オートトランスポータータンパク質の構造解析
オートトランスポータータンパク質の構造解析
批准号:
05F05457
负责人:
TAME Jeremy R.H. (2006)
金额:
$1.54万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2007
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英文摘要
私達は3つの方法でオートトランスポータータンパク質の研究を行っている。(1)我々が過去に立体構造決定した病原性大腸菌由来ヘム結合タンパク質(Hbp)の詳細な構造情報をもとにして、様々な箇所のアミノ酸残基を他の残基に置換したミュータントHbp発現ベクターを作成した。そして、どの箇所のアミノ酸置換がHbp分泌に影響を与えるかを調べた。結果、オートシャペロン部位、およびN末端シグナルシーケンス部位の置換が分泌に影響を与えると判明した。現在、これらの領域の機能について調査を続行している。(2)分泌される前の段階のオートトランスポータータンパク質は、シグナルペプチド、パッセンジャードメイン、βバレルドメイン、の3つの領域からなる。オートトランスポータータンパク質であるHbpとPetの混成タンパク質を作製することにより、パッセンジャードメインとβバレル部位の相互作用について調べる。すでにPetのβバレル部位が、Hbpのパッセンジャードメインを細菌の細胞膜外に分泌できることがわかっている。やはりアミノ酸置換によるミュータントを作製することにより、HbpとPetの相互作用部位を特定する。(3)オートトランスポータータンパク質であるSepA, Pic等の立体構造解析も開始する。また、オートトランスポータータンパク質のβバレル部位の結晶構造解析も開始する。すでにHbpのβバレル部位の大量発現方法を確立しており、巨大なパッセンジャードメインを輸送するこの部位の構造情報収集が期待される。
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Expression, purification and crystallization of 2-oxo-hept-4-ene-1,7-dioate hydratase (HpeG) from lischerichia coli C.
大肠杆菌 2-oxo-hept-4-ene-1,7-dioate 水合酶 (HpeG) 的表达、纯化和结晶。
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Aeta Crystallograph Sect F Struct Biol Cryst Commun. 62(Pt 10)
影响因子:
--
作者:
[Adachi T., Izumi A., Rea D., Park SY., Tame JR., Roper DI.]
通讯作者:
Roper DI.
Rounding up : Engineering 12-membered rings from the cyclic Il-mer TRAP
四舍五入:从环状 Il-mer TRAP 设计 12 元环
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Structure. 14(5)
影响因子:
--
作者:
[Heddle JG., Yokoyama T., Yamashita I., Park SY., Tame JR.]
通讯作者:
Tame JR.
DOI:
10.1016/j.jmb.2006.05.036
发表时间:
2006-07-14
期刊:
JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
影响因子:
5.6
作者:
[Park, Sam-Yong, Yokoyama, Takeshi, Tame, Jeremy R. H.]
通讯作者:
Tame, Jeremy R. H.
Nickel binding to NiKA : an aditional binding site reconciles spectroscopy calorimetry and crystallography.
镍与 NiKA 的结合:一个额外的结合位点可协调光谱量热法和晶体学。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 63(Pt 2)
影响因子:
--
作者:
[Addy C., Ohara M., Kawai F., Kidera A., Ikeguchi M., Fuchigami S., Osawa M., I.Park SY., Tame JR., Heddle JG.]
通讯作者:
Heddle JG.
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