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Studies on functional domains essential for the retrotransposition of LINE

LINE逆转录转座必需功能域的研究

基本信息

批准号：
15370003
负责人：
FUJIWARA Haruhiko
金额：
$ 7.3万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2005
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15370003/
关键词：
non-LTR retrotransposon LINE endonuclease telomere target specific LINE reverse transcriptase rDNA specific LINE retrotransposition mechanism 部位特異的レトロトランスポジ RNP複合体構造 28SrDNA 転移機構レトロトランスポジション SART ORF1

项目摘要

During the project term, we clarified the essential domains for the retrotranspositions of LINE, using mainly telomere specific LINE SART1, as shown below (1 to 3, TRAS1 for 4, R1 for 5).1. We found novel domains NLS and telomere accession signals in ORF1 proteins in SART1 (Matsumoto, T., et al.Mol.Cell Biol. 24,105-122. (2004)).2. We found eukaryotic translational coupling for the regulation of ORF1 and ORF2 translation in SART1 (Kojima, KK.et al.Mol.Cell.Biol.25, 7675-7686. (2005)).3. We clarified the 3'UTR structure which is recognized by reversetranscription unit of SART1 (Osanai, M., et al.Mol.Cell Biol.24, 7902-7913. (2004)).4. Collaborating with Dr.Maita in Kyusyu Univ., we firstly reported the crystal structure of endonuclease domain of TRAS1 (Maita, N., et al.J.Biol.Chem.279, 41067-41076. (2004)).5.We established the retrotransposion assay system for 28SrDNA specific LINE, R1, which enable us to use several target specific LINE, telomere specific LINEs, SART1 and TRAS1,and rDNA specific R1,for future analysis (Anzai T., et al.Nucleic Acids Res.33, 1993-2002. (2005)).

在项目期间，我们主要使用端粒特异性LINE SART 1阐明了LINE逆转录转座的重要结构域，如下所示（1至3，TRAS 1为4，R1为5）。我们在SART 1的ORF 1蛋白中发现了新的结构域NLS和端粒加入信号（松本，T.，等，分子细胞生物学，24，105 -122。（2004年）。我们发现了用于调节SART 1中ORF 1和ORF 2翻译的真核翻译偶联（Kojima，KK.et al.Mol.Cell.Biol.25，7675-7686.（2005年）。我们阐明了由SART 1的逆转录单位识别的3 'UTR结构（Osanai，M.，等人，分子细胞生物学，24，7902-7913。（2004年）。与九州大学的Maita博士合作，我们首先报道了TRAS 1的核酸内切酶结构域的晶体结构（Maita，N.，等J. Biol. Chem. 279，41067-41076。（2004））。5.我们建立了28 SrDNA特异性LINE R1的逆转录转座测定系统，这使得我们能够使用几种靶特异性LINE、端粒特异性LINE、SART 1和TRAS 1以及rDNA特异性R1用于未来的分析（Anzai T.，等，Nucleic Acids Res.33，1993-2002。（2005））。