ウイルスはどのようにして宿主プランクトンをみわけるか?
ウイルスはどのようにして宿主プランクトンをみわけるか?
批准号:
18880044
负责人:
白井 葉子
金额:
$1.8万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
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英文摘要
本研究課題では、海水中に浮遊するウイルスと宿主プランクトンの相互識別に係る分子機構ならびに宿主特異性等を巡るウイルス株間の多様性を精査し、ウイスルと宿主赤潮藻の生態学的相互関係の解明すに資することを目的とした。Havゲノム上に存在する多数の繰り返し領域を含むVp260様遺伝子全域のPCRによる増幅は困難であった。そこで繰り返しドメインを抽出し、部分的反復配列のPCR増幅を試みた。反復モチーフ毎の塩基配列のバリエーションを踏まえデジェネレートプライマーを作製し、PCRを実施したところ、1-3反復配列(ラダー状バンド)を増幅・検出することができた。PCRを行う際にホルムアミドを添加し繰り返し分子の高次構造が解消することで、増幅に有効に作用したものと推測された。これらの産物をライゲートしたプラスミドを発現解析に供したが、通常の大腸菌およびレアコドンのtRNAを補充した発現用大腸菌を用いた発現系のいずれにおいても、(沈澱・上清画分のいずれにも)目的タンパク質の発現はみられなかった。今後、昆虫細胞や無細胞系の利用を考える必要があると思われる。HaVを接種した場合でも見かけ上 顕著な増殖阻害がみられない宿主倍養について、細包内でのウイルス感染が成立しているかどうかを、ノーザンハイブリダイゼーション法により精査した。その結果、弱毒性反応区においてもウイルス感染陽性反応が認められた。今後、宿主表面へのウイルスの非特異的吸着の可能性を完全に排除する実験系を組むことができれば、高感度でのウイルス感染判定を実現することが可能であると考えられた。この結果から、HaV株と宿主ヘテロカプサ株の組み合わせによって、溶藻の程度は大きく異なり、光学顕微鏡観察では感染を検出できない場合があることが明らかとなった。これにより、ウイルス対宿主の生態学的関係を考える上できわめて有用な情報を得ることができた。
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赤潮原因藻ヘテロカプサと同種感染性プラス鎖RNAウイルスHcRNAVの複雑な相互関係.
引起赤潮的藻类 Heterocapsa 与同源感染性正链 RNA 病毒 HcRNAV 之间复杂的相互关系。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tomaru, Y., Shirai, Y., Nagasaki, K., 長崎慶三・水本裕之・高尾祥丈・白井葉子・外丸裕司.]
通讯作者:
長崎慶三・水本裕之・高尾祥丈・白井葉子・外丸裕司.
Ecology, physiology and genetics of a phycodnavirus infecting the noxious bloom-forming raphidophyte Heterosigma akashiwo.
藻DNA病毒感染有毒的开花针叶植物Heterosigma akashiwo的生态学、生理学和遗传学。
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
Fisheries Sci. (in press)
影响因子:
--
作者:
[Tomaru, Y., Shirai, Y., Nagasaki, K.]
通讯作者:
K.
海水中の最小生物因子:ウイルス.
海水中最小的生物制剂:病毒。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Nanamori, M., Shinano, T., Wasaki, J., Yamamura, T., Rao, I.M., Osaki, M., 長崎慶三・外丸裕司・白井葉子・高尾祥丈.]
通讯作者:
長崎慶三・外丸裕司・白井葉子・高尾祥丈.
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