網羅的ゲノム解析を基盤とした循環器疾患関連遺伝子群の同定研究

基于全基因组分析的心血管疾病相关基因鉴定研究

• 批准号: 04J61613
• 负责人: 高橋 弓子 (田中 弓子)
• 金额: $ 0.77万
• 依托单位: Tokyo Medical and Dental University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-04J61613/
• 关键词: 心筋梗塞; マイクロサテライト多型; 疾患関連遺伝子多型; 患者-対照研究

心筋梗塞の発症に関与する遺伝要因の解明を目的として、体系的マイクロサテライト多型関連解析を進めた。前年度までに、心筋梗塞患者群と対照群のプールDNAを用いてマイクロサテライト多型座位のスクリーニングを行ない、常染色体上に位置する18,600の座位から242座位を選別した。本年度は、これらの選別したマイクロサテライト多型座位について、プールDNAの作製に用いた患者群、対照群それぞれ192検体のアリルを個別に明らかにし、プールDNAでの結果が群間でのアリル頻度の相違を反映しているかを検討した。これまで177座位を解析した結果、81座位(46%)で真のアリル頻度に有意な相違を認め、関連を確認した。次に、関連を確認した座位について、さらに別の患者群、対照群それぞれ192検体のタイピングを行ない。関連の再現性を検討した。22座位の解析からそのうちの4座位(18%、これらはそれぞれ異なる染色体上にあり、ここでは仮にMI21、MI26、MI56、MI63と呼ぶ)について、特定のアリル(MI21^*6、MI26^*6、MI56^*9、MI63^*8)の保有者の頻度が患者群で有意に高いことが明らかとなった。解析したすべての患者、対照を合わせるとMI21^*6は患者群の24.8%、対照群の15.5%(オッズ比1.80、P=0.0015)、MI26^*6は患者群の18.4%、対照群の11.7%(オッズ比1.70、P=0.011)、MI56^*9は患者群の13.9%、対照群の8.0%(オッズ比1.86、P=0.012)、MI63^*8は患者群の47.9%、対照群の30.6%(オッズ比2.09、P=0.0000079)、と比較的弱いが有意な関連を認めた。このうちMI63座位の近傍には既知の遺伝子が存在しており、現在より密なマイクロサテライトマーカー設定とその遺伝子のSNP解析を進めている。

The analysis of the relationship between the development of myocardial infarction and the main causes of myocardial infarction In the past year, the number of loci in the patient group with myocardial infarction and the number of loci in the corresponding group were selected from 18,600 loci and 242 loci. This year, we reviewed the results of the selection of 192 samples and the frequency of cluster DNA production in patients with multiple loci, and the results of cluster DNA production in patients with multiple loci. 177 seats were analyzed, 81 seats (46%) were true, and the frequency of intentional violations was confirmed. Next, confirm the relationship between the seat, the patient group, the group and the patient group. The reproducibility of correlation is discussed. Analysis of 22 loci: 4 loci (18%), 6 loci (1 Analysis of patients and patients: MI21^*6: 24.8% of patients and 15.5% of patients MI26^*6 (P=0.0015), MI = 18.4% for patients and 11.7% for controls MI56^* 9 in 13.9% of patients, MI63 ^*8 in 47.9% of controls, MI66 ^*9 in 13.9% of controls, MI63^*8 in 47.9% of patients, MI66 ^* 9 in 30.6% of controls, MI66 ^* 9 in 13.9% of controls, MI66 ^* 9 in 13.9% of patients, MI66 ^* 9 in 13.9% of controls, MI63^*8 in 47.9% of controls, MI66 ^* 8 in 30.6% of controls, MI66 ^* 9 in 2.09, P=0.0000079, MI66 ^* 9 in 13.9% of controls, MI66 ^* 9 in 13.0% of controls, MI63 ^* 9 in 2.0% of controls, MI66 ^* 9 in 13.0% of controls. The SNP analysis of the known gene near the MI63 locus is progressing.