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ヒトナルコレプシー及び睡眠障害感受性遺伝子の探索

寻找人类嗜睡症和睡眠障碍易感基因

基本信息

批准号：
17790224
负责人：
川嶋実苗
金额：
$ 2.24万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究の目的は、ヒトナルコレプシーをはじめとする睡眠障害の新たな感受性・抵抗性遺伝子を見出すことである。昨年度までに約2万3000個のマイクロサテライトマーカーを用いたゲノムワイドな関連解析(1次・2次スクリーニング)を行ない、いくつかの候補マーカーを見出している。本年度はその候補マーカーの内、ヒトナルコレプシーの既知感受性遺伝子であるヒト白血球抗原(HLA)領域(6p21.3)近傍上流に存在するマーカー(MS1)周辺の解析を進めた。まず、pooled DNAを用いた1次,2次スクリーニングによって検出された関連の確認を患者群231名、対照群420名分のゲノムDNAを用いた個別資料タイピングにより行なった。フィッシャーの直接検定法による各アリルに対する2x2分割表を用いた統計解析を行なった結果、MS1の13アリルのうち3アリルが有意差に至り、ナルコレプシーとMS1との関連が示唆された。ほとんどの日本人ナルコレプシー患者はHLA-DRB1*1501アリルを所有することから、HLA-DRB1*1501をヘテロ接合で所有する対照群112名と、先程とは別の患者群170名を用いた関連解析も行なった。その結果、対象検体数が減少したことで検出力は低下したものの、1アリルにおいて依然として有意差に至り、疾患との関連が確認できた。次に、HapMapプロジェクトデータベースに登録されている日本人44人分のSNPs結果を用いてMS1周辺の連鎖不平衡(LD)ブロックを確認し、MS1を含むLDブロック及び両隣のブロック内のTag SNPsを用いた解析を行なった(患者群190名、対照群190名)。その結果、33SNPsが有意差に至り、その中の19SNPsは、HLA-DRB1*1501ヘテロ接合体を用いた解析においても有意差に至った(患者群143名、対照群103名)。これら19SNPsについて最大尤度推定値分析を行なったところ、SNP5とSNP15を持つときに最大尤度を示した(P<0.05)。

The purpose of this study was to explore new susceptibility and resistance factors for sleep disorders. Last year, about 23,000 candidates were selected for the first time and the second time. This year, the analysis of the peripheral edge of the candidate (MS1) was advanced in the vicinity of the upstream of the leukocyte antigen (HLA) domain (6p21.3). The number of patients identified was 231, and the number of patients identified was 420. The results of statistical analysis of the direct method of identification of each class are as follows: MS1 has 13 classes and 3 classes, and MS1 has 13 classes and 3 classes. The association analysis was performed on 112 patients in the HLA-DRB1*1501 group and 170 patients in the HLA-DRB1*1501 group. As a result, the number of pairs of objects has decreased, and the output has decreased. In addition, HapMap database entry was performed on 44 Japanese subjects, and linkage disequilibrium (LD) analysis was performed on MS1 with LD and LD markers (190 patients and 190 controls). The results showed that 33SNPs were intentionally different from each other, and 19SNPs were intentionally different from each other (143 patients and 103 controls). SNPs 5 and SNP15 had the highest predictive value (P<0.05).