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アコヤ貝の貝殻形成に関与する有機基質の構造および機能解析

参与珍珠贝壳形成的有机底物的结构和功能分析

基本信息

批准号：
05J11934
负责人：
鈴木道生
金额：
$ 1.73万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究の材料であるアコヤ貝貝殻は内側に炭酸カルシウムのアラゴナイト結晶から成る真珠層、外側に炭酸カルシウムのカルサイト結晶から成る稜柱層と、異なる2つの結晶多形から構成されているのが特徴である。このように同一の場に最安定であるカルサイト結晶と準安定であるアラゴナイト結晶を作り出す機構に、有機基質が関与していると考えられるが、未だそのメカニズムは不明である。そこで貝殻から有機基質を単離・精製し、構造機能解析を行うことで貝殻形成のメカニズムを明らかにすることを目的とした。真珠層から不溶性成分を抽出し、カルサイトとアラゴナイトの結晶にそれぞれ結合させたところ、分子質量約80kDaのバンドがアラゴナイト結晶に特異的に結合することが判明した。この80kDa付近のバンドのN末端アミノ酸配列および内部アミノ酸配列を解析し、その配列を基にRT-PCRを行い、5'-RACE、3'-RACEを行うことにより全長約3kbpの全塩基配列を決定した。相同性検索の結果、有意に相同性のあるものは存在せず、新規のタンパク質であったため、この分子をPifと命名した。Pifの配列解析を行ったところ、80kDaのバンド(Pif80)のN末端配列の上流にRXKR配列を挟んでさらに上流に配列が存在することが判明した。上流のタンパク質はPif80の高分子側に位置するバンドであることが判明し、これをPif97と命名した。Pif97はタンパク質間相互作用に働くVWAドメインとキチンとの結合に働くキチンもbindingドメインを有しており、またシステイン残基を23個持つことからジスルフィド結合による強固な立体構造を取ることが示唆された。Pif80はアスパラギン酸を28.5%も含む配列であり、他にもグルタミン酸4.1%、リジン18.7%、アルギニン10.9%と合計で解離性のアミノ酸を62.2%も含む親水性タンパク質であることが判明した。既知のドメインは存在せず、全体としてDDRKといった酸性アミノ酸と塩基性アミノ酸の繰り返しの配列が見られた。今後はこのPif分子について詳細な解析を行っていきたいと考えている。

In this study, the material shell is composed of two layers: inner layer and outer layer. The inner layer is composed of carbon and the outer layer is composed of carbon. In the same field, the most stable, crystalline, quasi-stable, crystalline, organic matrix, related and unknown. The organic matrix is separated, refined, and structurally functional. Insoluble components in the pearl layer were extracted and identified in the crystal with a molecular weight of about 80kDa. The N-terminal amino acid sequence and the internal amino acid sequence of the 80kDa protein were analyzed, and the nucleotide sequence was determined by RT-PCR, 5'-RACE and 3'-RACE. Identical search results, intentional identity of the existence of the new, the new, the molecular name Pif alignment analysis, 80kDa (Pif80) N-terminal alignment of the upstream RXKR alignment, the presence of upstream alignment was identified. The polymer side position of Pif80 is determined by the name of Pif97 Pif97 has 23 strong binding residues in the mass-to-mass interaction. Pif80 has 28.5% of dissociative acid, 4.1% of dissociative acid, 18.7% of dissociative acid, 10.9% of dissociative acid, 62.2% of dissociative acid, and 10.9% of dissociative acid. It is known that there is no such thing as acid or basic acid in DDRK. In the future, Pif molecules will be analyzed in detail.