课题基金 / 基金详情

蛋白質生合成を翻訳レベルで調節するヘム関連キナーゼのX線結晶構造解析

蛋白質生合成を翻訳レベルで調節するヘム関連キナーゼのX線結晶構造解析
在翻译水平调节蛋白质生物合成的血红素相关激酶的 X 射线晶体结构分析
批准号:
15780066
负责人:
黒河 博文
金额:
$2.43万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
近年、ヘムやヘムリガンド(酸素分子、一酸化炭素、一酸化窒素等)の濃度変化を感知して、これを細胞シグナルへと変換するヘムセンサーと呼ばれる新しいヘムタンパク質ファミリーが次々と見つかり、注目を浴びている。本研究では、未だ不明であるヘムセンサータンパク質のセンシング機構を解明するため、いくつかのヘムセンサータンパク質について結晶構造解析を行った。本研究ではまず、ストレス(ヘム濃度低下)に応答してmRNAから蛋白質への翻訳を阻害するheme-regulated eIF-2α kinase(HRI)に着目した。HRIは基質である翻訳制御因子(eIF-2α)をリン酸化することによって、mRNAから蛋白質への翻訳を阻害するキナーゼであり、そのN末端領域(約140残基)がヘム結合部位としてストレスセンサーとして働いていると考えられている。HRIの分子内シグナル伝達の初期段階での構造変化を解明するために、HRIのN未端ヘム結合ドメインのX線結晶構造解明を目指し、そのN末端ドメインの結晶化を試みた。様々な結晶化スクリーニングキットと結晶化用恒温装置を用いた4℃と25℃での条件検索により、ヘム結合状態において、微結晶を得ることができた。その後結晶化の最適条件をスクリーニングしているが、X線結晶構造に適した大きな結晶を調整するには至っていない。また、本研究では大腸菌のヘムセンサータンパク質であるヘム制御ホスホジエステラーゼ(EcDOS)のヘムセンサードメインの結晶化も並行して行い、その結晶化に成功した。そして、活性型の還元型、不活性型の酸化型の両方についてその構造解析に世界で初めて成功した。高分解能の結品構造解析から、ヘムの酸化還元状態の違いによってヘムリガインドの交換が起こり、これがのEcDOSヘムセンサードメインの三次元構造を変化させていることが明らかとなった。この構造変化がホスホジエステラーゼの活性制御に関わっていることが強く示唆された。
英文摘要
近年、ヘムやヘムリガンド(酸素分子、一酸化炭素、一酸化窒素等)の濃度変化を感知して、これを細胞シグナルへと変換するヘムセンサーと呼ばれる新しいヘムタンパク質ファミリーが次々と見つかり、注目を浴びている。本研究では、未だ不明であるヘムセンサータンパク質のセンシング機構を解明するため、いくつかのヘムセンサータンパク質について結晶構造解析を行った。本研究ではまず、ストレス(ヘム濃度低下)に応答してmRNAから蛋白質への翻訳を阻害するheme-regulated eIF-2α kinase(HRI)に着目した。HRIは基質である翻訳制御因子(eIF-2α)をリン酸化することによって、mRNAから蛋白質への翻訳を阻害するキナーゼであり、そのN末端領域(約140残基)がヘム結合部位としてストレスセンサーとして働いていると考えられている。HRIの分子内シグナル伝達の初期段階での構造変化を解明するために、HRIのN未端ヘム結合ドメインのX線結晶構造解明を目指し、そのN末端ドメインの結晶化を試みた。様々な結晶化スクリーニングキットと結晶化用恒温装置を用いた4℃と25℃での条件検索により、ヘム結合状態において、微結晶を得ることができた。その後結晶化の最適条件をスクリーニングしているが、X線結晶構造に適した大きな結晶を調整するには至っていない。また、本研究では大腸菌のヘムセンサータンパク質であるヘム制御ホスホジエステラーゼ(EcDOS)のヘムセンサードメインの結晶化も並行して行い、その結晶化に成功した。そして、活性型の還元型、不活性型の酸化型の両方についてその構造解析に世界で初めて成功した。高分解能の結品構造解析から、ヘムの酸化還元状態の違いによってヘムリガインドの交換が起こり、これがのEcDOSヘムセンサードメインの三次元構造を変化させていることが明らかとなった。この構造変化がホスホジエステラーゼの活性制御に関わっていることが強く示唆された。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
A Redox-controlled Molecular Switch Revealed y the Crystal Structure of a Bacterial Heme PAS Sensor
氧化还原控制的分子开关揭示了细菌血红素 PAS 传感器的晶体结构
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Journal of Biological Chemistry 279
影响因子: --
作者: [A.Kaneko, T.Umeyama, N.Hanaoka, B.C.Monk, Y.Uehara, M.Niimi., H.Kurokawa]
通讯作者: H.Kurokawa
DOI: 10.1111/j.1432-1033.2004.04331.x
发表时间: 2004-10
期刊: European journal of biochemistry
影响因子: --
作者: [Miki Watanabe;H. Kurokawa;Tokiko Yoshimura-Suzuki;I. Sagami;Toru Shimizu]
通讯作者: Miki Watanabe;H. Kurokawa;Tokiko Yoshimura-Suzuki;I. Sagami;Toru Shimizu
Fluorescence Spectral Studies of Trp53Phe and Trp110Ile Mutants of a Heme-regulated Phosphodiesterase from Escherichia coli
大肠杆菌血红素调节磷酸二酯酶 Trp53Phe 和 Trp110Ile 突变体的荧光光谱研究
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Chemistry Letter 33
影响因子: --
作者: [A.Kaneko, T.Umeyama, N.Hanaoka, B.C.Monk, Y.Uehara, M.Niimi., H.Kurokawa, S.Hirata]
通讯作者: S.Hirata
Next Generation Crystal Structure Analysis by Cryo-Electron Microscopy
  • 批准号:
    23K18001
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
  • 资助金额:
    $4.16万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    黒河 博文
  • 依托单位:
レドックスをセンスする新規ヘム制御ホスホジエステラーゼの結晶構造
  • 批准号:
    17780073
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 资助金额:
    $2.37万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    黒河 博文
  • 依托单位:
安定同位体標識利用NMR法による生体高分子三次元構造の解明
  • 批准号:
    99J07212
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $2.3万
  • 财政年份:
    1999
  • 负责人:
    黒河 博文
  • 依托单位:
海外基金