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ミトコンドリアDNAに基づくフグ目に関する系統解析と新たな分子マーカーの探索

ミトコンドリアDNAに基づくフグ目に関する系統解析と新たな分子マーカーの探索
基于线粒体DNA的河豚系统发育分析及寻找新的分子标记
批准号:
05J10824
负责人:
山野上 祐介
金额:
$2.11万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2007

项目摘要

项目成果

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1.フグ目フグ科とフグ目に近縁とされているニザダイ亜目について合計20種のミトコンドリアDNA全塩基配列を決定した.ほぼすべてのミトコンドリアDNA多くの脊椎動物に共通の遺伝子配置を持っていたが,スダレダイ科の2種については大規模な配置変動が見られた.2.ベイズ法によってフグ目の内部の系統解析を行った.またGarliやRAxMLなど新たな最尤法のプログラムの解析速度が非常に速く,これまでのベイズ法による解析よりも精度が高いものが得られるようになった.フグ目の内部系統についてそれらを使って解析を行ったところ,最尤法とベイズ法の結果はほぼ一致したものの,過去の形態に基づく仮説や近年行われた他の研究グループDNA配列に基づく仮説とは大きく異なり,深海グループと浅海・淡水グループの2群に大きく分かれるという結果となった.現在この結果はBMCEvolutionary Biology誌に投稿中である.3.フグ科トラフグ属の入手可能な15種について系統解析及び分岐年代推定を行った.その結果,トラフグ属の各種は3-400万年前に東シナ海を中心とした非常に狭い地域で一斉に分岐したことが分かった.ゲノム生物学のモデル生物であるトラフグの配列はヒトなどの離れた脊椎動物と比較されることがほとんどであったが,この研究により分岐年代と各種の系統関係が明らかになったことで,シクリッド類のようにトラフグ属が種分化研究に用いられることが期待できる.
期刊论文(6)
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科研奖励(0)
会议论文
Rapid radiation and speciation of Takifugu species in marine waters of East Asia : Another use of the fugu, Takifugu rubripes as a model
东亚海水中东方东方鲀物种的快速辐射和物种形成:东方东方鲀红鳍东方鲀作为模型的另一种用途
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [Yamanoue, Y., M. Miya, H. Sakai, K. Matsuura, S. Miyazawa, N. Miyamoto, M. Nishida]
通讯作者: M. Nishida
Redescription of Acropoma lecorneti Fourmanoir,1988 (Perciformes:Acropomatidae)and with its first record from the North Pacific Ocean
Acropoma lecorneti Fourmanoir 的重新描述,1988(鲈形目:Acropomatidae)及其来自北太平洋的第一个记录
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: Ichthyological Research (in press)(掲載確定)
影响因子: --
作者: [Amano Y, Sugiyama M, Lee JS, Kawakubo K, Mori K, Tang, AC, Akabayashi A, Yamanoue Y.]
通讯作者: Yamanoue Y.
DOI: 10.1266/ggs.81.29
发表时间: 2006-02-01
期刊: GENES & GENETIC SYSTEMS
影响因子: 1.1
作者: [Yamanoue, Yusuke, Miya, Masaki, Nishida, Mutsumi]
通讯作者: Nishida, Mutsumi
Doederleinia gracilispinis(Fowler,1943),a junior synonym of Doederleinia berycoides(Hilgendorf,1879),with a taxonomic review of the genus
Doederleinia gracilispinis(Fowler,1943),Doederleinia berycoides(Hilgendorf,1879)的初级同义词,以及该属的分类学回顾
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: Ichthyological Research 54
影响因子: --
作者: [Amano Y, Sugiyama M, Lee JS, Kawakubo K, Mori K, Tang, AC, Akabayashi A, Yamanoue Y., Yamanoue Y., Yamanoue Y.]
通讯作者: Yamanoue Y.
フグ目及びその近縁群の多様な形態の進化過程の解明
海外基金