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レトロトランスポゾンの新機能獲得と生存戦略の進化

逆转录转座子新功能的获得和生存策略的进化

基本信息

批准号：
04J11197
负责人：
小島健司
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Kyoto University (2005)The University of Tokyo (2004)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

R2は28SリボソーマルRNA遺伝子に特異的に挿入されるレトロトランスポゾンである。レトロトランスポゾンの標的配列特異性は、宿主への害を最小限にしつつ自身の増殖を図る生存戦略と捉えることができる。私はこれまでの研究において、このR2が節足動物、脊索動物、棘皮動物、扁形動物の4つの動物門にまたがって分布していることを明らかにしてきた。本年度の研究においては、これらの動物門よりも早くに分岐した刺胞動物において、R2およびそれに近縁なレトロトランスポゾンを発見した。イソギンチャクの一種Nematostella vectensisのゲノム配列情報からR2に近縁なレトロトランスポゾンを発見し、これが他のR2と同じ標的配列を持っていることを明らかにした。一方、ヒドラHydra magnipapillataのゲノム配列情報から2種類のR2に近縁なレトロトランスポゾンを発見したが、これらの標的配列はR2とは異なり、18SリボソーマルRNA遺伝子中に挿入されていることがわかった。これは、新規の配列特異性であり、R8と命名した。複数の手法を用いた系統解析の結果では、イソギンチャクのR2は予想通り他のR2と近縁であったが、興味深いことに、ヒドラのR8も系統上R2の内部に位置した。このことから、R8はR2に属するレトロトランスポゾンが、標的配列を変更して誕生したレトロトランスポゾンのグループであることが示された。また、R2の配列特異性の起源が、三胚葉動物の誕生以前にまで遡ることが明らかとなった。これら2つの結果はリボソーマルRNA遺伝子への配列特異性がレトロトランスポゾンの生存戦略として有効に働いていることを示している。

R2 is a very specific type of RNA. The target alignment specificity of the host and host is minimal, and the survival strategy of the host and host is minimal. The distribution of arthropods, chordates, echinoderms, platyzoa and other phylum species is discussed in detail. This year's research has revealed that there are many different species of animals in the world, such as rhinozoa, rhinozoa and rhinozoa. A kind of Nematostella vectensis is arranged in the same way as R2. In one case, Hydra magnipapillata is assigned to two types of R2, and the target assignment is assigned to one type of R2. R8 is named after the new regulation. The result of system analysis of multiple methods is that the internal position of R2 on the R8 system is determined by the internal position of R2 on the R8 system. R8 and R2 belong to the same group, and R8 and R2 belong to different groups. The origin of the alignment specificity of R2 and R3 before the birth of triembryonic animals The results of this study indicate that there is a significant difference in the alignment specificity of the RNA gene.