课题基金 / 基金详情

可変構造型ハードウェアを用いた確率モデル生化学シミュレータの高速化に関する研究

可変構造型ハードウェアを用いた確率モデル生化学シミュレータの高速化に関する研究
利用变结构硬件加速随机模型生化模拟器的研究
批准号：
06J06037
负责人：
吉見 真聡
金额：
$1.79万
依托单位：
Keio University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2006
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2006 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06J06037/
关键词：
リコンフィギャラブルシステムFPGA確率モデル生化学シミュレーション生化学シミュレータ科学技術計算コンピュータアーキテクチャデータ通信網確率モデル生化学シミュレータ専用計算機

项目摘要

项目成果

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2008年度を通して,以下の研究を行った.1.FPGAを用いた確率モデル生化学シミュレータを実装し,評価する研究を通して,中規模のFPGAを用いた場合,近年のマイクロプロセッサ(Core 2 Quad Q6600)と比較して5倍〜10倍のスループットで計算が可能なハードウェアが構成できることを確認した2.類似の研究では実現できなかった大規模な生化学モデルへ対応と,前年度で検討したネットワーク型データ転送網の改善を行い,FPGAのロジック資源に応じた柔軟なハードウェアを構成できるシステムを構築した3.性能評価は,システム生物学で実際に利用されているHeat Shock Responseモデルを用い,実用に即した検討を行った4.これらについて,1件の国際会議に投降し,研究成果の公表を行った.また,情報処理学会論文誌に投稿し掲載された.また1件の国内研究会での発表を行い,研究の充実を図った.今後の研究では,実機を用いた性能評価を通して,実際に生物学者が利用できる計算システムの構築を行う予定である.
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会议论文
FPGAを用いた高スループット確率モデル生化学シミュレータの設計と評価
基于FPGA的高通量随机模型生化模拟器的设计与评估
DOI： --
发表时间： 2008
期刊： 情報処理学会論文誌:コンピューティングシステム 1
影响因子： --
作者： [吉見真聡, 西川由理, 長名保範, 舟橋啓, 広井賀子, 柴田裕一郎, 山田英樹, 北野宏明, 天野英晴]
通讯作者： 天野英晴
FPGAを用いたオンチップネットワーク型確率モデル生化学シミュレータの実装と評価
基于FPGA的片上网络随机模型生化模拟器的实现与评估
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [M. Yoshimi, Y. Nishikawa, Y. Osana, A. Funahashi, N. Hiroi, Y. Shibata, H. Yamada, H. Kitano, H. Amano, 吉見 真聡]
通讯作者： 吉見 真聡
A Framework for lmplementing a Network-Based Stochastic Biochemical Simulator
实现基于网络的随机生化模拟器的框架
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [M. Yoshimi, Y. Nishikawa, Y. Osana, A. Funahashi, N. Hiroi, Y. Shibata, H. Yamada, H. Kitano, H. Amano, 吉見 真聡, 吉見 真聡]
通讯作者： 吉見 真聡
スレッドレベル並列性を活かす科学技術計算用FPGAシステムの提案
提出利用线程级并行性进行科学计算的 FPGA 系统
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [吉見真聡, 西川由理, 長名保範, 舟橋啓, 広井賀子, 柴閏裕一郎, 山田英樹, 北野宏明, 天野英晴]
通讯作者： 天野英晴
共 9 条
    国内基金
    海外基金
    基于FPGA和ARM的高精度智能电力局部放电检测装置开发
    • 批准号：
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2026
    • 负责人：
      王伟炳
    • 依托单位：
      南京工程学院
    基于FPGA的嗅觉系统神经计算芯片及其机器嗅觉应用研究
    • 批准号：
      MS25F030039
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2025
    • 负责人：
      傅均
    • 依托单位：
      浙江工商大学
    基于FPGA的冷媒气体传感器海量数据高速采集处理系统的研发
    基于 FPGA 的超图计算加速器关键技术研究
    • 批准号：
      Q24F020078
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2024
    • 负责人：
      王庆刚
    • 依托单位：
      之江实验室