ムギ類マイコトキシン汚染予防のためのDNAマーカーを使った病原菌の動態解明

利用 DNA 标记阐明病原菌动态，预防小麦霉菌毒素污染

• 批准号: 16780224
• 负责人: 須賀 晴久
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Gifu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16780224/
• 关键词: フザリウム・グラミネアラム菌; マイコトキシン; 系統; 個体識別; DNAマーカー; マイクロサテライトマーカー; ムギ類; 動態

本年度は‘菌は同じ場所で生息し続けているのか?それとも移動しているのか?'という菌の動態解明のために収集した1年目熊本圃場集団(K1)及び播種に用いた種子集団(SK1)、2年目熊本圃場集団(K2)及び種子集団(SK2)の全菌株(46菌株×4集団=184菌株)について、系統情報及びマイクロサテライトマーカー(座)による多型(対立遺伝子)データを得た。その結果、ほとんどの菌株が第6系統、4菌株のみが第7系統と、西日本全体における状況と同様であった。得られた対立遺伝子データ(但し、この際、毒素タイプは一つの座として扱った)を集団遺伝学的解析にかけたところ、1)同一個体はSK2集団中の6株のみで(2株×3組)、他全ての菌株は別個体であること、2)遺伝的多様度(調べた11座中、2個体問で対立遺伝子が異なった座数の平均値)が集団内、集団間共に5.4-6.2と非常に高いこと、3)4集団間のFs七値(集団間の遺伝的分化の尺度)が0.001-0.026と非常に低いことが判明した。これにより、同一圃場におけるムギ類赤かび病が毎年異なる菌集団で起こされることが分かった。また、同一個体と判定された3組について圃場内の分離地点を調べたところ、同一組の菌株はいずれも近接地点で分離されていた。これは菌のクローン増殖で侵される圃場内の場所が限定的であることを示している。更に、集団の遺伝的多様性が非常に高かったことは、本菌が他個体間で高頻度に交配していることを示唆ししている。今回SK1は福岡県産、SK2は長崎県産の種子からの菌集団である。これらとK1及びK2とあわせた全4集団間のFst値が非常に低かったことは、九州北部のフザリウム・グラミネアラム菌が一つの大きな任意交配集団であることを示している。2002年に九州各地から分離された31菌株について同様のデータを取得し、これを1集団として解析したところ、上記4集団とのFst値は0.04-0.06と弱冠高かった。これは本菌の場合、集団間の距離が離れることで遺伝的分化の程度が大きくなっていくことを示唆している。

Do you have any information about how to live in the same place this year? Why don't you move your car?' One year Edible Kumamoto Farm Collection (K1) and two year Eye Kumamoto Pool Collection (SK1), two year Edible Kumamoto Pool Collection (K2) and two year Edible Kumamoto subset (SK2). All strains (46 strains × 4 sets = 184strains) were successfully tested, systematic and successful. The results of the test, the sixth system of the strain strain, the system 7 system of the four strains, and all the strains in western Japan were the same as each other. The results showed that the multiplicity of 6 strains (2 strains × 3 groups) in the same SK2 collection (2 strains × 3 groups) and other strains in the same cluster (2 strains × 3 groups), 2) the multiplicity of 6 strains (2 strains × 3 groups) in the same cluster (2 strains × 3 groups), 2) the multiplicity of 6 strains (2 strains × 3 groups) in the same cluster (2 strains × 3 groups). (2) the average number of seats within and between clusters is 5. 4-6. 2 cycles, 3) 4 sets-7 cycles (scale of differentiation of inter-cluster cycles) 0.001-0.026 years. In the same nursery and in the same nursery, the collection of bacteria in the same nursery area has been detected since the beginning of the year. Children and the same body determine the separation location in the nursery of group 3 and the proximity location of the same group of strains in the same group. The bacteria are not allowed to colonize and invade the restricted fields in the nursery. In addition, the multiplicity of bacteria is very high, and this fungus has a high degree of mating, which indicates that it is instigated. This time, SK1, SK2, Nagasaki, Nagasaki. In K1 and K2, the whole 4 episodes of Fst were very low, and in the northern part of Kyushu, any mating set of bacteria in Kyushu and Kyushu. In 2002, the isolates of 31 strains from all over Kyushu were obtained, the first episode was analyzed, and the last 4 episodes, Fst, 0.04-0.06, weak crown height. Because of the high degree of differentiation between bacteria and bacteria, the degree of differentiation between bacteria and bacteria is very high.

项目成果

Chromosome complement of the fungal plant pathogen Fusarium graminearum based on genetic and physical mapping and cytological observations

• DOI: 10.1534/genetics.105.044842
• 发表时间: 2005-11-01
• 期刊: GENETICS
• 影响因子: 3.3
• 作者: Gale, LR;Bryant, JD;Kistler, HC
• 通讯作者: Kistler, HC

Genomic analyses and their application in Fusarium graminearum

基因组分析及其在禾谷镰刀菌中的应用

• 发表时间: 2005
• 期刊: Mycotoxins 55
• 作者: Gale LR;Bryant JD;Calvo S;Giese H;Katan T;O'Donnell K;Suga H;Taga M;Usgaard TR;Ward TJ;Kistler HC;Suga H
• 通讯作者: Suga H

ムギ類赤かび病菌Fusarium graminearumのゲノム解析の現状

禾谷镰刀菌（一种在小麦中引起禾谷镰刀菌的真菌）基因组分析的现状。

• 发表时间: 2004
• 期刊: 植物防疫 58
• 作者: Gale LR;Bryant JD;Calvo S;Giese H;Katan T;O'Donnell K;Suga H;Taga M;Usgaard TR;Ward TJ;Kistler HC;Suga H;須賀晴久;須賀 晴久
• 通讯作者: 須賀 晴久

Development of VNTR markers for two Fusarium graminearum clade species

• DOI: 10.1111/j.1471-8286.2004.00703.x
• 发表时间: 2004-09
• 期刊: Molecular Ecology Notes
• 作者: H. Suga;L. Gale;H. Kistler

Genetic diversity in Fusarium spp. causing Fusarium head blight of wheat and barley and its paradoxes

镰刀菌属的遗传多样性。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Soil Microorganisms 60
• 作者: Ishiyama;H.;小林 淳一;須賀晴久;Suga H
• 通讯作者: Suga H