Array-based CGH法を用いた口腔扁平上皮癌のゲノム解析

使用基于阵列的 CGH 方法对口腔鳞状细胞癌进行基因组分析

• 批准号: 18791499
• 负责人: 内田 堅一郎
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: Yamaguchi University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18791499/
• 关键词: 癌; ゲノム; 病理; マイクロアレイ

前年度にArray-based CGH法により得られた口腔扁平上皮癌のDNAコピー数異常の解析結果と,既に我々が有する細胞株の解析結果を統合し、口腔扁平上皮癌で高頻度に異常が生じる新規染色体領域の同定を行った。その結果,16pl3領域に口腔扁平上肺癌では高頻度にコピー数の増加が生じることが判明した.口腔扁平上皮癌の臨床材料から塗抹標本を作成し,FISH法で確認を行い同様の結果が得られた.臨床データとArray-based CGH法の解析結果の関連に関しても検討した.18 p 23領域のコピー数減少が頚部リンパ節転移と統計学的に有意に相関することを確認した.口腔扁平上肺癌の臨床材料から塗抹標本を作成し,FISH法で確認を行い転移症例で同様の結果が得られた.口腔扁平上皮癌細胞株からRNAを抽出し,7300リアルタイムPCRシステム(Applied Biosystems社)を用いて18p23領域に位置するNFATcl遺伝子のm-RNAの発現レベルとDNAコピー数異常の関係を検討した。同領域のコピー数減少を認める細胞株では,NFATcl遺伝子の発現低下を認めた.さらに臨床材料パラフィンブロックで,免疫染色による検討も試みたが,われわれが用いたモノクロなール抗体では,口腔扁平上皮癌のみならず正常口腔粘膜でも染色されなかった.

In the previous year, Array-based CGH method was used to analyze the number of DNA abnormalities in oral squamous cell carcinoma. The analysis results of cell lines were integrated, and the frequency of abnormal DNA in oral squamous cell carcinoma was high. Results: 16pl3 area oral flat lung cancer is high frequency, increase in the number of cases. The clinical materials of oral squamous cell carcinoma were prepared by smearing, and the FISH method was used to confirm the same results. The correlation between analytical results of clinical and Array-based CGH methods is discussed. 18 p 23 domain number reduction, partial shift and statistical correlation are confirmed. Clinical materials of squamous cell carcinoma of the oral cavity were prepared by smear method, and FISH method was used to confirm the diagnosis of transitional cases. To investigate the relationship between mRNA expression and DNA gene abnormalities in oral squamous cell carcinoma cell lines by PCR system (Applied Biosystems) using the 18p23 domain of NFATcl gene. The number of cells in the same field decreased, and the expression of NFATcl gene decreased. Clinical materials, immunostaining, immunostaining.

项目成果

Significance of cycline E and p27 expression in malignant ovarian germ cell tumors : correlation with the cell proliferation activity and clinicopatologic features

卵巢恶性生殖细胞肿瘤中cycline E和p27表达的意义：与细胞增殖活性和临床病理特征的相关性

• 发表时间: 2006
• 期刊: Oncology Reports 16巻・5号
• 作者: Mori D;et. al.;Fukatsu T.;Itasaka S.;Begum S.;Hyashido Y.;Wu W.;新谷 智章;Tomoko Hashimoto;Kenichito Uchida;Yasuyuki Noutomi;Shigeto Kawauchi
• 通讯作者: Shigeto Kawauchi

Comparative genomic hybridization reveals genetic progression of oral squamous cell carcinoma from dysplasia via two different tumorigenetic pathways

比较基因组杂交揭示口腔鳞状细胞癌从不典型增生通过两种不同的肿瘤发生途径的遗传进展

• 发表时间: 2006
• 期刊: Journal of Pathology 210巻・1号
• 作者: Mori D;et. al.;Fukatsu T.;Itasaka S.;Begum S.;Hyashido Y.;Wu W.;新谷 智章;Tomoko Hashimoto;Kenichito Uchida;Yasuyuki Noutomi
• 通讯作者: Yasuyuki Noutomi

Molecular cytogenetic analysis of oral squamous cell carcinomas by comparative genomic hybridization, spectral karyotyping, and fluorescence in situ hybridization

通过比较基因组杂交、光谱核型分析和荧光原位杂交对口腔鳞状细胞癌进行分子细胞遗传学分析

• 发表时间: 2006
• 期刊: Cancer Genetics and Cytogenetics 167巻・2号
• 作者: Mori D;et. al.;Fukatsu T.;Itasaka S.;Begum S.;Hyashido Y.;Wu W.;新谷 智章;Tomoko Hashimoto;Kenichito Uchida
• 通讯作者: Kenichito Uchida

白板症に生じるDNAコピー数異常に関する検討

白斑DNA拷贝数异常的研究

• 发表时间: 2007
• 作者: Mori D;et. al.;Fukatsu T.;Itasaka S.;Begum S.;Hyashido Y.;Wu W.;新谷 智章;Tomoko Hashimoto;Kenichito Uchida;Yasuyuki Noutomi;Shigeto Kawauchi;内田堅一郎;内田堅一郎;内田堅一郎
• 通讯作者: 内田堅一郎

SCREENING OF DNA COPY NUMBER ALTERATIONS DETECTED IN ORAL SQUA MOUS CELL CARCINOMAS USING ARRAY-BASED CIMPARATIVE GENOMIC HYB RIDTZATION

使用基于阵列的比较基因组 HYB RiDTzation 筛选口腔鳞状细胞癌中检测到的 DNA 拷贝数改变

• 发表时间: 2007
• 作者: Mori D;et. al.;Fukatsu T.;Itasaka S.;Begum S.;Hyashido Y.;Wu W.;新谷 智章;Tomoko Hashimoto;Kenichito Uchida;Yasuyuki Noutomi;Shigeto Kawauchi;内田堅一郎;内田堅一郎;内田堅一郎;Kenichiro Uchida
• 通讯作者: Kenichiro Uchida