発現遺伝子チップを用いたメダカ突然変異体の発現プロファイルの解析

使用表达基因芯片分析青鳉突变体的表达谱

• 批准号: 03J61537
• 负责人: 横井 勇人
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03J61537/
• 关键词: メダカ; 発現プロファイル; DNAチップ; マイクロアレイ; 突然変異体

現在ゲノム特定領域研究においてメダカのゲノム解析、および初期胚で発現する遺伝子の網羅的単離が進行している。本研究は発現遺伝子群のDNAチップ化と突然変異体における発現プロファイル解析系の確立を目指している。本年度は完成したメダカDNAチップを用いて、メダカ突然変異体headfishの遺伝子発現プロファイルを解析した。headfish変異体は胴尾部を欠失しているが、頭部はほぼ正常に形成されるため、DNAチップを用いて野生型胚と遺伝子発現プロファイルを比較することにより、胴尾部の形成に重要な遺伝子を網羅的に単離できることが期待された。メダカDNAチップ(メダカマイクロアレイ8000)は、メダカESTプロジェクトで単離・登録されているデータベースから8,000クラスターのESTを選出して作成したものである。すでに野生型胚における遺伝子発現プロファイルを解析し、これまでにin situ hybridization法により解析された遺伝子発現パターンと一致していることを確認している。headfish変異体は発生初期から中胚葉組織に異常を示し、孵化期には胴尾部の大部分を欠損する。表現型の解析からheadfishでは胴尾部に分化する中胚葉細胞を供給する尾芽の性質が異常になっていることが示唆された。遺伝学的解析により、headfishの原因遺伝子がfibroblast growth factor receptor 1(fgfr1)であることが判明した。DNAチップを用いて解析した結果、fgfr1の下流因子について、正に制御されているもの、負に制御されているもの、それぞれについて数多くの候補遺伝子のデータを得ることができた。その中にはFGFシグナルによって誘導されることが知られているspadetail/tbx16も含まれていた。今後得られたデータをさらに精査することにより、FGFシグナルによって制御される遺伝子の全体像を把握することができると考えている。

Now it is necessary to carry out the research on specific fields, including the analysis of the application, the initial development and the separation of the genetic network. This study aims to establish a protocol analysis system for the discovery of DNA mutations and sudden mutations in genetic subgroups. This year, we completed the analysis of the genetic diversity of fish. The head of the fish is normally formed when the tail of the fish is missing. The head of the fish is normally formed when the tail of the fish is missing. The head of the fish is normally formed when the tail of the fish is missing.メダカDNAチップ(メダカマイクロアレイ8,000)は、メダカESTプロジェクトで単离·登录されているデータベースから8,000クラスターのESTを选出して作成したものである。The wild type embryo was identified by the method of site hybridization. In the early stage of development, the embryo tissue of headfish is abnormal, and most of the tail is damaged during incubation. Phenotype analysis: headfish, tail differentiation, mesodermal cell supply, tail bud properties, and tail differentiation. Genetic analysis of the cause of the fish, the fibroblast growth factor receptor 1(fgfr1), and so on. DNA analysis results, fgfr1 downstream factors, positive control, negative control, multiple candidate genes In addition to the above, it is also possible to increase the efficiency of the system. In the future, we will carefully examine the contents of this document and examine the contents of this document.

项目成果

Possible roles of zic1 and zic4, identified within the medaka Double anal fin (Da) locus, in dorsoventral patterning of the trunk-tail region (related to phenotypes of the Da mutant).

zic1 和 zic4 在青鳉双肛鳍 (Da) 基因座中鉴定出的可能作用，在躯干尾部区域的背腹侧模式中（与 Da 突变体的表型相关）。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Mech.Dev. 121(7-8)
• 作者: Ohtsuka;M.;Kikuchi;N.;Yokoi;H.;Kinoshita;M.;Wakamatsu;Y.;Ozato;K.;Wittbrodt;J.;Takeda;H.;Inoko;H.;Kimura;M.
• 通讯作者: M.

A mutation in the gene for delta-aminolevulinic acid dehydratase (ALAD) causes hypochromic anemia in the medaka, Oryzias latipes.

δ-氨基乙酰丙酸脱水酶（ALAD）基因的突变会导致青鳉鱼（Oryzias latipes）出现低色素性贫血。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Mechanism of Development 121
• 作者: Yasutake J. et al.;Kudo H.et al.;Sakamoto D. et al.
• 通讯作者: Sakamoto D. et al.