歯根膜DNAチップを用いたFGF-2による歯周組織再生での網羅的遺伝子発現解析

使用牙周膜 DNA 芯片进行 FGF-2 在牙周组织再生中的综合基因表达分析

• 批准号: 15791236
• 负责人: 山田 聡
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15791236/
• 关键词: 歯根膜; FGF-2; DNAマイクロアレイ; 遺伝子発現解析; IGFBP5遺伝子; TTC7L1遺伝子; 歯周組織再生

1)PerioGen Chipを用いたFGF-2刺激による歯根膜細胞での遺伝子発現解析ヒト歯根膜細胞(HPDL)を石灰化誘導培地(10%FCS、10mM β-glycerophosphateおよび50mg/ml ascorbic acid含有α-MEM)にて9日間培養後、FGF-2刺激(100ng/ml)を3日間行い、RNAを抽出し、PerioGen Chipを用いて遺伝子発現を解析した。その結果、FGF-2刺激により発現が上昇する遺伝子群および下降する遺伝子群が同定された。その中で、遺伝子配列が全く未知の遺伝子GS5115とGS5507が見出された。FGF-2刺激によりGS5115の遺伝子発現は上昇し、GS5507の遺伝子発現は低下した。2)FGF-2刺激反応性遺伝子の同定・解析GS5115およびGS5507のゲノムデータベース解析の結果、GS5115はinsulin-like growth factor binding protein 5 (IGFBP5)遺伝子の最終エクソンの近傍に存在すること、一方、GS5507は、tetratricopeptide repeat domain 7 like 1 (TTC7L1)遺伝子のエクソン16と17の間に存在することが明らかとなった。それぞれの遺伝子とGSとの間でのRT-PCR解析により、GS5115はIGFBP5の最終エクソン(エクソン5)で新規の3'末端UTRの一部であることが、GS5507はTTC7L1の中間エクソンであり、新規の欠損型TTC7L1アイソフォームをコードしていることが明らかとなった。以上の結果から、ヒト歯根膜におけるFGF-2作用過程へのIGFBP5および新規TTC7L1アイソフォームの関与が示唆された。

1)PerioGen Chipを stimulates による歯 root membrane cells with を たFGF-2 で seed development analysis ヒト歯 root membrane cells (HPDL)を lime induction culture (10%FCS, 10 mm β-glycerophosphateおよび50mg/ml ascorbic) acid contains α-MEM. Youdaoplaceholder0 after 9 days of culture, FGF-2 stimulation (100ng/ml). Youdaoplaceholder1 after 3 days, <s:1>, RNAを extraction <e:1>, PerioGen Chipを was performed using <s:1> て residue 伝 for を analysis of た. そ の results, FGF - 2 stimulation に よ り 発 now rising が す る heritage 伝 subgroup お よ び falling す る heritage 伝 subgroup が with fixed さ れ た. そ の で, heritage 伝 with sequence が く all traces of unknown の 伝 son GS5115 と GS5507 が shows さ れ た. FGF-2 stimulates によ 伝, GS5115 cultural heritage 伝, resulting in an increase in <s:1> and a decrease in <s:1> of GS5507 cultural heritage 伝. 2)FGF-2 stimulates the anti応 sex leucin 伝 <s:1> to be fixed · analysis of GS5115およびGS5507 <s:1> ゲノムデ タベ タベ ス ス analysis <s:1> results, GS5115 <s:1> insulin like growth factor binding protein 5 (IGFBP5) 伝 の son was finally エ ク ソ ン の nearly exist alongside に す る こ と, one party, GS5507 は, tetratricopeptide repeat domain 7 like 1 (TTC7L1) posthumous son 伝 の エ ク ソ ン に exist between 16 と 17 の す る こ と が Ming ら か と な っ た. そ れ ぞ れ の posthumous son 伝 と GS と の between で の rt-pcr parsing に よ り, GS5115 は IGFBP5 の eventually エ ク ソ ン (エ ク ソ ン 5) で new rules の 3 'end UTR の a で あ る こ と が, GS5507 は TTC7L1 の middle エ ク ソ ン で あ り, new rules の owe damage type TTC7L1 ア イ ソ フ ォ ー ム を Youdaoplaceholder0 コ ド て て る る る とが とが Ming ら る となった. の above results か ら, ヒ ト 歯 root membrane に お け る FGF role - 2 process へ の IGFBP5 お よ び new rules TTC7L1 ア イ ソ フ ォ ー ム の masato and が in stopping さ れ た.