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ラット口腔扁平上皮癌においてjunBにより転写が活性化される遺伝子の検索

寻找大鼠口腔鳞状细胞癌中junB转录激活的基因

基本信息

批准号：
17791342
负责人：
平山喜一
金额：
$ 2.18万
依托单位：
Kagoshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

われわれは、発癌剤4NQOにより誘発されるラット古癌の発生に関連する5つの遺伝子座をQTL解析によりラットゲノム上にマッピングしている。その中で最も関連度の高い遺伝子座TSCC1における舌癌関連遺伝子の候補としてjunB遺伝子を見出した。junBはjun遺伝子ファミリーに属し、転写因子AP-1の構成要素であるJunB蛋白をコードしており、様々な癌で発現が亢進していることが示されている。そこで本研究は、クロマチン免疫沈降法を用いてJunB蛋白と共沈するDNA断片を解析してJunBの新規の転写ターゲット遺伝子を同定することを目的とする。クロマチン免疫沈降法は実験条件が大きく結果に影響するため、試薬の検討をはじめとして至適条件の検討を繰り返してきた。4NQO誘発ラット舌癌細胞株を使い抗JunB抗体を用いてクロマチン免疫沈降を行い、JunB蛋白と親和性のあると予測される1000個以上のDAN断片を回収した。現在、順次DNA断片の塩基配列の決定作業を行いつつ、その配列をもとにラットゲノムデータベースで遺伝子の検索を行っているが、遺伝子にヒットしていない。その理由の1つとして、ラットゲノムデータベース上にマップされる既知の遺伝子数がヒトなどのゲノムデータベースに比べて少ないことに由来すると思われる。今後解析数を増やすことによって、既知の遺伝子で、これまでJunBの転写ターゲット遺伝子として知られていなかった新たなJunBの転写ターゲットとしての既知遺伝子がヒットしてくるものと思われる。本来の目的であるJunBの新規転写ターゲット遺伝子の検索についても、DNAサンプルの解析数を最大限に増やし、ESTデータベースの利用により検索可能であると考えられる。

QTL analysis at 5 loci for the four NQOs involved in cancer development TSCC1 is the most closely related gene and the candidate for junB is the most closely related gene. JunB protein is a component of jun gene expression, and it is a component of AP-1. The aim of this study is to analyze DNA fragments by immunoprecipitation and to determine the identity of JunB proteins. The immune sedimentation method is used to test the effect of the condition on the immune system. 4 NQO-induced anti-JunB antibodies were used to immunize the tongue cancer cell line. The affinity of JunB protein was estimated to be more than 1000 DAN fragments. Now, the sequence of DNA fragment gene alignment determination work in the middle of the process, the sequence of DNA fragment alignment in the middle of the process, the sequence of DNA fragment alignment in the middle of the process. The reason for this is that the number of known genes is less than that of the original gene. In the future, we will analyze the data of the known heritage and the new heritage of JunB. The original purpose of the new regulation is to increase the maximum number of DNA fragments in the detection of DNA fragments, and to increase the possibility of detection of EST fragments.