湖沼における有害微細藻類モニタリングへの遺伝子診断法の適用

遗传诊断方法在湖泊有害微藻监测中的应用

• 批准号: 04J00376
• 负责人: 石川 可奈子
• 金额: $ 0.77万
• 依托单位: Lake Biwa Environmental Research Institute
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-04J00376/
• 关键词: 有害藻類; 淡水赤潮; アオコ; Real-time PCR; 琵琶湖

湖沼の有毒・有害微細藻類種をターゲットとした遺伝子情報に基づく迅速かつ正確な分類ならびにモニタリング手法を開発するため、琵琶湖をケーススタディとして現在問題となっている有害微細藻類の遺伝子診断法を試みた。琵琶湖における主な有毒・有害微細藻類は、春期は淡水赤潮を形成する黄色鞭毛藻Uroglena americanaであり、夏期から秋期にかけては、アオコを形成する藍藻Microcystis aeruginosaである。そこで、これらの微細藻類の分子分類に有効なリボゾームRNA遺伝子の塩基配列を決定し、種特異的な塩基配列に結合する蛍光プローブ作成した。そしてさらに、その蛍光プローブの反応性の違いによってターゲットである有害微細藻類種を他の藻類と自動的に識別する方法を試みた。Uroglena americanaと、形態的および分類学的に酷似種の18SrRNA遺伝子の塩基配列を決定した。そして、その塩基配列の違いから、Uroglena細胞に特異的に反応するように作成した蛍光プローブを用いて、Real-time PCR法を試みた。すると、培養および野外の湖水中において、作成した蛍光プローブがUroglena americanaのみに反応し、本種を特異的に検出することができた。さらに、細胞数とPCRのサイクル数との関係式を得ることにも成功した。また、藍藻類に特異的に反応する蛍光プローブと、藍藻類の生産する毒性物質(ミクロシスティン)の生成にかかわる遺伝子に特異的に反応する蛍光プローブを作成し、Real-time PCRを試みたところ、有毒株のみを検出することに成功した。

The classification of toxic and harmful microalgae in lakes and marshes is rapid and correct. The method of classification is correct, and the method of classification is correct. The current problem is that harmful microalgae are not safe. In Lake Biwa, poisonous and harmful microalgae, freshwater red tide in spring, Uroglena americana flagellate in summer, Microcystis aeruginosa algae in autumn, and red tide in spring were found to be toxic and harmful. The molecular classification of microalgae is based on the molecular classification of microalgae, which is based on the determination of RNA subsets, and the combination of microalgae and microalgae in the molecular classification of microalgae. The method of automatic detection of harmful microalgae and other species of algae has been tested by the method of automatic detection. The classification of Uroglena americana and configuration is very similar to that of a kind of 18SrRNA cluster sub-cluster. The data base is equipped with the anti-interference device of the Uroglena cell, and the Real-time PCR test method is used. In the field, the water of the lake is exposed to the water of the lake. it is made into a light-emitting Uroglena americana, which is specially designed for this special purpose. The number of cells, the number of PCR, the number of cells, the number of cells and the number of cells. Anti-virus, anti-virus, anti-virus,

项目成果

Molecular detection of Uroglena americana (Chrysophyceae) forming freshwater red-tide in Lake Biwa

琵琶湖淡水赤潮形成的美洲尿藻（金藻纲）的分子检测

• 发表时间: 2005
• 期刊: Ver Internat.Verein.Limnol. 29(未定)
• 作者: Nomura T;Ishihara A;Yanagita RC;Endo TR;Iwamura H;Kanako Ishikawa
• 通讯作者: Kanako Ishikawa

In situ 3-D distribution survey of Microcystis colonies in lake Biwa using autonomous underwater vehicle and onboard plankton automated monitoring system

使用自主水下航行器和船上浮游生物自动监测系统对琵琶湖微囊藻菌落进行原位 3D 分布调查

• 发表时间: 2004
• 期刊: BDUA Journal of Biology Vol.1
• 作者: Nomura T;Ishihara A;Yanagita RC;Endo TR;Iwamura H;Kanako Ishikawa;Kanako Ishikawa
• 通讯作者: Kanako Ishikawa