形態形成過程の全容解明に向けた、転写因子下流遺伝子の網羅的探索

全面寻找转录因子下游基因,全面阐明形态发生过程

基本信息

  • 批准号:
    04J11585
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.79万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 2006
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

組織で領域特異的に発現して組織を区画化する転写因子群の下流で形態を直接制御する遺伝子の探索・解析の報告は少ない。本研究ではショウジョウバエ肢形成過程をモデル系としてそのような下流遺伝子の網羅的解析を目指してきた。ショウジョウバエの肢原基はBarH1/2,Aristaless, C11など様々な転写因子の領域特異的発現により、成虫肢の遠近軸方向の分節構造に対応した区画に分割される。前年度までに、肢原基において分節特異的に発現する遺伝子を網羅的に探索するために、肢原基を分節ごとに切り分けて各分節からRNAを抽出し、それらの発現プロファイルを比較するマイクロアレイ解析を行った。この解析において分節問で有意な発現量の差を示した900強の遺伝子の一部について、今年度は大規模なin situハイブリダイゼーションによって肢原基における実際の発現パターンを検証した。in situハイブリダイゼーションを行った192遺伝子のうち約61%にあたる118遺伝子について分節特異的な発現が確認できた。マイクロアレイ解析において分節間で平均約2倍以上の大きな差違を示した遺伝子に限ると、実際に分節特異的に発現する遺伝子の率は約76%であった。この高い効率は、これまでのマイクロアレイ解析の妥当性を裏付けるものと考えられる。また、分節特異的発現を示した遺伝子の大部分は先端の分節で特異的に発現量の異なるものだった。それらの遺伝子が、この分節に形成される爪などの特殊な構造の形成に様々な役割を果たすことが示唆される。
Tissue domain-specific discovery, tissue segmentation, downstream morphology, direct control, and genetic exploration and analysis are rarely reported. This study aims to analyze the formation process of the protein and the network of the protein. The primordium of the adult limb is divided into two parts: BarH1/2,Aristaless, C11 and the domain-specific occurrence of the writing factor. In the past year, the gene expression of each segment of the gene was analyzed by comparing the RNA expression of each segment with that of the gene expression of each segment of the gene. This analysis shows that the difference between the intentional discovery amount and the 900-strong genetic component is partially due to the large-scale discovery in situ this year. In situ, 192 pieces of information were found to be about 61% of the time. 118 pieces of information were found to be unique. On average, the difference between segments was more than twice as large as that between segments. In fact, the rate of segment-specific generation was about 76%. This is a high probability analysis. Most of them are different from each other in the amount of segment-specific occurrence. For example, the formation of a special structure in the formation of a special structure in the formation of a special structure.

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Temporal regulation of late expression of Bar homeobox genes during Drosophila leg development by Spineless, a homolog of the mammalian dioxin receptor
  • DOI:
    10.1016/j.ydbio.2006.03.015
  • 发表时间:
    2006-06-15
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Kozu, Shintaro;Tajiri, Reiko;Kojima, Tetsuya
  • 通讯作者:
    Kojima, Tetsuya
GATAe-dependent and -independent expressions of genes in the differentiated endodermal midgut of Drosophila
  • DOI:
    10.1016/j.modgep.2006.07.001
  • 发表时间:
    2007-01-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.2
  • 作者:
    Okumura, Takashi;Tajiri, Reiko;Murakami, Ryutaro
  • 通讯作者:
    Murakami, Ryutaro
Fate determination of Drosophila leg distal regions by trachealess and tango through repression and stimulation, respectively, of Bar homeobox gene expression in the future pretarsus and tarsus
无气管和探戈分别通过抑制和刺激未来前跗节和跗节中 Bar 同源盒基因表达来决定果蝇腿部远端区域的命运
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tajiri R;Tsuji T;Ueda R;Saigo K;Kojima T.
  • 通讯作者:
    Kojima T.
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