ヒトナルコレプシー及び睡眠障害感受性遺伝子の探索
ヒトナルコレプシー及び睡眠障害感受性遺伝子の探索
批准号:
17790224
负责人:
川嶋 実苗
金额:
$2.24万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006
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英文摘要
本研究の目的は、ヒトナルコレプシーをはじめとする睡眠障害の新たな感受性・抵抗性遺伝子を見出すことである。昨年度までに約2万3000個のマイクロサテライトマーカーを用いたゲノムワイドな関連解析(1次・2次スクリーニング)を行ない、いくつかの候補マーカーを見出している。本年度はその候補マーカーの内、ヒトナルコレプシーの既知感受性遺伝子であるヒト白血球抗原(HLA)領域(6p21.3)近傍上流に存在するマーカー(MS1)周辺の解析を進めた。まず、pooled DNAを用いた1次,2次スクリーニングによって検出された関連の確認を患者群231名、対照群420名分のゲノムDNAを用いた個別資料タイピングにより行なった。フィッシャーの直接検定法による各アリルに対する2x2分割表を用いた統計解析を行なった結果、MS1の13アリルのうち3アリルが有意差に至り、ナルコレプシーとMS1との関連が示唆された。ほとんどの日本人ナルコレプシー患者はHLA-DRB1*1501アリルを所有することから、HLA-DRB1*1501をヘテロ接合で所有する対照群112名と、先程とは別の患者群170名を用いた関連解析も行なった。その結果、対象検体数が減少したことで検出力は低下したものの、1アリルにおいて依然として有意差に至り、疾患との関連が確認できた。次に、HapMapプロジェクトデータベースに登録されている日本人44人分のSNPs結果を用いてMS1周辺の連鎖不平衡(LD)ブロックを確認し、MS1を含むLDブロック及び両隣のブロック内のTag SNPsを用いた解析を行なった(患者群190名、対照群190名)。その結果、33SNPsが有意差に至り、その中の19SNPsは、HLA-DRB1*1501ヘテロ接合体を用いた解析においても有意差に至った(患者群143名、対照群103名)。これら19SNPsについて最大尤度推定値分析を行なったところ、SNP5とSNP15を持つときに最大尤度を示した(P<0.05)。
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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
新規ヒトナルコレブシー関連遺伝子の同定
新型人类嗜睡病相关基因的鉴定
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
医学の歩み 219
影响因子:
--
作者:
[Kawashima M.et al., 川嶋 実苗]
通讯作者:
川嶋 実苗
DOI:
10.1086/505539
发表时间:
2006-08-01
期刊:
AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS
影响因子:
9.8
作者:
[Kawashima, Minae, Tamiya, Gen, Tokunaga, Katsushi]
通讯作者:
Tokunaga, Katsushi
新規ナルコレプシー関連遺伝子
新型嗜睡症相关基因
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
睡眠障害の発症および病態に関与する遺伝要因の探索
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批准号:19790245
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2007
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负责人:川嶋 実苗
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依托单位:
ゲノムワイドな関連分析による多因子疾患の感受性遺伝子の探索
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批准号:03J61514
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2003
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负责人:川嶋 実苗
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依托单位:
海外基金