睡眠障害の発症および病態に関与する遺伝要因の探索
睡眠障害の発症および病態に関与する遺伝要因の探索
批准号:
19790245
负责人:
川嶋 実苗
金额:
$2.3万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
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本研究の目的は、ヒトナルコレプシーをはじめとする睡眠障害の新たな感受性・抵抗性遺伝子を見出すことである。昨年度までに約2万3000個のマイクロサテライトマーカーを用いたゲノムワイドな関連解析(1次・2次スクリーニング)を行ない、いくつかの候補マーカーを見出している。それら候補マーカーのうち、6番染色体上に存在するマーカー(候補領域)周辺領域について、詳細に解析を進めた結果、ナルコレプシー関連領域を絞り込むことに成功した。本年度は、昨年度絞り込みに成功した候補領域の中には既知の遺伝子が3個、予測遺伝子が1個存在した。そのため、それら遺伝子のプロモーター領域、exon・intron領域に存在する多型を全て検出するため、データベース上に登録された塩基配列を元に特異的なプライマーを設定し、多型解析を行なった(DNAシークエンサーABI PRISM 3730: Applied Biosystems)。そして、検出された全ての多型を用いた関連解析を行なった(患者群190名、対照群190名、有意差の検定はFisherの直接検定法により行なった)。また、それらの多型の中で、ナルコレプシーとの関連を示した19個の多型に関しては(p<0.01)、使用可能な全検体(患者群370名、対照群620名)を用いた関連解析も行なった。Permutaion testの結果、4個のSNPsがp<0.001と、ナルコレプシーとの強い関連を示した。同時にそれらの多型が他集団の同疾患とも関連があるか、白人集団(患者群190名、対照群190名)および黒人集団(患者群100名、対照群100名)、韓国人集団(患者群100名、対照群100名)を用いた関連解析も実施した。
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6番染色体上HLA領域近傍に位置するヒトナルコレプシー候補領域の高密度解析
位于 6 号染色体 HLA 区域附近的人类嗜睡病候选区域的高密度分析
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[沼澤香穂里, 川嶋実苗]
通讯作者:
川嶋実苗
ゲノムワイド関連解析によるヒトナルコレプシー疾患感受性候補領域の探索
通过全基因组关联分析寻找人类发作性睡病易感候选区域
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[宮川卓, 川嶋実苗]
通讯作者:
川嶋実苗
Analysis of a Candidate region on chromosome 6 detected by genome-wide association study for human narcolepsy
人类发作性睡病全基因组关联研究检测到的 6 号染色体候选区域的分析
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[沼澤香穂里, 川嶋実苗, Minae Kawashima]
通讯作者:
Minae Kawashima
Genome-wide association study of human narcolepsy using 500,000 SNPs
使用 500,000 个 SNP 对人类发作性睡病进行全基因组关联研究
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Taku Miyagawa, Minae Kawashima]
通讯作者:
Minae Kawashima
ヒトナルコレプシー及び睡眠障害感受性遺伝子の探索
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批准号:17790224
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2005
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负责人:川嶋 実苗
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依托单位:
ゲノムワイドな関連分析による多因子疾患の感受性遺伝子の探索
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批准号:03J61514
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2003
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负责人:川嶋 実苗
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依托单位:
海外基金