Gel-phaseNMR法の開発と膜蛋白質への応用
Gel-phaseNMR法の開発と膜蛋白質への応用
批准号:
16770116
负责人:
児嶋 長次郎
金额:
$2.37万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005
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本研究では溶液NMRを用いたGel-phaseにおける蛋白質の立体構造解析法を確立し、膜蛋白質へ応用することを目指している。具体的には、溶液NMRによるGel-phase蛋白質の構造解析法の開発、可溶性向上を目指した融合蛋白質(可溶化タグ)の選択と溶液条件下における構造解析可能性の検討、無細胞蛋白質合成系を用いた可溶化タグ付加膜蛋白質の大量調製法の検討、界面活性剤共存下でのGel-phase NMRの膜蛋白質への応用を行う。本年度の実施実績は以下の通りである。昨年度に引き続き可溶性向上を目指した融合蛋白質(可溶化タグ)の選択と溶液条件下における構造解析可能性の検討、および、無細胞蛋白質合成系を用いた可溶化タグ付加膜蛋白質の大量調製法の検討を行った。光回避シグナルを伝える古細菌由来2回膜貫通型蛋白質pHtrIIについて加茂直樹教授(北大薬)の協力を得て大腸菌を用いた大量発現系によるNMR試料の調製を、また河野俊之チームリーダー(三菱化学生命研)の協力を得て4種(TRX、GST、GFP、MBP)の可溶化タグ融合蛋白質として小麦胚芽無細胞蛋白質合成系によるpHtrIIの大量調製を行い、溶液中やGel-phaseでの解析に最適なサンプル調製法を検討した。GSTタグは界面活性剤に対して不安定であり、膜蛋白質の構造解析には適していなかった。GFPタグやMBPタグは界面活性剤存在下においても安定であり、溶液中で比較的良好なスペクトルが得られることが分かった。今後はGFPタグやMBPタグを付加した蛋白質を樹脂担体へ安定に固定化する手法の開発を進める。
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Amino acid residues involved in substrate recognition of the Escherichia coli ORF135 protein
参与大肠杆菌 ORF135 蛋白底物识别的氨基酸残基
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Biochemistry 44・15
影响因子:
--
作者:
[Numata, T., Fukai, S., Ikeuchi, Y, Suzuki, T., Nureki, O., Y.Tanaka, M.Mishima, Y.Tanaka, K.Furuita, Toshitatsu Kobayashi, Emiko Iida]
通讯作者:
Emiko Iida
Linker region of a Halobacterial transducer protein interacts directly with its sensor retinal protein
盐细菌转导蛋白的连接区与其传感器视网膜蛋白直接相互作用
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Biochemistry 44・16
影响因子:
--
作者:
[Numata, T., Fukai, S., Ikeuchi, Y, Suzuki, T., Nureki, O., Y.Tanaka, M.Mishima, Y.Tanaka, K.Furuita, Toshitatsu Kobayashi, Emiko Iida, Yuki Sudo]
通讯作者:
Yuki Sudo
Functional roles of the metal ion at the A9/G10.1 site in hammerhead ribozymes
锤头核酶 A9/G10.1 位点金属离子的功能作用
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
J.Am.Chem.Soc. 126
影响因子:
--
作者:
[M.Hoshino, Y.O.Kamatari, S.Ohnishi, et al.(T.R.Obalinsky ed.), 鎌足雄司他(桑田一夫編), Toshitatsu Kobayashi, Emiko Iida, Yuki Sudo, Kazuhiko Nakatani, Masaki Mishima, Emiko Kudo, Y.Tanaka]
通讯作者:
Y.Tanaka
Paramagnetic NMR study of Cu(2+)-IDA complex localization on a protein surface and its application to elucidate long distance information.
Cu(2 )-IDA 复合物在蛋白质表面定位的顺磁 NMR 研究及其在阐明长距离信息中的应用。
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
FEBS Lett.2004 566:157-61.. 第566巻
影响因子:
--
作者:
[Horinouchi I., Nakazato H., Kawano T., Iyama K., Furuse A., Arizono K., Machida J., Sakamoto T., Endo F., Hattori S., Nomura M]
通讯作者:
Nomura M
Disassembling and bleaching of chroride-free pharaonis halorhodopsin by octyl-beta-glucoside
辛基-β-葡萄糖苷对无氯法老尼盐视紫红质的降解和漂白
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Biochemistry 44・39
影响因子:
--
作者:
[M.Hoshino, Y.O.Kamatari, S.Ohnishi, et al.(T.R.Obalinsky ed.), 鎌足雄司他(桑田一夫編), Toshitatsu Kobayashi, Emiko Iida, Yuki Sudo, Kazuhiko Nakatani, Masaki Mishima, Emiko Kudo]
通讯作者:
Emiko Kudo
共 10 条
超高感度In-Cell NMRによるヒト生細胞内LLPS蛋白質の構造解析
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批准号:23K27109
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.57万
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财政年份:2024
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负责人:児嶋 長次郎
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依托单位:
Structural analysis of LLPS proteins in living human cells by in-cell NMR
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批准号:23H02416
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$12.06万
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财政年份:2023
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负责人:児嶋 長次郎
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依托单位:
CHPによるNa+/H+交換輸送体NHE1の活性制御機構の解明
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批准号:19036015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.03万
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财政年份:2007
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负责人:児嶋 長次郎
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依托单位:
ガン細胞特異的な細胞内pH制御機構の構造的基盤
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批准号:18011006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.35万
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财政年份:2006
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负责人:児嶋 長次郎
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依托单位:
Na+/H+交換輸送体複合体の構造と細胞膜・細胞骨格との相互作用
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批准号:18059022
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.89万
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财政年份:2006
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负责人:児嶋 長次郎
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依托单位:
CHPによるNa十/H+交換輸送体NHE1活性化機構の解明
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批准号:17048016
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2005
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负责人:児嶋 長次郎
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依托单位:
DNAの動的側面から見る遺伝子情報の制御機構
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批准号:14780513
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2002
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负责人:児嶋 長次郎
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依托单位: