折り畳み研究からのフィードバックを用いた新規蛋白質のデザイン

利用折叠研究的反馈设计新型蛋白质

基本信息

  • 批准号:
    05J01808
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.15万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2005
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2005 至 2006
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

まず一般的な折り畳みの機構の解明を試みた。独自の高速溶液混合装置とSPring-8でのX線小角散乱測定法を用いて、蛋白質の折り畳み初期に観察される収縮運動が、高分子の一般的な性質によって説明されることを示し、「Journal of Molecular Biology」誌に掲載された。一般性が示された折り畳み初期の収縮状態のアミノ酸レベルでの構造を知る為に、平成17年6.月13日から7月31日まで米国カリフォルニア州のScripps研究所において、NMRの権威であるPeter Wright教授のもとで、我々の持つ高速溶液混装置を使ってアポミオグロビンのH/D交換実験を行った。この結果は初期収縮状態のアンサンブルの中で、より安定な構造への分布の変化を捉えたもので、PNAS誌への投稿に向け、多忙なWright教授とメールで議論を続けており近日中に投稿する予定である。以上の結果は、平成18年度中の国際会議での招待講演等の形で発表する機会に恵まれた。蛋白質をデザインするにあたって、より短いペプチドの構造のデザインを先ず試みた。様々なコンフォメーションをとりうるペプチドを意図した構造に折り畳ませるという目標ため、抗体が抗原を認識する特定構造単位に注目した。特定の構造をとらない抗原ペプチドは、抗体の結合により特定の構造に折り畳む。このダイナミクスの変化を捉える為に、長寿命の蛍光を消光できる化合物の合成を行った。これらの実験は、平成18年6月から、蛋白質の折り畳みを他の分野に活用しようと試みているKevin Plaxco教授の下で行った。不安定な化合物の有機合成は困難を極めたが、先日ようやくペプチドへの接合に成功した。これにより、構造の変化を捉えることができ、意図した構造に折り畳んだかどうかを知ることが出来る。ペプチドの精製が済めば、直ぐにでもダイナミクスの測定ができる状態にある。
The general structure of the system is explained. The application of a separate high-speed solution mixing device and SPring-8 X-ray small angle scattering assay, the initial detection of protein degradation, the description of general properties of polymers, and the Journal of Molecular Biology are described. The structure of the sample was known on June 13, 2017 and July 31, 2017 at Scripps Research Institute in California, USA. The NMR spectrum was determined by Professor Peter Wright. The H/D exchange process was carried out in a high-speed solution mixing device. The results include: initial shrinkage state, stable structure distribution, contribution direction of PNAS journal, busy professor Wright, discussion and prediction of recent contribution. The above results are presented in the form of presentations at international conferences in 2018. The structure of the protein was studied first. The first is to recognize the specific structure of the antibody. Specific structure: antigen binding, antibody binding, specific structure folding. The synthesis of compounds with long life span and extinction is carried out. In June 2018, Prof. Kevin Plaxco conducted research on protein synthesis and its application. The organic synthesis of unstable compounds is extremely difficult, and the successful combination of these compounds has been achieved. The structure of the structure. The quality of the product is very high.

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Specific collapse followed by slow hydrogen-bond formation of beta-sheet in the folding of single-chain monellin.
在单链莫内林折叠中,特异性塌陷随后缓慢形成β-折叠氢键。
Time-Resolved Small Angle X-ray Scattering Investigation on the Folding Dynamics of Heme Oxygenase : Implication of the Scaling Relationship for the Submillisecond Intermediates of Protein Folding
血红素加氧酶折叠动力学的时间分辨小角 X 射线散射研究:蛋白质折叠亚毫秒中间体的标度关系的含义
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  • DOI:
    10.1016/j.jmb.2005.04.074
  • 发表时间:
    2005-07-08
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Kimura, T;Akiyama, S;Takahashi, S
  • 通讯作者:
    Takahashi, S
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鵜澤 尊規;Thoa TRAN;伊藤 嘉浩;古澤 宏幸
  • 通讯作者:
    古澤 宏幸
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鵜澤 尊規;Thoa TRAN;伊藤 嘉浩
  • 通讯作者:
    伊藤 嘉浩
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    多田 誠一;皆川 倫子;鵜澤 尊規;伊藤 嘉浩
  • 通讯作者:
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    2007
  • 资助金额:
    $ 1.15万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

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    2024
  • 资助金额:
    $ 1.15万
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    2024
  • 资助金额:
    $ 1.15万
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    2024
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    $ 1.15万
  • 项目类别:
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