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コンドロイチン糖鎖ポリメラーゼのX線結晶構造解析

软骨素糖链聚合酶的X射线晶体结构分析

基本信息

批准号：
06J09525
负责人：
大澤拓生
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

コンドロイチンはグルクロン酸(GlcUA)とN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)の2糖繰り返しによって構成される高分子量の糖鎖で、その糖鎖を2種の転移反応によって単独で伸長するのがコンドロイチン糖鎖ポリメラーゼ(K4CP)である。この反応はUDP-GlcUA、 UDP-GalNAc、コンドロイチン糖鎖の3つを基質として触媒される。このような2つの転移活性を持つ糖転移酵素の立体構造はこれまで一例も報告されておらず、その触媒メカニズム、基質特異性に関する原子レベルでの情報は全くない。また、近年、コンドロイチンが再生医療、細胞分化制御工学分野で注目を集めている一方で、それを合成する酵素の重要性も非常に高まっている。このような背景から、K4CPの高次構造をX線結晶構造解析を用いて決定し、触媒反応メカニズムを解明することを研究目的とした。K4CPは大きく2つのドメインから構成されておりそれぞれが、GT-A foldをとっていた。ちょうど二つの糖転移酵素が融合したような構造で、N末端側ドメインにUDP-GalNAcが、C末端側ドメインにUDP-GlcUAが結合していた。それぞれの結合部位にはDXD、 DGS等の配列モチーフが存在し、UDP-sugarおよびMnイオンの認識に重要な働きをしていた。これらの相互作用様式は他の糖転移酵素にみられるものと似ており、各ドメインにおいてGalNAcとGlcUAの転移反応が起こっていると考えられる。また、これら2つの結合部位は互いに正反対に位置し、かつ距離的に大きく離れていることから、K4CPはDNAポリメラーゼなどにみられるようなprocessiveな転移反応ではなく、各ドメインの活性部位間を伸長中の鎖が拡散によって行き来するようなnon-processiveなポリメライゼーションを行っていることが示された。

In the presence of high molecular weight glucose (GlcUA), high molecular weight glucose (GlcUA), high molecular weight glucose (GalNAc), high molecular weight (HMW), high molecular weight (HMW). UDP-GlcUA, UDP-GalNAc, UDP-GalNAc, sugar, sugar and sugar. The translocation activity of carbohydrate transferase was used to make an example of a report, a report, a catalyst, a specific enzyme, an atom, and a complete situation. In recent years, the importance of enzymes in the synthesis of enzymes is very important in the field of regenerative medicine and cellular differentiation. In this paper, the background and the analysis of the X-ray crystal of the high-quality computer system of K4CP were used to determine the results of the computer, and the catalyst was used to understand the purpose of the study. K4CP