繰り返し構造を有するStarch-binding domainの構造と機能

具有重复结构的淀粉结合域的结构和功能

基本信息

  • 批准号:
    15780060
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.43万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份:
    2003
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2003 至 2004
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

1.B.polymyxa由来β/α-アミラーゼの繰り返し配列の機能解析Bacillus polymyxaのβ/α-アミラーゼは中央の約100アミノ酸からなるCBM25に分類されるデンプン結合領域(SBD)を2つ挟む形でN末端側にβ-アミラーゼ,C末端側にα-アミラーゼが連なった前駆体として合成される.この前駆体は菌体外へ分泌された後,SBDの前後でプロセッシングされ,β-アミラーゼとα-アミラーゼに分割される.これまでにこのSBDがN末端側のβ-アミラーゼに与える影響は明らかになっている.今回は,中央の繰り返し配列がC末端側に存在するα-アミラーゼに与える影響について検討した.ネイティブ状態に近い構造となるようにα-アミラーゼのN末端側にSBDを0,1,または2つ付加し,さらにそのN末端側にチオレドキシン(Trx)タグを付加した融合タンパクをそれぞれ作製したところ,活性のあるα-アミラーゼを発現させることに成功した.3種類の発現産物の精製およびTrxタグの除去を行い,各酵素の性質について検討したところ,α-アミラーゼにおいて本繰り返し配列は可溶性デンプンに対する酵素化学的な性質にほとんど影響を与えなかったが,繰り返し配列の数に依存して生デンプンに対する吸着性および分解活性は上昇した。以上のことから,本繰り返し配列がSBDとして機能することが明らかとなった.2.デンプン結合頒域(SBD)に付加された糖鎖がSBDの機能に与える影響Bacillus sp.no.195株由来α-アミラーゼ(BAA)はC末端側にCBM25に分類されるデンプン結合領域(SBD)を持つ。生デンプン分解能が低いと言われているタカアミラーゼA(TAA)に本SBDを付加したところ、TAAは明確な生デンプン分解活性を示したが,獲得した生デンプン分解活性は予想された値より低かった.その原因として、原核生物由来の本SBDを真核生物で発現させたために、本来存在しない糖鎖が付加され、デンプンへの結合に影響を与えたことが示唆された。今回、糖鎖がSBDの機能にどの程度影響しているかについて調べた。アミノ酸配列からSBDのN結合型糖鎖付加部位が3カ所予想されたので,それぞれについてPCRを用いて変異を入れることで糖鎖付加部位を明らかにするとともに、糖鎖が付加しないSBDを作製し、TAAのC末端に結合させるように遺伝子を設計した。これを糸状菌用高発現ベクターpNAN8142を用いたAspergillus oryzaeの系で発現させた.発現産物を精製し,生デンプン分解能について検討した結果,N型糖鎖はC末側の連続した結合部位のどちらかに結合していることがわかり,その影響で結合力が若干減少していることが明らかとなった.
Bacillus polymyxaのβ/α-アミラーゼは中のabout 100アミノ acidからなるCBM25にClassificationされるデンプンbinding field (SBD)を2つ抟むShape: N-terminal side, β-アミラーゼ, C-terminal side: α-アミラーゼが连なっThe former body is synthesized and the body is secreted outside the body, SB Dの后でプロセッシングされ,β-アミラーゼとα-アミラーゼにSplit the N-terminal side of the SBDるeffectは明らかになっている.Now return は,central の缲り回しalignmentがC terminal side The existence of するα-アミラーゼに and the influence of について検検した.ネイティブStatusにNearlyいstructureとなるようにα-アミラーゼのN terminal sideにSBDを0 ,1,または2つFUKAし,さらにそのN terminal side にチオレドキシン(Tr x) タグを富加したfusion タンパクをそれぞれ做したところ,Activeのあるα-アミラーゼを発appears させることに Success した. 3 types of の発 appear products のRefined およびTrxタグのremove を行い, and the properties of each enzyme are について検検したところ,α-アミラーゼにおいて本粲り回し配线はsoluble デンプンに対The chemical nature of the enzyme, the influence of the enzyme, and the arrangement of the enzyme The number of dependence is the dependence of the raw material and the adsorption and decomposition activity of the product. The above のことから, the original 粲り回しmatching がSBD として function することが明らかとなった.2.デンプン Combined Domain (SBD) にpay plus されたsugar lock がSBD のfunction に and える influence Bacillus The sp.no.195 strain is derived from the C-terminal binding domain (SBD) of α-aminara (BAA) and CBM25 classification. Raw decomposition energy is low and the word is lowところ、TAA It is clear that the decomposition activity of raw デデンプン is clear, and the したデンプン decomposition activity is obtained.された値よりlow かった.そのREASON として、本 SBD の本 SBD を eukaryotes で発appear させたために, there are originally しないsugar locks and が发加され, デンプンへのcombination にeffect を and えたことが Show instigation された. This time, the function of sugar lock SBD is affected by the degree of adjustment.アミノAcid arrangement からSBDのN-conjugated sugar lock pays the addition site が3カ为されたので,それぞれについてPCRを用いて変differentを入れることでThe sugar locks are added to the parts, the sugar locks are added, the sugar locks are added, the SBD is made, and the TAA C-terminal joints are designed. Aspergillus for Aspergillus oryzae's system is the result of the product. The product is refined. The decomposition energy of the raw material is the result.続したjunction partのどちらかにcombinationしていることがわかり,そThe effect of the binding force is somewhat reduced, and the effect is reduced.

项目成果

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