新しい糖鎖機能の構造学的解明を目指した糖鎖認識Fbox蛋白質のX線結晶構造解析
聚糖识别 Fbox 蛋白的 X 射线晶体结构分析,旨在阐明新聚糖功能的结构
基本信息
- 批准号:16770072
- 负责人:
- 金额:$ 2.05万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2004
- 资助国家:日本
- 起止时间:2004 至 2005
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
ユビキチン(Ub)-プロテアソーム蛋白質分解経路は生体内において細胞周期の制御や蛋白質の品質管理の役割を担っており、蛋白質を特異的に分解する非常に高度に制御された反応系である。この反応系においてユビキチンチガーゼSCF^<Fbs1>は小胞体内の異常蛋白質の細胞外分泌や細胞内蓄積を防止するためのシステムである小胞体関連分解において、小胞体から細胞質に逆行輸送された折りたたみ異常糖蛋白質を認識し分解シグナルユビキチンを付加する酵素である。本研究はこれまでに立体構造を決定した糖鎖認識サブユニットFbs1以外の糖鎖認識サブユニットFbs2、FBG3、Fbx30の構造解析を目指し糖鎖認識とその機能の解明を目指したものであり、これらの蛋白質はそれぞれ糖蛋白質の認識特異性や一次構造が異なっている。そして、これまでの研究よりFbs2、FBG3、Fbx30ではFbs1とは異なり基質認識ドメインでの構造解析は蛋白質が不溶性になるなどの問題でうまく行かなかったため、ドメインの構造解析ではなく複合体として共発現させることで精製蛋白質を得た。そして、Skp1-FBG3複合体では複数のカラムクロマトグラフィーにより精製し、さまざまな条件で結晶化を行うことにより結晶が生成した。この結晶を用いたX線回折実験では結晶が小さく質も十分ではなかったため立体構造決定に必要なデータを収集することができなかった。現在、Skp1-FBG3複合体のX線結晶構造解析を目指し結晶化及び精製条件の検討を行っている。
The protein breakdown pathway is responsible for in vivo regulation of the cell cycle, protein quality management, and protein specific breakdown, which is highly regulated by the reaction system. The reverse transcription <Fbs1>system prevents extracellular secretion and intracellular accumulation of abnormal proteins in small cells. The reverse transcription system prevents extracellular secretion and intracellular accumulation of abnormal proteins in small cells. The reverse transcription system prevents extracellular secretion and intracellular accumulation of abnormal proteins in small cells. In this study, the structural analysis of glycophosphorins other than Fbs1, Fbs2, Fbx3 and Fbx30 was carried out to determine the three-dimensional structure of glycophosphorins. Fbs2, Fbx3, Fbx30, Fbs1, Fbs2, Fbx3, Fbx3, Fbs2, Fbs3, Fbs1, Fbs3, Fbs4, Fbs3, Fbs4, Fbs5, Fbs4, Fbs5, Fbs6, Fbs4, Fbs6, Fbs4, Fbs5, Fbs5, Fbs6, Fbs6, Fbs4, Fbs5, Fbs6 The Skp1-FBG complex is purified and crystallized under various conditions. The X-ray reflection of the crystal is very small and the three-dimensional structure is necessary. Now, X-ray crystal structure analysis of Skp1-FBG3 complex was carried out to indicate crystallization and purification conditions.
项目成果
期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ユビキチンシステムの構造生物学
泛素系统的结构生物学
- DOI:
- 发表时间:2004
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Mizushima T;Hirao T;Yoshida Y;et al.;水島恒裕
- 通讯作者:水島恒裕
The crystal structure of human Atg4b, a processing and de-conjugating enzyme for autophagosome-forming modifiers
- DOI:10.1016/j.jmb.2005.11.018
- 发表时间:2006-01-27
- 期刊:
- 影响因子:5.6
- 作者:Kumanomidou, T;Mizushima, T;Yamane, T
- 通讯作者:Yamane, T
Structural basis of sugar-recognizing ubiquitin ligase
- DOI:10.1038/nsmb732
- 发表时间:2004-04-01
- 期刊:
- 影响因子:16.8
- 作者:Mizushima, T;Hirao, T;Tanaka, K
- 通讯作者:Tanaka, K
糖鎖ユビキチンリガーゼの立体構造から明らかになった蛋白質分解のための糖鎖の役割
从糖链泛素连接酶的三维结构揭示糖链在蛋白质降解中的作用
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kumanomidou T;Mizushima T;Komatsu M;Suzuki A;Tanida I;Sou YS;Ueno T;Kominami E;Tanaka K;Yamane T;水島恒裕
- 通讯作者:水島恒裕
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- 作者:
水島 恒裕 - 通讯作者:
水島 恒裕
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