がん細胞およびその遺伝子異常を検出するイメージング分子の開発
がん細胞およびその遺伝子異常を検出するイメージング分子の開発
批准号:
05J02228
负责人:
山田 久嗣
金额:
$1.73万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2007
中文摘要
前年度までに、DNA分子内に存在する5-メチルシトシン(mC)塩基のナフトキノン(NQ)増感光-電子酸化を経るDNA鎖の部位選択的切断反応をモニターすることによりmC変異部位を簡便に検出できることを明らかにした。また、より高感度なDNAメチル化検出系へと展開、拡張することを目的として、p53がん抑制遺伝子の部分塩基配列をmC部位で切断調製した実存DNAを標的とするNQ増感光酸化反応を調べるとともに、インベーダー法を改変することにより、メチル化遺伝子の高感度検出システムを構築した。また、改変インベーダー法によるシグナル増幅の結果、サブフェムトモルの微量メチル化DNAを蛍光法により検出し得ることを明らかにした。今年度は、DNA内mC塩基の光電気化学的検出法の開発を目的として、DNA分子内ホール移動を誘起する光酸化機能部位としてアントラキノン(AQ)を選択し、AQ修飾ウリジンならびに3'末端にチオール基を導入した機能性核酸プローブ(AQ-Probe)を合成した。金電極上に固定化したAQ-Probeと制限酵素認識部位にシトシンまたはmCを含む標的DNAを二重鎖形成させ、メチル化感受性制限酵素処理の前後における光電流を直接計測した。その結果、非メチル化二重鎖はメチル化感受性制限酵素の作用によってDNA鎖が切断し、光電流密度が減少することを観測した。他方、メチル化二重鎖の揚合は、DNA鎖切断が起こらず、DNA分子内ホール移動反応に起因する高い光電流応答を保持した。また、p53がん抑制遺伝子の部分配列を検出対象として、酵素処理後の光電流を計測した結果、メチル化二重鎖からは高い光電流密度を観測し得たことから、金電極固定化DNA二重鎖内のホール移動反応特性とメチル化感受性制限酵素処理を併用することにより、標的となるメチル化DNAを光電気化学的手法により検出可能であることを明らかにした。
英文摘要
前年度までに、DNA分子内に存在する5-メチルシトシン(mC)塩基のナフトキノン(NQ)増感光-電子酸化を経るDNA鎖の部位選択的切断反応をモニターすることによりmC変異部位を簡便に検出できることを明らかにした。また、より高感度なDNAメチル化検出系へと展開、拡張することを目的として、p53がん抑制遺伝子の部分塩基配列をmC部位で切断調製した実存DNAを標的とするNQ増感光酸化反応を調べるとともに、インベーダー法を改変することにより、メチル化遺伝子の高感度検出システムを構築した。また、改変インベーダー法によるシグナル増幅の結果、サブフェムトモルの微量メチル化DNAを蛍光法により検出し得ることを明らかにした。今年度は、DNA内mC塩基の光電気化学的検出法の開発を目的として、DNA分子内ホール移動を誘起する光酸化機能部位としてアントラキノン(AQ)を選択し、AQ修飾ウリジンならびに3'末端にチオール基を導入した機能性核酸プローブ(AQ-Probe)を合成した。金電極上に固定化したAQ-Probeと制限酵素認識部位にシトシンまたはmCを含む標的DNAを二重鎖形成させ、メチル化感受性制限酵素処理の前後における光電流を直接計測した。その結果、非メチル化二重鎖はメチル化感受性制限酵素の作用によってDNA鎖が切断し、光電流密度が減少することを観測した。他方、メチル化二重鎖の揚合は、DNA鎖切断が起こらず、DNA分子内ホール移動反応に起因する高い光電流応答を保持した。また、p53がん抑制遺伝子の部分配列を検出対象として、酵素処理後の光電流を計測した結果、メチル化二重鎖からは高い光電流密度を観測し得たことから、金電極固定化DNA二重鎖内のホール移動反応特性とメチル化感受性制限酵素処理を併用することにより、標的となるメチル化DNAを光電気化学的手法により検出可能であることを明らかにした。
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Sensitive discrimination between cytosine and 5-methylcytosine in DNA by a modified invader method
改进的侵入法灵敏区分 DNA 中的胞嘧啶和 5-甲基胞嘧啶
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Nucleic Acids Symp.Ser. 50
影响因子:
--
作者:
[Yamada, H., Tanabe, K., Nishimoto, S.]
通讯作者:
S.
Detection of 5-methylcytosine in DNA by photo-functionalized oligodeoxynucleotides possessing 2-methyl-1,4-naphthoquinone chromophore
利用具有 2-甲基-1,4-萘醌发色团的光功能化寡脱氧核苷酸检测 DNA 中的 5-甲基胞嘧啶
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Nucleic Acids Symp.Ser. 49
影响因子:
--
作者:
[Yamada, H., Tanabe, K., Nishimoto, S.]
通讯作者:
S.
Site-Selective Strand Cleavage at Methylated Cytosine:Regional Effect of Naphthoquione Chromophore on the One-Electron Photooxidation of 5-Methylcytosine and Positive Change Transfer in DNA
甲基化胞嘧啶的位点选择性链断裂:萘醌发色团对 5-甲基胞嘧啶单电子光氧化和 DNA 正变化转移的区域效应
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yamada, H.;Tanabe, K.;Nishimoto, S.]
通讯作者:
S.
Photocurrent Response after EnzymaticTreatment of DNA Duplexes Immobilized on GoId EIectrodes:Electrochemical Discrimination of 5-Medlylcytosine Modification in DNA
固定在金电极上的 DNA 双链体酶处理后的光电流响应:DNA 中 5-甲基胞嘧啶修饰的电化学辨别
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
Organic & Biomolecular Chemistry 6
影响因子:
--
作者:
[Yamada, H.;Tanabe, K.;Nishimoto, S.]
通讯作者:
S.
Evaluation of the Regional Effect of2-Methyl-1,4-naphthoquinone Chromophore on the One-Electron Photooxidation and Selective Strand Cleavage at 5-Methylcytosine in DNA
2-甲基-1,4-萘醌发色团对 DNA 中单电子光氧化和 5-甲基胞嘧啶选择性链断裂的区域效应评估
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yamada, H.;Tanabe, K.;Nishimoto, S.]
通讯作者:
S.
共 10 条
多重共鳴MRI技術の拡張による双極性ポリマープローブの粒子径イメージング法の構築
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批准号:19H02852
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.07万
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财政年份:2019
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负责人:山田 久嗣
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依托单位:
海外基金