多段階質量分析を用いた細胞骨格蛋白質の翻訳後修飾に関する研究
多段階質量分析を用いた細胞骨格蛋白質の翻訳後修飾に関する研究
批准号:
06J01755
负责人:
新間 秀一
金额:
$1.22万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
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英文摘要
昨年度は生体分子の課しか手法が確立したが,多段階質量分析を用いた構造解析の点ではいくつか問題点も明らかになってきた。その問題点とは,たとえば細胞膜を構成するリン脂質においては脂肪酸の詳細な構造が得られないということであり,蛋白質においては,構成アミノ酸の性質(酸性アミノ酸やプロリン)により配列情報を反映するフラグメントイオンがほとんど得られないということである.これらの問題を克服することを目的とし,大阪大学大学院質量分析グループで開発されたマルチターンタンデム飛行時間型質量分析装置を用いて研究を進めた.マルチターンタンデム飛行時間型質量分析装置では,構造解析を行う際に実験室系で20 keVの衝突エネルギーを得ることが可能であるので,昨年度まで用いていたイオンとラップに代表される低エネルギーCIDとは異なり高エネルギーCIDが可能である.本研究を進めるにあたり,測定対象は細胞膜の構成要素のひとつであるリン脂質およびリン酸化と呼ばれる翻訳後修飾を受けたペプチドとした.高エネルギーCIDでは解離機構が低エネルギーCIDとは大きく異なるため,たとえば今回対象としたリン脂質においては脂肪酸内の二重結合の位置特定が可能であることが確認された.一方,リン酸化においては低エネルギーCIDではリン酸基は容易に脱離されることが知られているが,高エネルギーCIDでは修飾基が脱利されないまま配列情報を得ることが可能であることを確認した.これにより,翻訳後修飾を受けたアミノ酸の位置が容易に特定できるという利点がある.このように,本年度研究を行った高エネルギーCIDを生態組織上の構造解析に積極的に応用することにより,位置情報と構造解析の両方を統合することでより有用なデータを手に入れることが可能になると考えられる.
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DOI:
10.1021/ac071301v
发表时间:
2008-02-01
期刊:
ANALYTICAL CHEMISTRY
影响因子:
7.4
作者:
[Shimma, Shuichi, Sugiura, Yuki, Setou, Mitsutoshi]
通讯作者:
Setou, Mitsutoshi
DOI:
10.1021/ac060974v
发表时间:
2006-12-15
期刊:
ANALYTICAL CHEMISTRY
影响因子:
7.4
作者:
[Sugiura, Yuki, Shimma, Shuichi, Setou, Mitsutoshi]
通讯作者:
Setou, Mitsutoshi
DOI:
10.1002/sia.2389
发表时间:
2006-12
期刊:
Surface and Interface Analysis
影响因子:
1.7
作者:
[S. Shimma;M. Furuta;K. Ichimura;Yoshikazu Yoshida;M. Setou]
通讯作者:
S. Shimma;M. Furuta;K. Ichimura;Yoshikazu Yoshida;M. Setou
High-energy collision-induced dissociation of phosphopeptide using a multi-turn tandem time-of-flight mass spectrometer 'MULTUM-TOF/TOF'
使用多转串联飞行时间质谱仪“MULTUM-TOF/TOF”进行高能碰撞诱导的磷酸肽解离
DOI:
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发表时间:
2008
期刊:
Journal of Mass Spectrometry (In press)
影响因子:
--
作者:
[M.Hirai, S.Kumano, T.-H.Nagai, K.Sudoh, Shimma Shuichi, Shimma Shuichi]
通讯作者:
Shimma Shuichi
マルチターンタンデム飛行時間型質量分析計を用いたリン脂質のチャージリモートフラグメンテーション
使用多转串联飞行时间质谱法对磷脂进行电荷远程裂解
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Journal of the Mass Spectrometry Society of Japan 55
影响因子:
--
作者:
[M.Hirai, S.Kumano, T.-H.Nagai, K.Sudoh, Shimma Shuichi, Shimma Shuichi, 新間秀一]
通讯作者:
新間秀一
共 7 条
質量顕微鏡を用いた脳機能解明に資する酵素組織化学の開発とストレスモデル脳への適用
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批准号:23K26787
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.65万
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财政年份:2024
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负责人:新間 秀一
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依托单位:
Development of enzyme histochemistry for elucidating brain function using mass microscopy and its application to stress model brains
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批准号:23H02094
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.98万
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财政年份:2023
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负责人:新間 秀一
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依托单位: