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レドックスをセンスする新規ヘム制御ホスホジエステラーゼの結晶構造

レドックスをセンスする新規ヘム制御ホスホジエステラーゼの結晶構造
新型氧化还原感应血红素调节磷酸二酯酶的晶体结构
批准号:
17780073
负责人:
黒河 博文
金额:
$2.37万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006

项目摘要

项目成果

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近年、ヘム濃度やヘムリガンド(酸素分子、一酸化炭素、一酸化窒素等)の濃度変化を感知して、これを細胞シグナルへと変換するヘムセンサーと呼ばれる新しいヘムタンパク質ファミリーが次々と見つかり、注目を浴びている。本研究では大腸菌のヘムセンサータンパク質であるヘム制御ホスホジエステラーゼ(EcDOS)に着目した。ヘムセンサードメインについて、活性型であるヘム鉄還元型、ヘム鉄酸化型の両方についてその結晶構造を明らかにした。高分解能の結晶構造解析から、ヘムの酸化還元状態の違いによってヘムリガインドの交換が起こり、これがEcDOSヘムセンサードメインの三次元構造を変化させていることが明らかとなった。この構造変化がホスホジエステラーゼの活性を制御に関わっている可能性が強く示唆されたため、ヘムポケットを構成する疎水性アミノ酸を部位特異的変異法を用いて別のアミノ酸に置換し、その効果を検討した。一酸化炭素のヘムセンサーとして転写制御に関わっている体内時計関連転写因子NPAS2の機能解析も行った。NPAS2はアミノ末端領域にDNA結合部位を有し、続いて2つのヘム結合PASドメイン(PAS-A、PAS-Bドメイン)を有する。そこで、PAS-Aドメインについて、ヘム結合、一酸化炭素結合等について詳細な解析を行うとともに、ヘム結合のDNA結合に対する効果について検討した。さらに、ヘム濃度に依存して翻訳レベルでタンパク質合成を制御するeIF2 alpha kinaseについて、多量体形成、ヘム結合と活性阻害などについて詳細な解明を行った。
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会议论文
Characterization of heme-regulated eIF2 alpha kinase : Roles of the N-terminal domain in the oligomeric state, heme binding, catalysis, and inhibition
血红素调节的 eIF2 α 激酶的表征:N 末端结构域在寡聚状态、血红素结合、催化和抑制中的作用
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Biochemistry 45
影响因子: --
作者: [M. Miksanova, J. Igarashi, M. Minami, I. Sagami, S. Yamauchi, H. Kurokawa, T. Shimizu]
通讯作者: T. Shimizu
DOI: 10.1111/j.1742-4658.2005.04828.x
发表时间: 2005-08-01
期刊: FEBS JOURNAL
影响因子: 5.4
作者: [Koudo, R, Kurokawa, H, Shimizu, T]
通讯作者: Shimizu, T
Critical Roles of Leu99 and Leu115 at the Heme Distal Side in Autooxidation and the Redox Potential of a Heme-regulated Phosphodiesterase from Escherichia coli (Ec DOS)
血红素远端的 Leu99 和 Leu115 在大肠杆菌 (Ec DOS) 血红素调节的磷酸二酯酶的自氧化和氧化还原电位中的关键作用
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: FEBS Journal 273
影响因子: --
作者: [Miksanova M.他, Mukaiyama Y.他, Yokota N.他]
通讯作者: Yokota N.他
Dual Effects of the Substrate and Pterins on the Kinetics of CO Binding to Neuronal Nitric Oxide Synthase : A Laser Flash Photolysis Study
底物和蝶呤对 CO 与神经元一氧化氮合酶结合动力学的双重影响:激光闪光光解研究
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: Chem.Lett 34
影响因子: --
作者: [Miksanova M.他, Mukaiyama Y.他, Yokota N.他, Bengea S.N他]
通讯作者: Bengea S.N他
Next Generation Crystal Structure Analysis by Cryo-Electron Microscopy
  • 批准号:
    23K18001
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
  • 资助金额:
    $4.16万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    黒河 博文
  • 依托单位:
蛋白質生合成を翻訳レベルで調節するヘム関連キナーゼのX線結晶構造解析
  • 批准号:
    15780066
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 资助金额:
    $2.43万
  • 财政年份:
    2003
  • 负责人:
    黒河 博文
  • 依托单位:
安定同位体標識利用NMR法による生体高分子三次元構造の解明
  • 批准号:
    99J07212
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $2.3万
  • 财政年份:
    1999
  • 负责人:
    黒河 博文
  • 依托单位:
海外基金