無尾類におけるmtDNAの分子進化とゲノム情報に基づく高次分類群の系統関係の推定

基于基因组信息的无尾目线粒体DNA分子进化及高等类群系统发育关系估计

• 批准号: 16770066
• 负责人: 倉林 敦
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16770066/
• 关键词: 無尾両生類; 高次分類群; カエル亜目; ミトコンドリアゲノム; ゲノム構造; 遺伝子配置; 分布域形成; 大陸移動; 無尾類; 分子進化; クサガエル科; サエズリガエル科; 縮重プライマー; 分子系統解析; アオガエル科; マダガスカルガエル科

無尾両生類におけるmtゲノムの分子進化のプロセスを推定すると共に、ゲノム構造を指標として高次分類群の系統関係を明らかにすることを目的に研究を実施した。本年度は、無尾類mtDNAのユニバーサルプライマーを用いて、クチボソガエル科とフクラガエル科のmtDNAの全領域の増幅を行い、昨年増幅済みの7科のカエル(クサガエル・サエズリガエル・スキアシヒメガエル・アベコベガエル・ヤドクガエル・ユビナガガエル)と共にmtDNAの塩基配列決定を行った。この内、クサガエル科とサエズリガエル科の種について全塩基配列を決定した。クサガエル科のイロカエクサガエルとサエズリガエル科のケガエルのmtDNAのゲノムサイズは、22.6kbpと21.4kpで、通常の脊椎動物の16kbpと比べ非常に大きいものであった。両者のゲノムを大きくしている要因は、付加的なコピー領域が存在するためであり、前者は、ND2蛋白遺伝子とコントロール領域と1つのtRNA遺伝子が、後者では、ND5蛋白遺伝子-コントロール領域と6つのtRNA遺伝子がコピーされていた。さらに、クサガエル科とサエズリガエル科のmtDNAでは、tRNAAla遺伝子とtRNAAsn-L鎖複製起点の位置が入れ替わっているという特徴が見られた。この特徴は、クチボソガエル科とも共通していたため、tRNA遺伝子とL鎖複製起点の位置の置換わりは、少なくともこれら3科の共通祖先で生じたと考えられた。ミトコンドリア遺伝子の塩基アミノ酸配列に基づく解析も本仮説を支持した。この研究成果については、日本動物学会第77回大会にて発表し、論文を準備中である。さらに、研究期間の知見から以下の点が明らかになった。(1)カエル類の中でも進化的なグループのカエル亜目では、幾つかの科で独立にミトコンドリアゲノム構造が大きく変化した。(2)カエル亜目の各科の分岐年代は、超大陸パンゲアの分断に先立つ場合が多く、世界的分布を示す科の分布域形成の一部は、大陸移動イベントが関与した。

The molecular evolution of taxa without tail is estimated, and the structure of taxa is determined. This year, we increased the amplitude of mtDNA in all domains of tailless mtDNA, increased the amplitude of mtDNA in 7 families of tailless mtDNA last year, and determined the nucleotide sequence of mtDNA. In this case, the total base alignment is determined.クサガエル科のイロカエクサガエルとサエズリガエル科のケガエルのmtDNAのゲノムサイズは、22.6kbpと21.4kpで、通常の脊椎动物の16kbpと比べ非常に大きいものであった。The main reason for this is that the ND2 protein domain exists, and the ND5 protein domain exists, and the ND5 protein domain exists. The mtDNA sequence of the mtDNA gene tRNAAla and tRNAAsn-L locks is characterized by the position of the origin of replication. The characteristics of this gene are: 1. the common ancestor of 3 families; 2. The basic analysis method of the basic analysis of the basic analysis The results of this research are presented at the 77th Congress of the Zoological Society of Japan and the preparation of papers is underway. During the study period, the following points were observed: (1)In the middle of the class, the evolution of the class is very complicated. (2)The division of the various branches of the world is related to the division of the supercontinent, the division of the world, the distribution of the world, the formation of the distribution of the world, and the movement of the continent.

项目成果

Complete nucleotide sequence of the mitochondrial genome of Schlegel's tree frog Rhacophorus schlegelii (family Rhacophoridae):: duplicated control regions and gene rearrangements

• DOI: 10.1266/ggs.80.213
• 发表时间: 2005-06-01
• 期刊: GENES & GENETIC SYSTEMS
• 影响因子: 1.1
• 作者: Sano, N;Kurabayashi, A;Sumida, M
• 通讯作者: Sumida, M

Complete nucleotide sequence of the mitochondrial genome of a Malagasy poison frog Mantella madagascariensis:: Evolutionary implications on mitochondrial genomes of higher anuran groups

• DOI: 10.1016/j.ympev.2005.11.021
• 发表时间: 2006-04-01
• 期刊: MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION
• 影响因子: 4.1
• 作者: Kurabayashi, A;Usuki, C;Hasegawa, M
• 通讯作者: Hasegawa, M