3本鎖認識コードの拡張を目的とする人工ヌクレオシドの創製
为了扩展三链识别码而创建人工核苷
基本信息
- 批准号:05J06059
- 负责人:
- 金额:$ 1.15万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2005
- 资助国家:日本
- 起止时间:2005 至 2006
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
非天然型3本鎖DNAの形成を目指して、ビシクロ型人工核酸(WNA:W-shaped nucleoside analogues)の芳香環部分を種々に変換した新規WNA誘導体の合成を行った。これまでの結果を踏まえて、芳香環部分の大きさはベンゼン環くらいか、ベンゼン環に置換基を有するぐらいの大きさが適当であることを考慮して、新規WNA誘導体の分子設計を行った。設計した人工核酸を有機合成して、3本鎖形成オリゴヌクレオチドに導入し、3本鎖形成能の評価をゲルシフトアッセイにより評価した。合成した化合物の中で、芳香環部分にピリジン環を有するWNA-βT誘導体が、親和性は弱いものの全ての配列でミスマッチサイトであるTA塩基対を比較的選択的に認識した。このことにより、完全では無いが認識の一般性を有するWNA誘導体を見いだすことに成功した。また、メチル基を有するWNA誘導体を含んだオリゴヌクレオチドが3本鎖DNA形成能と、2本鎖DNAへのクロスインベージョン能を有することが明らかとなった。この鎖交換反応は非常に早く起こり、WNA誘導体を含むオリゴヌクレオチド(3本目の鎖)が2本鎖DNAに作用すると、2本鎖DNAがはがれ、それと同時に3本目の鎖とピリミジン鎖とがパラレル型2本鎖DNAを形成する。その後、プリン鎖と相互作用して3本鎖DNAを形成していることが明らかとなった。また、渡米先の研究室において、新規認識塩基の分子設計および合成を行い、人工的に合成した核酸誘導体をオリゴヌクレオチドに組み込むことにより、グアニンあるいはアデニンを選択的に認識する人工塩基の開発に成功した。
The formation of non-natural 3-locked-DNA is indicated by the transformation of aromatic ring portion of WNA (W-shaped nucleotide analogues) and the synthesis of new WNA inducers. The result of this study is that the molecular design of the WNA inducer is proposed in this paper. Design of artificial nucleic acids for organic synthesis, 3-lock formation, introduction, 3-lock formation and evaluation of the ability to form The synthesis of WNA-βT elicitors in the middle and aromatic ring portions of the compounds, their affinity and overall alignment, and their comparative selection of TA bases were discussed. The WNA inducer is successful in understanding the generality of WNA. WNA inducers include three local-DNA formation abilities and two local-DNA formation abilities. The lock exchange reaction starts very early, and WNA inducer is formed by the reaction of 2 lock DNA and 2 lock DNA and 3 lock DNA. The DNA of the three locks is formed by the interaction of the two locks. The molecular design and synthesis of new recognition bases in advanced research laboratories, artificial synthesis of nucleic acid inducers, and successful development of artificial recognition bases
项目成果
期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Modification of the aromatic ring of the WNA analogues for expansion of the triplex recognition codes
修饰 WNA 类似物的芳环以扩展三重识别码
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:E.Aoki;Y.Taniguchi;M.Togo;S.Sasaki;Y.Taniguchi et al.;Y.Taniguchi et al.
- 通讯作者:Y.Taniguchi et al.
Expansion of triplex recognition codes by the use of novel bicyclic nucleoside derivatives (WNA)
使用新型双环核苷衍生物(WNA)扩展三链体识别代码
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Taniguchi;Y.;Nakamura;A.;Senko;Y.;Kodama;K.;Nagatsugi;F.;Sasaki;S
- 通讯作者:S
Effects of Halogenated WNA Derivatives on Sequence Dependency for Expansion of Recognition Sequences in the Non-Natural Type Triplexes
卤化 WNA 衍生物对非天然型三链体中识别序列扩展的序列依赖性的影响
- DOI:
- 发表时间:2006
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Taniguchi Y.;Nakamura A.;Senko Y.;Nagatsugi F.;Sasaki S
- 通讯作者:Sasaki S
Effect of the modified aromatic ring of WNA on stability of triplex DNA
WNA 芳环修饰对三链 DNA 稳定性的影响
- DOI:
- 发表时间:2006
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:E.Aoki;Y.Taniguchi;M.Togo;S.Sasaki
- 通讯作者:S.Sasaki
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