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核酸のインターナルダイナミクスを鋭敏に捕えるスピンラベル化核酸の開発と応用

灵敏捕获核酸内部动态的自旋标记核酸的开发和应用

基本信息

批准号：
18550152
负责人：
麻生真理子
金额：
$ 2.64万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18550152/
关键词：
スピンラベル ESR DNA ダイナミクス

项目摘要

・N-tert-ブチルアミノキシル基を2位導入した2'-デオキシアデノシン誘導体1を導入したオリゴデオキシヌクレオチド(ODN)15-mer及び18-merの合成を行い、一本鎖、二重鎖のESRスペクトルを測定した。運動性の評価には2Azz値、低磁場側及び中央ピークの高さの比(h+/h_0値)で評価した。一本鎖から二重鎖による構造変化で、2Azz値:の増加、h+/h_0値の減少が見られ、15-mer及び18-merとも運動性の低下が評価できた。また25度と10度では一本鎖では2Azz値、h+/h_0値が同じであったのに対し、二重鎖の場合、2Azz値、h+/h_0値が異なり、温度が運動性により大きな影響を与えていることが示唆された。・化合物1と2つの水素結合形成可能なTをマッチ、A、C、Gをミスマッチとし、1を導入した15-merの二重鎖を用いて、ミスマッチがESRスペクトルに与える影響を検討した。測定は10、25、40、及び50度で行った。25度で測定したスペクトルのピーク高さはTm値から予想される二重鎖の安定性と相関を示した。・DNA二重鎖の一本鎖開裂のモデルとして、ATを含む領域にミスマッチを1つ、2つ、3つ含む二重鎖のESRを様々な温度で測定した。ミスマッチが多いほどピーク高さが大きくなり、二重鎖の運動性が大きいことを示した。いずれの場合も温度上昇に伴う自由度の上昇が確認された。この結果から、DNA二重鎖の一本鎖開裂をモニターできる可能性が示された。

·N-tert-block chain with 2-bit introduction of 2'-block chain with 1-bit introduction of 15-mer and 18-mer synthesis of ODN and ESR with 1-bit and 2-bit chain. The mobility evaluation is based on the 2Azz value, the low magnetic field side and the high ratio (h+/h_0 value) of the center. The structure of a lock is changed, the value of 2Azz is increased, the value of h+/h_0 is decreased, and the mobility is decreased. 25 ° C to 10 ° C to reverse a lock, 2Azz to reverse, h+/h_0 to reverse, double lock to reverse, 2Azz to reverse, h+/h_0 to reverse, temperature to reverse, kinematic to reverse. Compound 1 and compound 2 may combine to form A 15-mer double-lock system. Measure 10, 25, 40, and 50 degrees. 25 ° C measurement of the stability of the double lock DNA double lock cracking and AT containing domain 1, 2, 3 ESR containing double lock The double lock has a high mobility. In this case, the temperature rise is accompanied by an increase in the degree of freedom. These results show that it is possible for one of the DNA double locks to crack.