深海における真核性微生物(原生生物)の多様性解析

深海真核微生物（原生生物）多样性分析

• 批准号: 17770077
• 负责人: 瀧下 清貴
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17770077/
• 关键词: 原生生物; 真核生物; 多様性; 深海; 化学合成生態系; 分子系統解析

真核生物のグループの一つであるイクチオスポラに属するPseudoperkinsus tapetisと命名された原生生物は,スペイン北西部ガリシア地方の食用アサリから初めて分離された。本研究において,鹿児島県野間岬沖の水深約200mから回収された鯨骨に付着した2枚貝ヒラノマクラのエラ組織より真核微生物を分離し,核コードのSSU rRNA遺伝子の塩基配列情報に基づいて,それをP.tapetisとして同定した。スペイン産および本研究によって発見された日本産のP.tapetisのSSU rRNA遺伝子(1751b.p.)の配列を比較したところ,1塩基の置換と1塩基のindelが見いだされたのみで,ほとんど違いはなかった。一方,SSU rRNA遺伝子より進化速度の速いITS-rDNAを比較したところ,ITS1領域で10塩基,ITS2領域で8塩基の置換が認められ,スペイン株と日本株は集団レベルで遺伝的に異なっていることが示された。今回の結果から,P.tapetisは世界中に存在し,様々な2枚貝に寄生することが可能であることが示唆された。さらに、ITS-rDNA領域の塩基配列情報を用いて,宿主からP.tapetis細胞を特異的に検出するPCR法も確立した。この特異的PCR検出法によって、水槽中で飼育されたヒラノマクラにもP.tapetisが存在することが明らかとなった。上記の通り,P.tapetisは2枚貝の寄生虫である可能性が高く,その生態学的な知見を得ることは重要である。本研究において確立された検出方法はP.tapetisの生態学的研究における強力なツールとして利用出来るものと考える。

Eukaryotes の グ ル ー プ の a つ で あ る イ ク チ オ ス ポ ラ に genus す る Pseudoperkinsus tapetis と named さ れ た protists は, ス ペ イ ン north west ガ リ シ ア places の ア サ リ か ら early め て separation さ れ た. This study に お い て, deer island where 県 wild between cape の water depth of about 200 m か ら back 収 さ れ た whalebone に pay the し た two bei ヒ ラ ノ マ ク ラ の エ ラ organization よ り eukaryotic microorganism separation を し, nuclear コ ー ド の SSU rRNA heritage 伝 son の salt base with column intelligence に base づ い て, そ れ を P.t apetis と し て with fixed し た. ス ペ イ ン production お よ び this study に よ っ て 発 see さ れ た Japanese の P.t apetis の SSU rRNA heritage 伝 child (1751 b. p.) の match column を compare し た と こ ろ, salt base の replacement と 1 salt base の indel が see い だ さ れ た の み で, ほ と ん ど violations い は な か っ た. Son, SSU rRNA heritage 伝 よ り evolution speed の speed い - rDNA ITS を compare し た と こ ろ, ITS1 field で 10 salt base, ITS2 field で 8 salt base の replacement が recognize め ら れ, ス ペ イ ン seedlings は と Japan set 団 レ ベ ル で but 伝 に different な っ て い る こ と が shown さ れ た. Today back の results か ら, P.t apetis し に は world, others 々 な two bei に parasitic す る こ と が may で あ る こ と が in stopping さ れ た. さ ら に, ITS - rDNA の salt base matched with column intelligence を い て, host か ら P.t apetis cells を specific に 検 out す も る PCR method established し た. こ の 検 out specific PCR method に よ っ て in the flume, で rearing さ れ た ヒ ラ ノ マ ク ラ に も P.t apetis が exist す る こ と が Ming ら か と な っ た. Written の り, P.t apetis は two bei の parasites で あ likely が る く, そ の ecology な knowledge を must る こ と は important で あ る. This study に お い て establish さ れ た 検 out method は P.t apetis の ecology research に お け る powerful な ツ ー ル と し て use out る も の と exam え る.

项目成果

A transcriptional fusion of genes encoding glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) and enolase in dinoflagellates

甲藻中编码甘油醛-3-磷酸脱氢酶 (GAPDH) 和烯醇酶的基因的转录融合

• 发表时间: 2005
• 期刊: Journal of Eukaryotic Microbiology 52・4
• 作者: James Reimer;Kiyotaka Takishita;Tadashi Maruyama;Kiyotaka Takishita;Yoshiaki Takahashi;Kazuhiko Koike;Kiyotaka Takishita
• 通讯作者: Kiyotaka Takishita

Assessing the monophyly of chlorophyll-c containing plastids by multi-gene phylogenies under the unlinked model condition

在未连锁模型条件下通过多基因系统发育评估含叶绿素-c 的质体的单系性

• 发表时间: 2007
• 期刊: Molecular Phylogenetics and Evolution 45
• 作者: 赤嶺 伊都子;新城 正紀;宇座 美代子;Kiyotaka Takishita;Kiyotaka Takishita;Kei Iida
• 通讯作者: Kei Iida

Genetic diversity of microbial eukaryotes in anoxic sediment around fumaroles on a submarine caldera floor based on the small-subunit rDNA phylogeny

• DOI: 10.1007/s00792-005-0432-9
• 发表时间: 2005-03
• 期刊: Extremophiles
• 影响因子: 2.9
• 作者: K. Takishita;H. Miyake;M. Kawato;T. Maruyama

Non-seasonal Glade-specificity and subclade microvariation in symbiotic dinoflagellates (Symbiodinium spp.) in Zoanthus sansibaricus (Anthozoa : Hexacorallia) at Kagoshima Bay, Japan

日本鹿儿岛湾 Zoanthus sansibaricus（Anthozoa：Hexacorallia）共生甲藻（Symbiodinium spp.）的非季节性林间空地特异性和支系微变异

• 发表时间: 2007
• 期刊: Phycological Research 55・1
• 作者: James Reimer;Shusuke Ono;Junzo Tsukahara;Kiyotaka Takishita;Tadashi Maruyama
• 通讯作者: Tadashi Maruyama

Molecular evidence suggesting species in the zoanthid genera Palythoa and Protopalythoa (Anthozoa : Hexacorallia) are congeneric

分子证据表明，Palythoa 属和 Protopalythoa 属的物种（Anthozoa：Hexacorallia）是同属的

• 发表时间: 2006
• 期刊: Zoological Science 23・1
• 作者: Fan;J.;K.N.Watanabe;James Davis Reimer;James Davis Reimer;James Davis Reimer;James Davis Reimer
• 通讯作者: James Davis Reimer