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腸管出血性大腸菌O157のパルスフィールドゲル電気泳動パターンの変化に関する研究

肠出血性大肠杆菌O157脉冲场凝胶电泳图谱变化研究

基本信息

批准号：
04J03994
负责人：
井口純
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-04J03994/
关键词：
PFGE O157

项目摘要

臨床や環境から分離される腸管出血性大腸菌O157(O157)株のパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)パターンは非常に多様であることから、同一血清型内でもゲノム構造が多様であると考えられている。しかし、そのような多様性がどのようにして起こるのかについてはこれまでにほとんど知られていない。本研究では実験室内で特定菌株を連続的に継代培養することにより派生した菌株を用いてPFGEパターンの変化に影響を及ぼした変異について調べた。その結果、PFGEパターンの変化に関与した変異の一部は、複製軸に対してほぼ対称な位置に存在する2つのファージまたはファージ様DNA領域を介した大規模は逆位であることが分かった。逆位は複製終結点周辺に存在する5つのラムダ様ファージDNA領域を介した4タイプと、2つのファージ様DNA領域を介した1タイブの合計5タイプがみられ、逆位領域の大きさは250-kbから1.4-Mbであった。PFGEパターンの変化としては1回の逆位で4バンドが変化することが分かった。逆位はプロファージ領域内の相同性の高い配列を介した組換えにより起こったと予想された。以上の結果より、プロファージDNA領域を介した大規模な逆位がO157のPFGEパターンの多様化に関与し、ゲノム上でのファージDNAの存在は単なる「挿入DNA断片」に留まらず、「変異スポット」としてさらにゲノムの多様化を加速させている可能性が示唆された。

The environmental conditions of the bed were isolated from E. coli O157 (O157) strain of hemorrhagic Shigella pneumoniae O157 (O157). There were very many strains of hemorrhagic Shigella pneumoniae (PFGE) in the same serotype and the same serotype. I don't know if I know what I'm going to know. In this study, the specific strains linked in the laboratory were used to culture the strains derived from the bacteria in the laboratory. The strains were isolated from the PFGE strains and the strains were isolated from the laboratory. The results show that there is a link between the PFGE and the location in the first part, and that the location exists. In the DNA field, there is an introduction to large scale models. In the reverse location, there is a total of 5 cycles in the DNA domain, 4 in the DNA domain, 4 in the DNA domain, 1 in the Mb domain, and 250 in the reverse domain. PFGE reverses the data in the reverse position of 4 bits in the first place. In the field of homogeneity in the field of homosexuality, there is an introduction to the system. The results of the above results, the introduction of large-scale models in the field of DNA, the reverse of O157 PFGE data, the multiplication of DNA fragments, the existence of DNA fragments, the possibility of acceleration of DNA fragments, and the possibility of acceleration.