オートトランスポータータンパク質の構造解析

自转运蛋白的结构分析

• 批准号: 05F05457
• 负责人: TAME Jeremy R.H. (2006)
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05F05457/
• 关键词: オートトランスポーター; 結晶構造解析; オートトランスポータータンパク質; X線結晶構造解析; 輸出メカニズム

私達は3つの方法でオートトランスポータータンパク質の研究を行っている。(1)我々が過去に立体構造決定した病原性大腸菌由来ヘム結合タンパク質(Hbp)の詳細な構造情報をもとにして、様々な箇所のアミノ酸残基を他の残基に置換したミュータントHbp発現ベクターを作成した。そして、どの箇所のアミノ酸置換がHbp分泌に影響を与えるかを調べた。結果、オートシャペロン部位、およびN末端シグナルシーケンス部位の置換が分泌に影響を与えると判明した。現在、これらの領域の機能について調査を続行している。(2)分泌される前の段階のオートトランスポータータンパク質は、シグナルペプチド、パッセンジャードメイン、βバレルドメイン、の3つの領域からなる。オートトランスポータータンパク質であるHbpとPetの混成タンパク質を作製することにより、パッセンジャードメインとβバレル部位の相互作用について調べる。すでにPetのβバレル部位が、Hbpのパッセンジャードメインを細菌の細胞膜外に分泌できることがわかっている。やはりアミノ酸置換によるミュータントを作製することにより、HbpとPetの相互作用部位を特定する。(3)オートトランスポータータンパク質であるSepA, Pic等の立体構造解析も開始する。また、オートトランスポータータンパク質のβバレル部位の結晶構造解析も開始する。すでにHbpのβバレル部位の大量発現方法を確立しており、巨大なパッセンジャードメインを輸送するこの部位の構造情報収集が期待される。

The research on quality of products has been carried out in China. (1)We have determined the origin of pathogenic E. coli by its three-dimensional structure and detailed structural information of the Hbp. We have determined the origin of pathogenic E. coli by replacing all the acid residues with other residues. The effect of acid replacement on Hbp secretion is regulated. The results showed that the N-terminal position of the tumor was closely related to the secretion of the tumor. Now, the function of this domain is checked. (2)In the previous stage of the separation, the quality of the product, the selection of the product, the product, the selection, the product, the selection, the selection, the product, the product Hbp and Pet are mixed together to control the interaction between them. The β-part of Pet, Hbp and Hbp are secreted outside the cell membrane of bacteria. The interaction site of Hbp and Pet is specified. (3)The analysis of three-dimensional structures such as SepA, Pic, etc. The crystal structure analysis of the β-part of the sample was started. A large number of discovery methods for Hbp beta sites are established, and the structural information collection of these sites is expected to be carried out.

项目成果

Expression, purification and crystallization of 2-oxo-hept-4-ene-1,7-dioate hydratase (HpeG) from lischerichia coli C.

大肠杆菌 2-oxo-hept-4-ene-1,7-dioate 水合酶 (HpeG) 的表达、纯化和结晶。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Aeta Crystallograph Sect F Struct Biol Cryst Commun. 62(Pt 10)
• 作者: Adachi T.;Izumi A.;Rea D.;Park SY.;Tame JR.;Roper DI.
• 通讯作者: Roper DI.

Rounding up : Engineering 12-membered rings from the cyclic Il-mer TRAP

四舍五入：从环状 Il-mer TRAP 设计 12 元环

• 发表时间: 2006
• 期刊: Structure. 14(5)
• 作者: Heddle JG.;Yokoyama T.;Yamashita I.;Park SY.;Tame JR.
• 通讯作者: Tame JR.

1.25 Å resolution crystal structures of human haemoglobin in the oxy, deoxy and carbonmonoxy forms

• DOI: 10.1016/j.jmb.2006.05.036
• 发表时间: 2006-07-14
• 期刊: JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
• 影响因子: 5.6
• 作者: Park, Sam-Yong;Yokoyama, Takeshi;Tame, Jeremy R. H.
• 通讯作者: Tame, Jeremy R. H.

Nickel binding to NiKA : an aditional binding site reconciles spectroscopy calorimetry and crystallography.

镍与 NiKA 的结合：一个额外的结合位点可协调光谱量热法和晶体学。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 63(Pt 2)
• 作者: Addy C.;Ohara M.;Kawai F.;Kidera A.;Ikeguchi M.;Fuchigami S.;Osawa M.;I.Park SY.;Tame JR.;Heddle JG.
• 通讯作者: Heddle JG.