糖質関連酵素の結晶構造解析

碳水化合物相关酶的晶体结构分析

• 批准号: 03J11327
• 负责人: 日高 將文
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03J11327/
• 关键词: X線結晶構造解析; 加リン酸分解酵素; 糖質関連酵素; 構造機能相関; 糖鎖工学

糖鎖の伸長、分解に関連する酵素は、アミノ酸配列に基づいて5つの群、100以上のファミリーに分類されているが、多くのファミリー間で立体構造の相同性が見出されている。本研究は、糖質関連酵素の立体構造を解明することで、ファミリー間の構造機能相関を明らかにすることを目的としている。本年度は、前年度に明らかにした糖質加水分解酵素群ファミリー94(GH-94)に分類される加リン酸分解酵素Vibrio proteolyticus由来キトビオースホスホリラーゼ(ChBP)の立体構造を基に、同じくGH-94に分類される加リン酸分解酵素Cellvibrio gilvus由来セロビオースホスリラーゼ(CgCBP)の構造解析を行った。その結果、CgCBPのグルコース・硫酸複合体構造を2.0Å、グルコース・グリセロール・リン酸複合体構造を2.1Å分解能で明らかにした。後者は、GH-94で初めてのリン酸複合体構造であり、これまで不明だったGH-94のリン酸認識残基を同定した。また、ChBPとCgCBPの構造比較から、両者の基質特異性を決定しているアミノ酸残基を特定した。CgCBPはGH-94酵素では最も詳細な解析が行われてきた酵素であり、セロビオースや分岐三糖など有用オリゴ糖合成への応用が考案されている。本研究による立体構造の解明により、更なる研究の発展が期待される。CgCBPの結晶化およびX線回折データ測定の結果は、科学誌Acta Crystallographica Section Dに発表した。またCgCBPの構造解析の結果について、投稿準備中である。

Sugar lock の elongation, decomposition に masato even す る enzyme は, ア ミ ノ acid with column に base づ い て 5 つ の group, more than 100 の フ ァ ミ リ ー に classification さ れ て い る が, multiple く の フ ァ ミ リ ー で between three-dimensional structure の phase out gay が さ れ て い る. This study は, sugar masato even enzyme の three-dimensional structure を interpret す る こ と で, フ ァ ミ リ ー の between function of tectonic facies masato を Ming ら か に す る こ と を purpose と し て い る. は this year, before the annual に Ming ら か に し た sugar hydrolysis enzyme group フ ァ ミ リ ー 94 (GH - 94) に classification さ れ る plus リ ン Vibrio acid decomposition enzymes Proteolyticus origin キ ト ビ オ ー ス ホ ス ホ リ ラ ー ゼ (ChBP) の three-dimensional structure を に, with じ く GH - 94 に classification さ れ る plus リ ン acid decomposition enzyme Cellvibrio gilvus origin セ ロ ビ オ ー ス ホ ス リ ラ ー ゼ (CgCBP) の structure line を っ た. そ の results, CgCBP の グ ル コ ー ス を 2.0 A sulfuric acid complex structure, グ ル コ ー ス · グ リ セ ロ ー ル · リ ン acid complex tectonic を 2.1 A decomposition can で Ming ら か に し た. At the beginning of the latter は, GH - 94 で め て の リ ン acid complex tectonic で あ り, こ れ ま で unknown だ っ た GH - 94 の リ know ン acid residues を with fixed し た. ま た, ChBP と CgCBP の structure comparison か ら, struck の substrate specificity を decided し て い る ア ミ ノ acid residues を specific し た. CgCBP は GH - 94 enzyme で は も most detailed analytical line が わ な れ て き た enzyme で あ り, セ ロ ビ オ ー ス や divides three sugar な ど useful オ リ ゴ sugar synthesis へ の 応 が test case さ れ て い る. In this study, the three-dimensional structure of による is explained によ によ, and further research is conducted on なる. The development of が is expected to be される. The <s:1> results of CgCBP <s:1> crystallization および X-ray backfolding デ <s:1> タ タ determination and Acta Crystallographica Section Dに are presented as <s:1> た. Youdaoplaceholder0 CgCBP <s:1> construction analysis <e:1> result に て て て submission preparation である.

项目成果

Crystallization and preliminary X-ray analysis of cellobiose phosphorylase from Cellvibrio gilvus

绿色细胞弧菌纤维二糖磷酸化酶的结晶和初步 X 射线分析

• 发表时间: 2004
• 期刊: Acta Cryst. D60(10)
• 作者: M.Hidaka et al.;A.Miyanaga et al.;M.Hidaka et al.
• 通讯作者: M.Hidaka et al.