached, the Homotransfer FRET is resolved, and the temperature is displayed. The above results show that the DNA- complex has a significant effect on the shape and shape of the complex. The results of this study and the 28th annual meeting of the Japanese Society for Molecular Biology are listed in the table.