腸管出血性大腸菌O157のパルスフィールドゲル電気泳動パターンの変化に関する研究
腸管出血性大腸菌O157のパルスフィールドゲル電気泳動パターンの変化に関する研究
批准号:
04J03994
负责人:
井口 純
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005
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英文摘要
臨床や環境から分離される腸管出血性大腸菌O157(O157)株のパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)パターンは非常に多様であることから、同一血清型内でもゲノム構造が多様であると考えられている。しかし、そのような多様性がどのようにして起こるのかについてはこれまでにほとんど知られていない。本研究では実験室内で特定菌株を連続的に継代培養することにより派生した菌株を用いてPFGEパターンの変化に影響を及ぼした変異について調べた。その結果、PFGEパターンの変化に関与した変異の一部は、複製軸に対してほぼ対称な位置に存在する2つのファージまたはファージ様DNA領域を介した大規模は逆位であることが分かった。逆位は複製終結点周辺に存在する5つのラムダ様ファージDNA領域を介した4タイプと、2つのファージ様DNA領域を介した1タイブの合計5タイプがみられ、逆位領域の大きさは250-kbから1.4-Mbであった。PFGEパターンの変化としては1回の逆位で4バンドが変化することが分かった。逆位はプロファージ領域内の相同性の高い配列を介した組換えにより起こったと予想された。以上の結果より、プロファージDNA領域を介した大規模な逆位がO157のPFGEパターンの多様化に関与し、ゲノム上でのファージDNAの存在は単なる「挿入DNA断片」に留まらず、「変異スポット」としてさらにゲノムの多様化を加速させている可能性が示唆された。
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会议论文
Spontaneous recombination between homologous rophage regions causes large-scale inversions within the Escherichia coli O157:H7 chromosome.
同源噬菌体区域之间的自发重组导致大肠杆菌 O157:H7 染色体内的大规模倒位。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
Gene (in press)
影响因子:
--
作者:
[驛 賢太郎, 井口純]
通讯作者:
井口純
ウシ消化管内で共生するヒト病原細菌の空間・生態的特徴の解明と新たな防除法の構築
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批准号:23K27059
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$6.57万
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财政年份:2024
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负责人:井口 純
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依托单位:
Elucidation of spatial and ecological characteristics of human pathogenic bacteria living symbiotically in the bovine gastrointestinal tract and construction of new control methods for them
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批准号:23H02366
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$12.15万
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财政年份:2023
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负责人:井口 純
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依托单位:
国内基金
海外基金
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批准号:32302245
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批准年份:2023
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依托单位:
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批准号:42377369
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项目类别:面上项目
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批准年份:2023
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项目类别:青年科学基金项目
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批准号:LR23C200002
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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批准年份:2022
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负责人:廖彩虎
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依托单位:
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批准号:32100143
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2020
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负责人:廖彩虎
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依托单位: